More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1382 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1382  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  100 
 
 		 290 aa  584  1e-166  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.663649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1842  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  63.18 
 
 		 255 aa  306  2.0000000000000002e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2656  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  63.95 
 
 		 237 aa  300  1e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3609  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  58.61 
 
 		 263 aa  290  1e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.653883  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2774  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  59.91 
 
 		 241 aa  282  4.0000000000000003e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0726338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1594  SpoU rRNA methylase  40.17 
 
 		 243 aa  159  6e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1137  hypothetical protein  35.74 
 
 		 248 aa  155  7e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.836144 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1375  RNA methyltransferase  42.39 
 
 		 243 aa  153  4e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0566977  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0861  RNA methyltransferase  37.28 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.242897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2433  RNA methyltransferase TrmH, group 1  37.66 
 
 		 231 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0043  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  33.61 
 
 		 235 aa  143  3e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1009  RNA methyltransferase TrmH, group 1  35.81 
 
 		 251 aa  142  6e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.197865  normal  0.0384423 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0768  RNA methyltransferase  35.44 
 
 		 232 aa  138  7.999999999999999e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00615258  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1301  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.76 
 
 		 249 aa  137  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.375594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0071  RNA methyltransferase  35.19 
 
 		 231 aa  132  9e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.17974  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1345  RNA methyltransferase  34.02 
 
 		 234 aa  126  5e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1335  RNA methyltransferase  34.76 
 
 		 234 aa  119  7e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1340  RNA methyltransferase  34.76 
 
 		 254 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.34341  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0618  RNA methyltransferase  34.76 
 
 		 234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.570279  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1102  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36.48 
 
 		 249 aa  116  5e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0245796  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01352  putative tRNA/rRNA methyltransferase (trmH family) protein  35.42 
 
 		 261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0228097  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3629  RNA methyltransferase  36.05 
 
 		 244 aa  115  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0437  RNA methyltransferase  35.74 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.293753  hitchhiker  0.0000675678 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1166  RNA methyltransferase  35.74 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000032697  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1274  RNA methyltransferase  35.74 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000271019  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3033  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.62 
 
 		 241 aa  112  6e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0996868  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1242  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.19 
 
 		 241 aa  112  7.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.626014  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2745  RNA methyltransferase  36.32 
 
 		 243 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00735302  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2753  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.62 
 
 		 244 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0620173  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02424  predicted methyltransferase  36.6 
 
 		 246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.438411  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02388  hypothetical protein  36.6 
 
 		 246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.373948  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1136  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36.6 
 
 		 246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.631773  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2685  RNA methyltransferase  36.6 
 
 		 246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0309108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2907  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36.6 
 
 		 246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000722285  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1145  RNA methyltransferase  36.6 
 
 		 246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0763368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2684  RNA methyltransferase  36.6 
 
 		 246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000664328  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3764  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36.6 
 
 		 245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000603217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2817  RNA methyltransferase  36.6 
 
 		 245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000707701  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2807  RNA methyltransferase  35.9 
 
 		 243 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0201876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2700  RNA methyltransferase  35.9 
 
 		 243 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000906061  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2786  RNA methyltransferase  35.9 
 
 		 243 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000395932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1816  RNA methyltransferase  34.35 
 
 		 241 aa  109  5e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00001341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2283  RNA methyltransferase  34.35 
 
 		 241 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000130955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1736  RNA methyltransferase  34.35 
 
 		 241 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000887935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2400  RNA methyltransferase  34.2 
 
 		 242 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000262197  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2920  RNA methyltransferase  35.47 
 
 		 243 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0175386  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2261  RNA methyltransferase  33.48 
 
 		 241 aa  108  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1958  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.2 
 
 		 242 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000144903  hitchhiker  0.00948062 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2389  RNA methyltransferase  34.2 
 
 		 242 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000450659  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2427  RNA methyltransferase  33.2 
 
 		 240 aa  108  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2505  RNA methyltransferase  34.2 
 
 		 242 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000223047  normal  0.027536 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3875  RNA methyltransferase  32.92 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.250027  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3029  RNA methyltransferase  35.9 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00120237  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4224  TrmA family RNA methyltransferase  33.05 
 
 		 245 aa  104  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1455  RNA methyltransferase TrmH, group 1  32.42 
 
 		 259 aa  105  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000119002  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2320  RNA methyltransferase  34.02 
 
 		 252 aa  102  6e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000515226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1407  RNA methyltransferase TrmH, group 1  37.07 
 
 		 243 aa  102  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2152  RNA methyltransferase  35.47 
 
 		 241 aa  101  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0159142  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1235  RNA methyltransferase  36.8 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.207917  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2161  RNA methyltransferase TrmH, group 1  36.21 
 
 		 246 aa  100  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00198375  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1161  RNA methyltransferase TrmH, group 1  33.33 
 
 		 256 aa  100  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000875813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1411  RNA methyltransferase  32.81 
 
 		 267 aa  98.6  9e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.993978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1485  RNA methyltransferase  32.92 
 
 		 254 aa  98.6  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0403715  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2187  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  33.46 
 
 		 271 aa  97.4  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2076  RNA methyltransferase  33.19 
 
 		 260 aa  97.8  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.780076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5993  RNA methyltransferase TrmH, group 1  33.1 
 
 		 289 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2084  RNA methyltransferase  33.1 
 
 		 289 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00462385  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1290  RNA methyltransferase  35.19 
 
 		 240 aa  97.4  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0442169  normal  0.0143019 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1950  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  30.64 
 
 		 276 aa  97.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.168874  normal  0.372622 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2874  RNA methyltransferase  32 
 
 		 254 aa  96.3  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.718962  hitchhiker  0.0000000232974 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0828  RNA methyltransferase  32.39 
 
 		 275 aa  96.3  5e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.151565  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0545  RNA methyltransferase  31.22 
 
 		 257 aa  96.3  6e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0670  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36.64 
 
 		 256 aa  95.5  9e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.373785  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0819  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36.64 
 
 		 256 aa  95.5  9e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0412147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0492  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  30.64 
 
 		 253 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0231  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.09 
 
 		 235 aa  94.7  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1196  RNA methyltransferase  32.91 
 
 		 276 aa  94.7  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1949  RNA methyltransferase TrmH, group 1  33.33 
 
 		 243 aa  94  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2161  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  30.17 
 
 		 276 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0486585  normal  0.265451 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1158  RNA methyltransferase  32.91 
 
 		 291 aa  94.7  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.357934  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2103  RNA methyltransferase  31.79 
 
 		 289 aa  93.6  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.247201 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1711  hypothetical protein  33.06 
 
 		 257 aa  93.6  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1995  RNA methyltransferase  32.68 
 
 		 281 aa  93.6  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.720646  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1773  RNA methyltransferase  31.87 
 
 		 254 aa  94  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.12594  hitchhiker  0.00165952 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2062  tRNA/rRNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.55 
 
 		 247 aa  93.6  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.260682  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1711  hypothetical protein  33.06 
 
 		 257 aa  93.2  4e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08981  tRNA/rRNA methyltransferase  33.86 
 
 		 249 aa  92.8  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.723919 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1915  tRNA/rRNA methyltransferase  31.49 
 
 		 286 aa  93.2  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0812  RNA methyltransferase TrmH, group 1  33.77 
 
 		 251 aa  92.4  7e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000476063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3506  RNA methyltransferase  33.33 
 
 		 240 aa  92.4  7e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.899672 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5766  RNA methyltransferase  30.12 
 
 		 261 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4953  putative RNA methyltransferase  36.48 
 
 		 228 aa  92  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.396739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1197  RNA methyltransferase  32.92 
 
 		 289 aa  91.7  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0280134 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3595  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36.48 
 
 		 228 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3654  putative RNA methyltransferase  35.88 
 
 		 228 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.749587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4951  putative RNA methyltransferase  35.26 
 
 		 228 aa  91.3  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5002  putative RNA methyltransferase  35.88 
 
 		 228 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.985383  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1258  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.03 
 
 		 245 aa  91.3  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00338281  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4639  putative RNA methyltransferase  35.88 
 
 		 228 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0771017  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1148  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  30.38 
 
 		 262 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>