More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1842 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_1842  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  100 
 
 		 255 aa  511  1e-144  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3609  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  88.98 
 
 		 263 aa  446  1.0000000000000001e-124  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.653883  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2774  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  64.96 
 
 		 241 aa  311  6.999999999999999e-84  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0726338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1382  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  65.02 
 
 		 290 aa  297  1e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.663649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2656  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  61.54 
 
 		 237 aa  296  2e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1375  RNA methyltransferase  43.8 
 
 		 243 aa  177  2e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0566977  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1594  SpoU rRNA methylase  40.76 
 
 		 243 aa  161  9e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1137  hypothetical protein  38.79 
 
 		 248 aa  156  3e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.836144 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0043  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  37.29 
 
 		 235 aa  156  3e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0861  RNA methyltransferase  40.87 
 
 		 261 aa  156  4e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.242897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0768  RNA methyltransferase  40.25 
 
 		 232 aa  154  2e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00615258  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2433  RNA methyltransferase TrmH, group 1  38.3 
 
 		 231 aa  152  4e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1009  RNA methyltransferase TrmH, group 1  37.18 
 
 		 251 aa  148  9e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.197865  normal  0.0384423 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1301  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36.52 
 
 		 249 aa  141  9e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.375594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1242  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  37.45 
 
 		 241 aa  118  7.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.626014  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3033  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  37.45 
 
 		 241 aa  117  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0996868  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02424  predicted methyltransferase  36.82 
 
 		 246 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.438411  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1136  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36.82 
 
 		 246 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.631773  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2685  RNA methyltransferase  36.82 
 
 		 246 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0309108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02388  hypothetical protein  36.82 
 
 		 246 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.373948  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2684  RNA methyltransferase  36.82 
 
 		 246 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000664328  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1145  RNA methyltransferase  36.82 
 
 		 246 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0763368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2907  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36.82 
 
 		 246 aa  115  8.999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000722285  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3764  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36.82 
 
 		 245 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000603217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1166  RNA methyltransferase  35.74 
 
 		 257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000032697  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1816  RNA methyltransferase  34.75 
 
 		 241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00001341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0437  RNA methyltransferase  35.74 
 
 		 257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.293753  hitchhiker  0.0000675678 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2817  RNA methyltransferase  36.82 
 
 		 245 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000707701  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1485  RNA methyltransferase  34.57 
 
 		 254 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0403715  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2283  RNA methyltransferase  34.75 
 
 		 241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000130955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1335  RNA methyltransferase  31.9 
 
 		 234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1274  RNA methyltransferase  35.74 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000271019  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1736  RNA methyltransferase  34.75 
 
 		 241 aa  113  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000887935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0618  RNA methyltransferase  31.76 
 
 		 234 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.570279  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2753  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.44 
 
 		 244 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0620173  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3629  RNA methyltransferase  36.17 
 
 		 244 aa  113  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1102  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.66 
 
 		 249 aa  112  5e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0245796  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1345  RNA methyltransferase  29.49 
 
 		 234 aa  112  5e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1340  RNA methyltransferase  30.33 
 
 		 254 aa  112  5e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.34341  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2152  RNA methyltransferase  34.57 
 
 		 241 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0159142  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2427  RNA methyltransferase  34.75 
 
 		 240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2745  RNA methyltransferase  35.98 
 
 		 243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00735302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1455  RNA methyltransferase TrmH, group 1  36.22 
 
 		 259 aa  110  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000119002  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01352  putative tRNA/rRNA methyltransferase (trmH family) protein  37.39 
 
 		 261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0228097  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0071  RNA methyltransferase  31.12 
 
 		 231 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.17974  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2389  RNA methyltransferase  34.6 
 
 		 242 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000450659  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2505  RNA methyltransferase  34.6 
 
 		 242 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000223047  normal  0.027536 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1958  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.6 
 
 		 242 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000144903  hitchhiker  0.00948062 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2700  RNA methyltransferase  35.56 
 
 		 243 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000906061  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2807  RNA methyltransferase  35.56 
 
 		 243 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0201876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1578  RNA methyltransferase  36.75 
 
 		 263 aa  108  6e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.373161  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2261  RNA methyltransferase  33.9 
 
 		 241 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4615  RNA methyltransferase TrmH, group 1  35.02 
 
 		 264 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00452302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2786  RNA methyltransferase  35.32 
 
 		 243 aa  108  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000395932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2400  RNA methyltransferase  34.6 
 
 		 242 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000262197  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2920  RNA methyltransferase  35.15 
 
 		 243 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0175386  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1711  hypothetical protein  34.02 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1258  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36.67 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00338281  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2687  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.47 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.491891  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3029  RNA methyltransferase  35.1 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00120237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1290  RNA methyltransferase  35.59 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0442169  normal  0.0143019 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1711  hypothetical protein  34.02 
 
 		 257 aa  106  3e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1635  tRNA/rRNA methyltransferase  36.75 
 
 		 263 aa  106  4e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2030  RNA methyltransferase  37.07 
 
 		 245 aa  106  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.433712  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2320  RNA methyltransferase  35.22 
 
 		 252 aa  106  5e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000515226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1279  RNA methyltransferase  35.93 
 
 		 240 aa  105  6e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1773  RNA methyltransferase  32.5 
 
 		 254 aa  105  8e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.12594  hitchhiker  0.00165952 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0839  RNA methyltransferase  37.19 
 
 		 251 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.742035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40430  RNA methyltransferase TrmH, group 1  35.68 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.573027  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0279  tRNA/rRNA methyltransferase  31.43 
 
 		 246 aa  103  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1552  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.84 
 
 		 245 aa  104  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000140105 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2874  RNA methyltransferase  32.08 
 
 		 254 aa  103  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.718962  hitchhiker  0.0000000232974 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0882  RNA methyltransferase  36.51 
 
 		 251 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00955273 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0869  RNA methyltransferase  37.19 
 
 		 279 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164985  normal  0.267349 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4339  RNA methyltransferase  36.82 
 
 		 251 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000160755 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2161  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  32.2 
 
 		 276 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0486585  normal  0.265451 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1296  putative methyltransferase  36.63 
 
 		 308 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004362  tRNA:Cm32/Um32 methyltransferase  34.47 
 
 		 239 aa  102  6e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00237949  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2076  RNA methyltransferase  34.84 
 
 		 260 aa  102  7e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.780076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2846  RNA methyltransferase TrmH, group 1  34.45 
 
 		 274 aa  102  7e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1995  RNA methyltransferase  31.49 
 
 		 281 aa  102  8e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.720646  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1230  rRNA methylase, SpoU family  35.5 
 
 		 240 aa  102  8e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.420687  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1950  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  30.9 
 
 		 276 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.168874  normal  0.372622 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1235  RNA methyltransferase  35.06 
 
 		 241 aa  101  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.207917  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5766  RNA methyltransferase  30.96 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5390  RNA methyltransferase TrmH, group 1  33.33 
 
 		 289 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1420  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.66 
 
 		 257 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3514  RNA methyltransferase  35.68 
 
 		 262 aa  100  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2161  RNA methyltransferase TrmH, group 1  36.02 
 
 		 246 aa  99.8  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00198375  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14690  putative methyltransferase  35.8 
 
 		 257 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01053  rRNA methylase  32.48 
 
 		 239 aa  99  6e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1369  RNA methyltransferase TrmH, group 1  34.17 
 
 		 248 aa  99  7e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000282911  hitchhiker  0.0000077591 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1268  RNA methyltransferase  33.76 
 
 		 262 aa  98.6  8e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.681367  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5993  RNA methyltransferase TrmH, group 1  33.33 
 
 		 289 aa  98.6  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2084  RNA methyltransferase  33.33 
 
 		 289 aa  98.6  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00462385  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4224  TrmA family RNA methyltransferase  34.3 
 
 		 245 aa  98.2  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4813  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  31.58 
 
 		 248 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.695937  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1161  RNA methyltransferase TrmH, group 1  34.04 
 
 		 256 aa  97.4  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000875813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3522  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.61 
 
 		 266 aa  97.4  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.391338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0812  RNA methyltransferase TrmH, group 1  34.17 
 
 		 251 aa  97.4  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000476063  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>