More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2774 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2774  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  100 
 
 		 241 aa  487  1e-137  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0726338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2656  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  70.04 
 
 		 237 aa  351  5e-96  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1842  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  64.96 
 
 		 255 aa  311  5.999999999999999e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3609  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  59.83 
 
 		 263 aa  295  5e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.653883  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1382  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  60 
 
 		 290 aa  276  2e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.663649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0768  RNA methyltransferase  35.54 
 
 		 232 aa  154  1e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00615258  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2433  RNA methyltransferase TrmH, group 1  35.86 
 
 		 231 aa  152  5e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1301  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  37.24 
 
 		 249 aa  150  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.375594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1594  SpoU rRNA methylase  35.42 
 
 		 243 aa  150  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1009  RNA methyltransferase TrmH, group 1  34.31 
 
 		 251 aa  149  3e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.197865  normal  0.0384423 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0861  RNA methyltransferase  36.48 
 
 		 261 aa  148  6e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.242897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1137  hypothetical protein  34.73 
 
 		 248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.836144 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0043  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.06 
 
 		 235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1375  RNA methyltransferase  36.84 
 
 		 243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0566977  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0071  RNA methyltransferase  31.58 
 
 		 231 aa  122  7e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.17974  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0618  RNA methyltransferase  33.91 
 
 		 234 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.570279  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1345  RNA methyltransferase  31.6 
 
 		 234 aa  119  6e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1340  RNA methyltransferase  33.91 
 
 		 254 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.34341  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1335  RNA methyltransferase  33.04 
 
 		 234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2745  RNA methyltransferase  31.6 
 
 		 243 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00735302  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3033  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  32.41 
 
 		 241 aa  112  6e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0996868  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1242  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  32.28 
 
 		 241 aa  111  8.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.626014  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2700  RNA methyltransferase  31.2 
 
 		 243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000906061  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2807  RNA methyltransferase  31.2 
 
 		 243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0201876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2076  RNA methyltransferase  31.84 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.780076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2786  RNA methyltransferase  31.2 
 
 		 243 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000395932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2161  RNA methyltransferase TrmH, group 1  35.66 
 
 		 246 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00198375  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2920  RNA methyltransferase  30.8 
 
 		 243 aa  108  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0175386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2753  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  31.4 
 
 		 244 aa  108  6e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0620173  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4615  RNA methyltransferase TrmH, group 1  32.27 
 
 		 264 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00452302  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02424  predicted methyltransferase  30.4 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.438411  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1136  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  30.4 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.631773  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1485  RNA methyltransferase  32.31 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0403715  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40430  RNA methyltransferase TrmH, group 1  32.93 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.573027  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2907  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  30.4 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000722285  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2817  RNA methyltransferase  30.4 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000707701  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3764  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  30.4 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000603217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3629  RNA methyltransferase  30.86 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02388  hypothetical protein  30.4 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.373948  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2684  RNA methyltransferase  30.4 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000664328  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2685  RNA methyltransferase  30.4 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0309108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1145  RNA methyltransferase  30.4 
 
 		 246 aa  106  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0763368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2320  RNA methyltransferase  32.52 
 
 		 252 aa  106  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000515226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1274  RNA methyltransferase  31.02 
 
 		 257 aa  105  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000271019  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1166  RNA methyltransferase  31.02 
 
 		 257 aa  105  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000032697  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0437  RNA methyltransferase  31.02 
 
 		 257 aa  105  6e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.293753  hitchhiker  0.0000675678 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1816  RNA methyltransferase  30.12 
 
 		 241 aa  105  9e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00001341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3514  RNA methyltransferase  30.38 
 
 		 262 aa  104  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2427  RNA methyltransferase  29.44 
 
 		 240 aa  104  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2283  RNA methyltransferase  30.12 
 
 		 241 aa  104  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000130955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3029  RNA methyltransferase  32.52 
 
 		 244 aa  103  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00120237  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1102  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  29.11 
 
 		 249 aa  103  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0245796  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1736  RNA methyltransferase  30.12 
 
 		 241 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000887935  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1711  hypothetical protein  32.66 
 
 		 257 aa  103  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2261  RNA methyltransferase  28.92 
 
 		 241 aa  102  6e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1711  hypothetical protein  32.66 
 
 		 257 aa  102  6e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0670  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.373785  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1411  RNA methyltransferase  29.55 
 
 		 267 aa  100  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.993978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0819  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0412147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3875  RNA methyltransferase  30.86 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.250027  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004362  tRNA:Cm32/Um32 methyltransferase  30.52 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00237949  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2400  RNA methyltransferase  30.58 
 
 		 242 aa  99.8  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000262197  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1296  putative methyltransferase  32.54 
 
 		 308 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1646  RNA methyltransferase TrmH, group 1  30.86 
 
 		 247 aa  99.4  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3506  RNA methyltransferase  31.85 
 
 		 240 aa  99.4  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.899672 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2399  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  30.04 
 
 		 243 aa  99.4  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1773  RNA methyltransferase  30 
 
 		 254 aa  99.4  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.12594  hitchhiker  0.00165952 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1234  RNA methyltransferase TrmH, group 1  30.65 
 
 		 254 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.600347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2874  RNA methyltransferase  29.96 
 
 		 254 aa  99.4  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.718962  hitchhiker  0.0000000232974 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4339  RNA methyltransferase  30.28 
 
 		 251 aa  99  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000160755 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2349  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  30.04 
 
 		 243 aa  99  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2187  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.04 
 
 		 271 aa  99  6e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01053  rRNA methylase  30.33 
 
 		 239 aa  99  6e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2705  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  33.2 
 
 		 253 aa  99  6e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.29092 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0882  RNA methyltransferase  29.02 
 
 		 251 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00955273 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1297  RNA methyltransferase  33.33 
 
 		 257 aa  98.6  8e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0869  RNA methyltransferase  29.02 
 
 		 279 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164985  normal  0.267349 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0839  RNA methyltransferase  29.02 
 
 		 251 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.742035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2152  RNA methyltransferase  31.2 
 
 		 241 aa  98.2  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0159142  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1517  RNA methyltransferase  31.96 
 
 		 276 aa  97.8  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.9954 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4224  TrmA family RNA methyltransferase  31.47 
 
 		 245 aa  97.8  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1420  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  30.59 
 
 		 257 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1950  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  30 
 
 		 276 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.168874  normal  0.372622 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2030  RNA methyltransferase  33.76 
 
 		 245 aa  97.8  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.433712  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1475  RNA methyltransferase  34.58 
 
 		 255 aa  96.7  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1279  RNA methyltransferase  29.63 
 
 		 240 aa  96.7  3e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1635  tRNA/rRNA methyltransferase  33.19 
 
 		 263 aa  96.7  3e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1578  RNA methyltransferase  33.19 
 
 		 263 aa  96.7  3e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.373161  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14690  putative methyltransferase  31.23 
 
 		 257 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2610  RNA methyltransferase  30.2 
 
 		 247 aa  96.3  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1958  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  30.58 
 
 		 242 aa  96.3  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000144903  hitchhiker  0.00948062 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2389  RNA methyltransferase  30.58 
 
 		 242 aa  96.3  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000450659  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2505  RNA methyltransferase  30.58 
 
 		 242 aa  96.3  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000223047  normal  0.027536 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2161  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  30.6 
 
 		 276 aa  96.3  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0486585  normal  0.265451 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0279  tRNA/rRNA methyltransferase  30.08 
 
 		 246 aa  95.9  5e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1235  RNA methyltransferase  28.87 
 
 		 241 aa  95.5  7e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.207917  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1219  RNA methyltransferase  35.11 
 
 		 252 aa  95.1  8e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1407  RNA methyltransferase TrmH, group 1  34.15 
 
 		 243 aa  95.1  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01352  putative tRNA/rRNA methyltransferase (trmH family) protein  29.83 
 
 		 261 aa  95.1  9e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0228097  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0715  hypothetical tRNA/rRNA methyltransferase  32.51 
 
 		 242 aa  95.1  9e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>