272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1137 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1137  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.836144 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0861  RNA methyltransferase  63.9 
 
 		 261 aa  319  3e-86  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.242897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1301  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  63.45 
 
 		 249 aa  317  9e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.375594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0768  RNA methyltransferase  62.61 
 
 		 232 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00615258  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1009  RNA methyltransferase TrmH, group 1  59.74 
 
 		 251 aa  293  3e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.197865  normal  0.0384423 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1594  SpoU rRNA methylase  48.03 
 
 		 243 aa  218  5e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2433  RNA methyltransferase TrmH, group 1  44.49 
 
 		 231 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1375  RNA methyltransferase  40.34 
 
 		 243 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0566977  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0043  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  45.09 
 
 		 235 aa  180  2e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3609  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  38.96 
 
 		 263 aa  159  5e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.653883  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2656  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  37.02 
 
 		 237 aa  158  8e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1842  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  38.79 
 
 		 255 aa  156  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1382  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.42 
 
 		 290 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.663649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2774  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.73 
 
 		 241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0726338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0071  RNA methyltransferase  33.77 
 
 		 231 aa  129  6e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.17974  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1340  RNA methyltransferase  34.36 
 
 		 254 aa  121  8e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.34341  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2076  RNA methyltransferase  35.62 
 
 		 260 aa  121  8e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.780076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1345  RNA methyltransferase  33.62 
 
 		 234 aa  122  8e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1335  RNA methyltransferase  33.92 
 
 		 234 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0618  RNA methyltransferase  34.36 
 
 		 234 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.570279  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0545  RNA methyltransferase  34.22 
 
 		 257 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2427  RNA methyltransferase  34.76 
 
 		 240 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0615  RNA methyltransferase TrmH, group 1  34.55 
 
 		 268 aa  115  6e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000217405  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0839  RNA methyltransferase  34.17 
 
 		 251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.742035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0869  RNA methyltransferase  34.17 
 
 		 279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164985  normal  0.267349 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1411  RNA methyltransferase  31.1 
 
 		 267 aa  112  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.993978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0882  RNA methyltransferase  34.17 
 
 		 251 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00955273 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1958  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.03 
 
 		 242 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000144903  hitchhiker  0.00948062 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2389  RNA methyltransferase  34.03 
 
 		 242 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000450659  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1736  RNA methyltransferase  32.62 
 
 		 241 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000887935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1816  RNA methyltransferase  32.62 
 
 		 241 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00001341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2505  RNA methyltransferase  34.03 
 
 		 242 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000223047  normal  0.027536 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2261  RNA methyltransferase  32.47 
 
 		 241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2400  RNA methyltransferase  34.03 
 
 		 242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000262197  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2283  RNA methyltransferase  32.62 
 
 		 241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000130955  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2610  RNA methyltransferase  31.6 
 
 		 247 aa  110  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1369  RNA methyltransferase TrmH, group 1  34.89 
 
 		 248 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000282911  hitchhiker  0.0000077591 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1234  RNA methyltransferase TrmH, group 1  32.17 
 
 		 254 aa  109  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.600347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2030  RNA methyltransferase  34.3 
 
 		 245 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.433712  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1407  RNA methyltransferase TrmH, group 1  34.16 
 
 		 243 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2320  RNA methyltransferase  31.3 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000515226  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1475  RNA methyltransferase  31.78 
 
 		 255 aa  106  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1552  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  32.22 
 
 		 245 aa  106  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000140105 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01352  putative tRNA/rRNA methyltransferase (trmH family) protein  32.92 
 
 		 261 aa  106  4e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0228097  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1990  RNA methyltransferase TrmH, group 1  30.23 
 
 		 254 aa  105  5e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.25576  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1290  RNA methyltransferase  33.33 
 
 		 240 aa  105  5e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0442169  normal  0.0143019 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1682  RNA methyltransferase TrmH, group 1  31.45 
 
 		 254 aa  105  6e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2152  RNA methyltransferase  33.05 
 
 		 241 aa  105  6e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0159142  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4224  TrmA family RNA methyltransferase  33.33 
 
 		 245 aa  105  6e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2687  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  32.08 
 
 		 245 aa  105  8e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.491891  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1420  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  31.03 
 
 		 257 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1843  RNA methyltransferase TrmH family, group 1  30.04 
 
 		 257 aa  104  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1235  RNA methyltransferase  33.05 
 
 		 241 aa  104  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.207917  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1455  RNA methyltransferase TrmH, group 1  30.8 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000119002  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4339  RNA methyltransferase  32.78 
 
 		 251 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000160755 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1258  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  30.49 
 
 		 245 aa  104  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00338281  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2161  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  31.66 
 
 		 276 aa  102  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0486585  normal  0.265451 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0645  RNA methyltransferase  33.19 
 
 		 251 aa  103  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0451004  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0812  RNA methyltransferase TrmH, group 1  33.19 
 
 		 251 aa  102  6e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000476063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2119  RNA methyltransferase  34.04 
 
 		 273 aa  102  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1773  RNA methyltransferase  31.28 
 
 		 254 aa  102  7e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.12594  hitchhiker  0.00165952 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1485  RNA methyltransferase  30.29 
 
 		 254 aa  101  9e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0403715  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1950  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  31.42 
 
 		 276 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.168874  normal  0.372622 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2874  RNA methyltransferase  31.15 
 
 		 254 aa  101  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.718962  hitchhiker  0.0000000232974 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1989  RNA methyltransferase  33.62 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.418465 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11341  tRNA/rRNA methyltransferase  31.3 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.427943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14690  putative methyltransferase  30.08 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3629  RNA methyltransferase  32.24 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1296  putative methyltransferase  30.49 
 
 		 308 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4615  RNA methyltransferase TrmH, group 1  30.24 
 
 		 264 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00452302  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0571  putative RNA methyltransferase  31.62 
 
 		 232 aa  99  6e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.918985  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1119  RNA methyltransferase  30.74 
 
 		 287 aa  99  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1803  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  37.58 
 
 		 237 aa  98.6  7e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3514  RNA methyltransferase  30.49 
 
 		 262 aa  99  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1279  RNA methyltransferase  30.87 
 
 		 240 aa  98.6  9e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3468  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.47 
 
 		 245 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.19102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2161  RNA methyltransferase TrmH, group 1  30.08 
 
 		 246 aa  98.2  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00198375  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1336  RNA methyltransferase TrmH, group 1  31.95 
 
 		 249 aa  98.2  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1513  putative tRNA/rRNA methyltransferase  30.49 
 
 		 255 aa  97.8  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.217497  normal  0.686219 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0066  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  37.2 
 
 		 231 aa  97.4  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0596195  hitchhiker  0.0096121 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02424  predicted methyltransferase  31.28 
 
 		 246 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.438411  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1136  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  31.28 
 
 		 246 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.631773  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1161  RNA methyltransferase TrmH, group 1  31.49 
 
 		 256 aa  96.7  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000875813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2399  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  30.52 
 
 		 243 aa  96.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02388  hypothetical protein  31.28 
 
 		 246 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.373948  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2349  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  30.92 
 
 		 243 aa  96.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1145  RNA methyltransferase  31.28 
 
 		 246 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0763368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3764  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  31.28 
 
 		 245 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000603217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2907  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  31.28 
 
 		 246 aa  96.7  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000722285  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2684  RNA methyltransferase  31.28 
 
 		 246 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000664328  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3698  RNA methyltransferase  31.65 
 
 		 246 aa  96.7  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274562  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2685  RNA methyltransferase  31.28 
 
 		 246 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0309108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2817  RNA methyltransferase  31.28 
 
 		 245 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000707701  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3522  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.22 
 
 		 266 aa  96.3  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.391338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1915  tRNA/rRNA methyltransferase  32.47 
 
 		 286 aa  96.3  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3144  RNA methyltransferase  34.47 
 
 		 245 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317738  normal  0.930486 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1297  RNA methyltransferase  32.64 
 
 		 257 aa  96.3  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1396  RNA methyltransferase  29.57 
 
 		 276 aa  95.5  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.901296  hitchhiker  0.00503729 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5426  putative tRNA/rRNA methyltransferase  31.06 
 
 		 399 aa  95.5  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.138819 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5993  RNA methyltransferase TrmH, group 1  30.08 
 
 		 289 aa  95.9  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>