288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1375 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1375  RNA methyltransferase  100 
 
 		 243 aa  493  1e-139  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0566977  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1594  SpoU rRNA methylase  50.21 
 
 		 243 aa  230  2e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2433  RNA methyltransferase TrmH, group 1  48.68 
 
 		 231 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1009  RNA methyltransferase TrmH, group 1  41.49 
 
 		 251 aa  195  5.000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.197865  normal  0.0384423 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0861  RNA methyltransferase  43.35 
 
 		 261 aa  193  2e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.242897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1301  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  40.24 
 
 		 249 aa  189  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.375594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1137  hypothetical protein  40.34 
 
 		 248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.836144 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0768  RNA methyltransferase  40.25 
 
 		 232 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00615258  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0043  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.98 
 
 		 235 aa  180  2e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1842  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  43.8 
 
 		 255 aa  177  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3609  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  41.84 
 
 		 263 aa  167  1e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.653883  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1345  RNA methyltransferase  39.18 
 
 		 234 aa  161  9e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0618  RNA methyltransferase  40.25 
 
 		 234 aa  159  6e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.570279  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0071  RNA methyltransferase  38.66 
 
 		 231 aa  156  3e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.17974  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1335  RNA methyltransferase  38.59 
 
 		 234 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1340  RNA methyltransferase  38.98 
 
 		 254 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.34341  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2656  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36.78 
 
 		 237 aa  150  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1382  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  42.17 
 
 		 290 aa  144  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.663649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2774  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36.84 
 
 		 241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0726338  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4224  TrmA family RNA methyltransferase  35.37 
 
 		 245 aa  137  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4615  RNA methyltransferase TrmH, group 1  38.13 
 
 		 264 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00452302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2030  RNA methyltransferase  38.4 
 
 		 245 aa  135  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.433712  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1407  RNA methyltransferase TrmH, group 1  35.92 
 
 		 243 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1552  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36.07 
 
 		 245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000140105 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2687  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.54 
 
 		 245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.491891  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0645  RNA methyltransferase  37.34 
 
 		 251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0451004  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3514  RNA methyltransferase  35.94 
 
 		 262 aa  129  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1475  RNA methyltransferase  37.3 
 
 		 255 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0545  RNA methyltransferase  31.36 
 
 		 257 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1258  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.6 
 
 		 245 aa  125  6e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00338281  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0839  RNA methyltransferase  34.52 
 
 		 251 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.742035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14690  putative methyltransferase  36.76 
 
 		 257 aa  124  9e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0869  RNA methyltransferase  34.52 
 
 		 279 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164985  normal  0.267349 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1550  RNA methyltransferase  37.14 
 
 		 244 aa  123  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0671761  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1279  RNA methyltransferase  38.3 
 
 		 240 aa  123  2e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1602  RNA methyltransferase TrmH, group 1  35.41 
 
 		 245 aa  123  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.289024  normal  0.479369 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1816  RNA methyltransferase  33.33 
 
 		 241 aa  123  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00001341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1369  RNA methyltransferase TrmH, group 1  35.83 
 
 		 248 aa  123  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000282911  hitchhiker  0.0000077591 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2283  RNA methyltransferase  33.33 
 
 		 241 aa  123  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000130955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1296  putative methyltransferase  36.65 
 
 		 308 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2261  RNA methyltransferase  32.68 
 
 		 241 aa  122  4e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1736  RNA methyltransferase  33.33 
 
 		 241 aa  122  5e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000887935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3033  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.95 
 
 		 241 aa  121  9e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0996868  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1242  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36.1 
 
 		 241 aa  121  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.626014  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1230  rRNA methylase, SpoU family  37.97 
 
 		 240 aa  121  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.420687  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0882  RNA methyltransferase  34.52 
 
 		 251 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00955273 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3629  RNA methyltransferase  35.68 
 
 		 244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1990  RNA methyltransferase TrmH, group 1  34.69 
 
 		 254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.25576  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2320  RNA methyltransferase  34.54 
 
 		 252 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000515226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1148  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.39 
 
 		 262 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1795  RNA methyltransferase  36.02 
 
 		 249 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.313918  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1420  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.8 
 
 		 257 aa  119  6e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0279  tRNA/rRNA methyltransferase  32.77 
 
 		 246 aa  119  6e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1485  RNA methyltransferase  32.44 
 
 		 254 aa  118  7e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0403715  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1234  RNA methyltransferase TrmH, group 1  35.83 
 
 		 254 aa  118  7e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.600347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4339  RNA methyltransferase  33.07 
 
 		 251 aa  118  7e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000160755 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2389  RNA methyltransferase  33.33 
 
 		 242 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000450659  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1958  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  33.33 
 
 		 242 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000144903  hitchhiker  0.00948062 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40430  RNA methyltransferase TrmH, group 1  34.63 
 
 		 258 aa  117  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.573027  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2505  RNA methyltransferase  33.33 
 
 		 242 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000223047  normal  0.027536 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2753  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.12 
 
 		 244 aa  117  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0620173  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1102  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.26 
 
 		 249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0245796  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2400  RNA methyltransferase  33.33 
 
 		 242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000262197  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01053  rRNA methylase  34.17 
 
 		 239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1843  RNA methyltransferase TrmH family, group 1  33.08 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004362  tRNA:Cm32/Um32 methyltransferase  35.42 
 
 		 239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00237949  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1297  RNA methyltransferase  34.29 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1290  RNA methyltransferase  33.74 
 
 		 240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0442169  normal  0.0143019 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3029  RNA methyltransferase  36.07 
 
 		 244 aa  116  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00120237  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1711  hypothetical protein  32.79 
 
 		 257 aa  115  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0615  RNA methyltransferase TrmH, group 1  35.8 
 
 		 268 aa  115  5e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000217405  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2700  RNA methyltransferase  35.56 
 
 		 243 aa  115  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000906061  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1711  hypothetical protein  32.79 
 
 		 257 aa  115  6e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2807  RNA methyltransferase  35.56 
 
 		 243 aa  115  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0201876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1166  RNA methyltransferase  33.72 
 
 		 257 aa  115  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000032697  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0437  RNA methyltransferase  33.72 
 
 		 257 aa  115  6e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.293753  hitchhiker  0.0000675678 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2745  RNA methyltransferase  35.56 
 
 		 243 aa  115  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00735302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1274  RNA methyltransferase  33.72 
 
 		 257 aa  115  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000271019  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2786  RNA methyltransferase  35.56 
 
 		 243 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000395932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2846  RNA methyltransferase TrmH, group 1  34.96 
 
 		 274 aa  115  8.999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2399  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  33.88 
 
 		 243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2349  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  33.88 
 
 		 243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1235  RNA methyltransferase  34.18 
 
 		 241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.207917  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1322  RNA methyltransferase  31.89 
 
 		 254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000628419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1989  RNA methyltransferase  34.55 
 
 		 273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.418465 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0670  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  37.19 
 
 		 256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.373785  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0696  RNA methyltransferase TrmH, group 1  30.71 
 
 		 245 aa  113  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2920  RNA methyltransferase  35.15 
 
 		 243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0175386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0819  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  37.19 
 
 		 256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0412147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01352  putative tRNA/rRNA methyltransferase (trmH family) protein  34.04 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0228097  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2427  RNA methyltransferase  32.14 
 
 		 240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0492  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  33.06 
 
 		 253 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1145  RNA methyltransferase  35.98 
 
 		 246 aa  113  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0763368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0812  RNA methyltransferase TrmH, group 1  33.9 
 
 		 251 aa  113  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000476063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1396  RNA methyltransferase  34.52 
 
 		 276 aa  113  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.901296  hitchhiker  0.00503729 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2076  RNA methyltransferase  32.63 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.780076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2684  RNA methyltransferase  35.98 
 
 		 246 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000664328  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1136  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.98 
 
 		 246 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.631773  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02388  hypothetical protein  35.98 
 
 		 246 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.373948  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2817  RNA methyltransferase  35.98 
 
 		 245 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000707701  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>