More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1345 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_1345  RNA methyltransferase  100 
 
 
234 aa  473  1e-132  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1335  RNA methyltransferase  81.66 
 
 
234 aa  377  1e-104  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0618  RNA methyltransferase  81.66 
 
 
234 aa  378  1e-104  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.570279  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1340  RNA methyltransferase  80.35 
 
 
254 aa  369  1e-101  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.34341  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0071  RNA methyltransferase  65.07 
 
 
231 aa  309  2e-83  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.17974  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0043  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  38.1 
 
 
235 aa  167  1e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1375  RNA methyltransferase  39.18 
 
 
243 aa  161  8.000000000000001e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0566977  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2433  RNA methyltransferase TrmH, group 1  40.44 
 
 
231 aa  150  1e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1594  SpoU rRNA methylase  35.44 
 
 
243 aa  144  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0861  RNA methyltransferase  36.64 
 
 
261 aa  137  1e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.242897  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1301  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.2 
 
 
249 aa  132  3e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.375594  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0768  RNA methyltransferase  34.04 
 
 
232 aa  132  6e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00615258  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1990  RNA methyltransferase TrmH, group 1  34.51 
 
 
254 aa  129  3e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.25576  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1009  RNA methyltransferase TrmH, group 1  33.19 
 
 
251 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.197865  normal  0.0384423 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1258  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  31.88 
 
 
245 aa  123  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00338281  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1137  hypothetical protein  33.62 
 
 
248 aa  122  7e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.836144 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2656  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  31.51 
 
 
237 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2774  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  31.6 
 
 
241 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0726338  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1382  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  33.62 
 
 
290 aa  115  3.9999999999999997e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.663649  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1842  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  29.49 
 
 
255 aa  112  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3609  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  29.49 
 
 
263 aa  112  7.000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.653883  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1369  RNA methyltransferase TrmH, group 1  32.34 
 
 
248 aa  109  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000282911  hitchhiker  0.0000077591 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1550  RNA methyltransferase  31.2 
 
 
244 aa  108  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0671761  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3864  putative RNA methyltransferase  39.87 
 
 
228 aa  108  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000175162  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3670  putative RNA methyltransferase  39.24 
 
 
228 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0716  tRNA/rRNA methyltransferase  35.67 
 
 
253 aa  106  3e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08981  tRNA/rRNA methyltransferase  37.74 
 
 
249 aa  105  9e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.723919 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1475  RNA methyltransferase  35.85 
 
 
255 aa  104  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0545  RNA methyltransferase  36.42 
 
 
257 aa  104  1e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0645  RNA methyltransferase  29.69 
 
 
251 aa  103  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0451004  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40430  RNA methyltransferase TrmH, group 1  30.17 
 
 
258 aa  103  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.573027  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1843  RNA methyltransferase TrmH family, group 1  30.91 
 
 
257 aa  103  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0682  putative RNA methyltransferase  38.12 
 
 
228 aa  102  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000176803  normal  0.146747 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14690  putative methyltransferase  30.17 
 
 
257 aa  101  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04244  hypothetical protein  36.13 
 
 
229 aa  101  9e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.474668  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5917  putative RNA methyltransferase  36.13 
 
 
228 aa  101  9e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.579463  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04279  predicted rRNA methyltransferase  36.13 
 
 
228 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.42509  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11611  tRNA/rRNA methyltransferase  39.35 
 
 
250 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5002  putative RNA methyltransferase  36.13 
 
 
228 aa  100  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.985383  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4639  putative RNA methyltransferase  36.13 
 
 
228 aa  100  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0771017  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0696  RNA methyltransferase TrmH, group 1  40.26 
 
 
245 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4953  putative RNA methyltransferase  35.48 
 
 
228 aa  100  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.396739  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3654  putative RNA methyltransferase  36.13 
 
 
228 aa  100  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.749587  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11341  tRNA/rRNA methyltransferase  36.77 
 
 
246 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.427943  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1365  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  37.09 
 
 
225 aa  100  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3595  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.48 
 
 
228 aa  100  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3522  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.94 
 
 
266 aa  99.8  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.391338  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4951  putative RNA methyltransferase  36.13 
 
 
228 aa  99.4  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4361  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  30.56 
 
 
399 aa  99.4  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.989023  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3506  RNA methyltransferase  30.47 
 
 
240 aa  99.4  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.899672 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0532  putative RNA methyltransferase  35.48 
 
 
233 aa  99.4  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.669488  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1296  putative methyltransferase  30.17 
 
 
308 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3514  RNA methyltransferase  29.39 
 
 
262 aa  99  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3698  RNA methyltransferase  30.65 
 
 
246 aa  99  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274562  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15301  tRNA/rRNA methyltransferase  39.61 
 
 
245 aa  98.6  7e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.877523  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1803  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.13 
 
 
237 aa  98.6  8e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4615  RNA methyltransferase TrmH, group 1  28.92 
 
 
264 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00452302  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0571  putative RNA methyltransferase  36.13 
 
 
232 aa  98.2  9e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.918985  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2084  RNA methyltransferase  34.59 
 
 
251 aa  97.8  1e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0672832  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1196  RNA methyltransferase  31.36 
 
 
276 aa  97.4  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5013  putative RNA methyltransferase  33.55 
 
 
228 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.129781  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1158  RNA methyltransferase  31.36 
 
 
291 aa  97.4  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.357934  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0066  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.84 
 
 
231 aa  97.1  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0596195  hitchhiker  0.0096121 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1949  RNA methyltransferase TrmH, group 1  35.22 
 
 
243 aa  97.1  2e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1950  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  33.16 
 
 
276 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.168874  normal  0.372622 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2161  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  32.65 
 
 
276 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0486585  normal  0.265451 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1325  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.3 
 
 
271 aa  96.7  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.277848  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1552  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  29.06 
 
 
245 aa  96.7  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000140105 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4224  TrmA family RNA methyltransferase  39.35 
 
 
245 aa  96.3  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0441  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  32.13 
 
 
248 aa  96.7  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4813  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  29.83 
 
 
248 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.695937  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2687  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  27.78 
 
 
245 aa  96.3  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.491891  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2030  RNA methyltransferase  28.93 
 
 
245 aa  95.9  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.433712  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2117  RNA methyltransferase TrmH, group 1  37.42 
 
 
239 aa  95.9  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0563  putative RNA methyltransferase  34.84 
 
 
228 aa  95.9  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1995  RNA methyltransferase  30.08 
 
 
281 aa  95.9  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.720646  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2433  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  27.54 
 
 
258 aa  95.5  5e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.127939  normal  0.10084 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3144  RNA methyltransferase  31.22 
 
 
245 aa  95.9  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317738  normal  0.930486 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3468  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  31.22 
 
 
245 aa  95.9  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.19102  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3658  putative RNA methyltransferase  35.26 
 
 
226 aa  95.5  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3810  hypothetical protein  32.16 
 
 
243 aa  95.5  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0410022  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4923  putative RNA methyltransferase  33.55 
 
 
228 aa  95.5  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000405999  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3341  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36.77 
 
 
245 aa  95.1  8e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2846  RNA methyltransferase TrmH, group 1  27.73 
 
 
274 aa  95.1  8e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1578  RNA methyltransferase  30.57 
 
 
263 aa  95.1  9e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.373161  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5009  putative RNA methyltransferase  33.55 
 
 
228 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.954337 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1635  tRNA/rRNA methyltransferase  30.57 
 
 
263 aa  94.7  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3829  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.17 
 
 
243 aa  94.4  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.542381  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2581  RNA methyltransferase  27.47 
 
 
262 aa  94.4  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0271019  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5766  RNA methyltransferase  31.37 
 
 
261 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3731  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.09 
 
 
398 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.804508  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4339  RNA methyltransferase  28.27 
 
 
251 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000160755 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2632  RNA methyltransferase  28.99 
 
 
250 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.192345 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3522  RNA methyltransferase  33.17 
 
 
243 aa  94.4  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0833085  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0869  RNA methyltransferase  30.25 
 
 
279 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164985  normal  0.267349 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0839  RNA methyltransferase  30.25 
 
 
251 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.742035  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11621  tRNA/rRNA methyltransferase  37.42 
 
 
250 aa  94  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0640948  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1602  RNA methyltransferase TrmH, group 1  33.74 
 
 
245 aa  94.4  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.289024  normal  0.479369 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1411  RNA methyltransferase  33.99 
 
 
267 aa  94  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.993978  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4957  putative RNA methyltransferase  32.9 
 
 
228 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.914631  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>