275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2084 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2084  RNA methyltransferase  100 
 
 		 251 aa  518  1e-146  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0672832  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1475  RNA methyltransferase  35.26 
 
 		 255 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2030  RNA methyltransferase  36.31 
 
 		 245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.433712  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0645  RNA methyltransferase  37.34 
 
 		 251 aa  109  5e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0451004  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1369  RNA methyltransferase TrmH, group 1  36.71 
 
 		 248 aa  108  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000282911  hitchhiker  0.0000077591 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0071  RNA methyltransferase  36.41 
 
 		 231 aa  104  2e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.17974  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1550  RNA methyltransferase  37.27 
 
 		 244 aa  103  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0671761  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1258  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36.48 
 
 		 245 aa  102  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00338281  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1990  RNA methyltransferase TrmH, group 1  35.33 
 
 		 254 aa  101  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.25576  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2687  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  32.16 
 
 		 245 aa  99.4  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.491891  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1552  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.81 
 
 		 245 aa  99  7e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000140105 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1345  RNA methyltransferase  34.59 
 
 		 234 aa  97.8  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5766  RNA methyltransferase  34.62 
 
 		 261 aa  94  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2705  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  31.28 
 
 		 253 aa  93.2  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.29092 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2949  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.42 
 
 		 239 aa  93.6  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.226864 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3810  hypothetical protein  31.58 
 
 		 243 aa  92.4  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0410022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3341  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  33.55 
 
 		 245 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1340  RNA methyltransferase  32.52 
 
 		 254 aa  90.1  3e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.34341  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3144  RNA methyltransferase  34.62 
 
 		 245 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317738  normal  0.930486 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3468  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  33.97 
 
 		 245 aa  89.4  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.19102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3829  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.41 
 
 		 243 aa  89  7e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.542381  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3522  RNA methyltransferase  30.41 
 
 		 243 aa  89  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0833085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1365  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.84 
 
 		 225 aa  88.2  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1843  RNA methyltransferase TrmH family, group 1  28.1 
 
 		 257 aa  88.2  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0618  RNA methyltransferase  33.33 
 
 		 234 aa  87.8  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.570279  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1517  RNA methyltransferase  33.97 
 
 		 276 aa  88.6  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.9954 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0279  tRNA/rRNA methyltransferase  33.75 
 
 		 246 aa  87.8  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2624  RNA methyltransferase  35.67 
 
 		 260 aa  87.4  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3522  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  28.25 
 
 		 266 aa  86.7  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.391338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2243  tRNA/rRNA methyltransferase  25.83 
 
 		 251 aa  86.7  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.425244  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2427  RNA methyltransferase  32.18 
 
 		 240 aa  86.3  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3698  RNA methyltransferase  31.06 
 
 		 246 aa  85.9  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274562  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1279  RNA methyltransferase  33.33 
 
 		 240 aa  85.9  6e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0696  RNA methyltransferase TrmH, group 1  35.19 
 
 		 245 aa  85.5  7e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1230  rRNA methylase, SpoU family  33.33 
 
 		 240 aa  84.7  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.420687  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1133  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  29.05 
 
 		 253 aa  85.1  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2161  RNA methyltransferase TrmH, group 1  31.11 
 
 		 246 aa  85.1  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00198375  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3085  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.36 
 
 		 237 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14690  putative methyltransferase  34.78 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1119  RNA methyltransferase  34.81 
 
 		 287 aa  84.7  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1682  RNA methyltransferase TrmH, group 1  35.62 
 
 		 254 aa  84.3  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1455  RNA methyltransferase TrmH, group 1  33.75 
 
 		 259 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000119002  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1297  RNA methyltransferase  33.13 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0043  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  25 
 
 		 235 aa  84  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1335  RNA methyltransferase  32.3 
 
 		 234 aa  84  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004362  tRNA:Cm32/Um32 methyltransferase  31.79 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00237949  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2987  tRNA/rRNA methyltransferase, SpoU  33.74 
 
 		 236 aa  83.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000142491  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3186  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.16 
 
 		 237 aa  83.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0824201  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1816  RNA methyltransferase  32.39 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00001341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2433  RNA methyltransferase TrmH, group 1  35.37 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11621  tRNA/rRNA methyltransferase  32.73 
 
 		 250 aa  83.2  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0640948  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1736  RNA methyltransferase  32.57 
 
 		 241 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000887935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2283  RNA methyltransferase  32.39 
 
 		 241 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000130955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15301  tRNA/rRNA methyltransferase  34.57 
 
 		 245 aa  82.8  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.877523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1773  RNA methyltransferase  34.38 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.12594  hitchhiker  0.00165952 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3506  RNA methyltransferase  32.8 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.899672 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2076  RNA methyltransferase  29.38 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.780076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2581  RNA methyltransferase  30.63 
 
 		 262 aa  82  0.000000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0271019  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01352  putative tRNA/rRNA methyltransferase (trmH family) protein  33.51 
 
 		 261 aa  82.4  0.000000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0228097  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4813  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  27.05 
 
 		 248 aa  82  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.695937  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2632  RNA methyltransferase  30.97 
 
 		 250 aa  82  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.192345 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2161  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  32.05 
 
 		 276 aa  82  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0486585  normal  0.265451 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1325  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  28.57 
 
 		 271 aa  81.6  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.277848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1296  putative methyltransferase  33.14 
 
 		 308 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1268  RNA methyltransferase  28.73 
 
 		 262 aa  81.3  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.681367  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1485  RNA methyltransferase  34.38 
 
 		 254 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0403715  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2261  RNA methyltransferase  33.75 
 
 		 241 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2505  RNA methyltransferase  33.12 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000223047  normal  0.027536 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1958  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  33.12 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000144903  hitchhiker  0.00948062 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2389  RNA methyltransferase  33.12 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000450659  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1950  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  32.69 
 
 		 276 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.168874  normal  0.372622 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0696  RNA methyltransferase TrmH, group 1  30.77 
 
 		 279 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1577  RNA methyltransferase TrmH, group 1  28.14 
 
 		 410 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.68355  normal  0.0119734 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4361  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  28.14 
 
 		 399 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.989023  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5426  putative tRNA/rRNA methyltransferase  28.93 
 
 		 399 aa  80.1  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.138819 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1989  RNA methyltransferase  32.1 
 
 		 273 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.418465 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2874  RNA methyltransferase  34.38 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.718962  hitchhiker  0.0000000232974 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1290  RNA methyltransferase  32.96 
 
 		 240 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0442169  normal  0.0143019 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40430  RNA methyltransferase TrmH, group 1  32.92 
 
 		 258 aa  80.1  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.573027  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1915  tRNA/rRNA methyltransferase  31.41 
 
 		 286 aa  80.5  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2753  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  30.51 
 
 		 244 aa  79.7  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0620173  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2152  RNA methyltransferase  33.12 
 
 		 241 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0159142  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0788  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  28.73 
 
 		 248 aa  79.7  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0987211  normal  0.0803398 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2400  RNA methyltransferase  33.12 
 
 		 242 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000262197  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2320  RNA methyltransferase  34.38 
 
 		 252 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000515226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1295  RNA methyltransferase TrmH, group 1  27.85 
 
 		 403 aa  79  0.00000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4953  putative RNA methyltransferase  32.91 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.396739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1411  RNA methyltransferase  31.58 
 
 		 267 aa  79.3  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.993978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3875  RNA methyltransferase  26.23 
 
 		 248 aa  79  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.250027  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3514  RNA methyltransferase  31.87 
 
 		 262 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1795  RNA methyltransferase  31.93 
 
 		 249 aa  79  0.00000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.313918  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1995  RNA methyltransferase  30.97 
 
 		 281 aa  79  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.720646  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3731  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  28.93 
 
 		 398 aa  79  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.804508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2119  RNA methyltransferase  32.1 
 
 		 273 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01053  rRNA methylase  28.46 
 
 		 239 aa  78.6  0.00000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1578  RNA methyltransferase  28.65 
 
 		 263 aa  78.2  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.373161  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3670  putative RNA methyltransferase  28.1 
 
 		 228 aa  77.8  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1635  tRNA/rRNA methyltransferase  28.65 
 
 		 263 aa  78.2  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1196  RNA methyltransferase  30.97 
 
 		 276 aa  78.2  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4951  putative RNA methyltransferase  32.08 
 
 		 228 aa  77.8  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>