More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3186 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3186  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  100 
 
 		 237 aa  455  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0824201  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3085  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  99.16 
 
 		 237 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2987  tRNA/rRNA methyltransferase, SpoU  96.19 
 
 		 236 aa  361  7.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000142491  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2949  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  80.6 
 
 		 239 aa  354  5e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.226864 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1843  RNA methyltransferase TrmH family, group 1  40.09 
 
 		 257 aa  122  4e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2161  RNA methyltransferase TrmH, group 1  35.44 
 
 		 246 aa  118  7e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00198375  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2705  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  38.96 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.29092 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1155  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  39.24 
 
 		 266 aa  116  3e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.043355 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2030  RNA methyltransferase  36.7 
 
 		 245 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.433712  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0645  RNA methyltransferase  37.39 
 
 		 251 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0451004  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1322  RNA methyltransferase  33.19 
 
 		 254 aa  113  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000628419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1552  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36.41 
 
 		 245 aa  113  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000140105 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1550  RNA methyltransferase  36.44 
 
 		 244 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0671761  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2687  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.32 
 
 		 245 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.491891  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0827  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  38.08 
 
 		 245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.293121 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0882  RNA methyltransferase  37.32 
 
 		 251 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00955273 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0869  RNA methyltransferase  37.84 
 
 		 279 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164985  normal  0.267349 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0839  RNA methyltransferase  38.1 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.742035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1369  RNA methyltransferase TrmH, group 1  33.94 
 
 		 248 aa  105  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000282911  hitchhiker  0.0000077591 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14690  putative methyltransferase  38.5 
 
 		 257 aa  105  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1119  RNA methyltransferase  41.61 
 
 		 287 aa  105  8e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5766  RNA methyltransferase  35.78 
 
 		 261 aa  104  9e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3514  RNA methyltransferase  37.61 
 
 		 262 aa  105  9e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1475  RNA methyltransferase  33.49 
 
 		 255 aa  104  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2700  RNA methyltransferase  42.07 
 
 		 243 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000906061  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40430  RNA methyltransferase TrmH, group 1  37.17 
 
 		 258 aa  104  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.573027  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2807  RNA methyltransferase  42.07 
 
 		 243 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0201876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2745  RNA methyltransferase  42.07 
 
 		 243 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00735302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1736  RNA methyltransferase  33.76 
 
 		 241 aa  104  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000887935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2920  RNA methyltransferase  42.07 
 
 		 243 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0175386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2786  RNA methyltransferase  42.07 
 
 		 243 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000395932  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2261  RNA methyltransferase  33.33 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1711  hypothetical protein  33.99 
 
 		 257 aa  103  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1411  RNA methyltransferase  39.51 
 
 		 267 aa  103  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.993978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3029  RNA methyltransferase  42.07 
 
 		 244 aa  103  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00120237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0569  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  40.83 
 
 		 254 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1711  hypothetical protein  33.5 
 
 		 257 aa  103  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1296  putative methyltransferase  36.61 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1578  RNA methyltransferase  35.68 
 
 		 263 aa  102  4e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.373161  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1816  RNA methyltransferase  33.33 
 
 		 241 aa  102  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00001341  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02424  predicted methyltransferase  41.46 
 
 		 246 aa  102  5e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.438411  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1136  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  41.46 
 
 		 246 aa  102  5e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.631773  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2685  RNA methyltransferase  41.46 
 
 		 246 aa  102  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0309108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2817  RNA methyltransferase  41.46 
 
 		 245 aa  102  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000707701  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3764  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  41.46 
 
 		 245 aa  102  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000603217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2684  RNA methyltransferase  41.46 
 
 		 246 aa  102  5e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000664328  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1145  RNA methyltransferase  41.46 
 
 		 246 aa  102  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0763368  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02388  hypothetical protein  41.46 
 
 		 246 aa  102  5e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.373948  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2907  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  41.46 
 
 		 246 aa  102  5e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000722285  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0441  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  40 
 
 		 248 aa  102  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2283  RNA methyltransferase  33.33 
 
 		 241 aa  102  5e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000130955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3698  RNA methyltransferase  35.83 
 
 		 246 aa  102  7e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274562  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1234  RNA methyltransferase TrmH, group 1  38.24 
 
 		 254 aa  101  8e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.600347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4615  RNA methyltransferase TrmH, group 1  37.44 
 
 		 264 aa  101  8e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00452302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1113  tRNA/rRNA methyltransferase, SpoU  36.36 
 
 		 269 aa  101  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.794332  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4224  TrmA family RNA methyltransferase  33.67 
 
 		 245 aa  101  8e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2076  RNA methyltransferase  37.5 
 
 		 260 aa  101  9e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.780076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4339  RNA methyltransferase  35.62 
 
 		 251 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000160755 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2427  RNA methyltransferase  36.6 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1635  tRNA/rRNA methyltransferase  35.27 
 
 		 263 aa  99.8  3e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3629  RNA methyltransferase  36.32 
 
 		 244 aa  100  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0819  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  37.5 
 
 		 256 aa  100  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0412147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0670  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  37.5 
 
 		 256 aa  100  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.373785  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3341  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.87 
 
 		 245 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0715  hypothetical tRNA/rRNA methyltransferase  35.38 
 
 		 242 aa  99.4  4e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1279  RNA methyltransferase  42.77 
 
 		 240 aa  99.4  4e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2062  tRNA/rRNA methyltransferase, TrmH family, group 1  43.21 
 
 		 247 aa  99.4  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.260682  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3506  RNA methyltransferase  33.61 
 
 		 240 aa  99.4  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.899672 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5993  RNA methyltransferase TrmH, group 1  39.08 
 
 		 289 aa  99  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2084  RNA methyltransferase  39.08 
 
 		 289 aa  99  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00462385  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1102  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  38.89 
 
 		 249 aa  98.6  8e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0245796  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3144  RNA methyltransferase  33.89 
 
 		 245 aa  98.2  9e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317738  normal  0.930486 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1166  RNA methyltransferase  39.51 
 
 		 257 aa  98.2  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000032697  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0437  RNA methyltransferase  39.51 
 
 		 257 aa  98.2  9e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.293753  hitchhiker  0.0000675678 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3468  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  33.89 
 
 		 245 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.19102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01352  putative tRNA/rRNA methyltransferase (trmH family) protein  33.16 
 
 		 261 aa  97.8  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0228097  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1485  RNA methyltransferase  40.25 
 
 		 254 aa  97.8  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0403715  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0682  putative RNA methyltransferase  36.16 
 
 		 228 aa  97.8  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000176803  normal  0.146747 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1274  RNA methyltransferase  39.51 
 
 		 257 aa  97.8  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000271019  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5390  RNA methyltransferase TrmH, group 1  38.92 
 
 		 289 aa  97.1  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1773  RNA methyltransferase  32.38 
 
 		 254 aa  97.1  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.12594  hitchhiker  0.00165952 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0279  tRNA/rRNA methyltransferase  31.42 
 
 		 246 aa  97.4  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1396  RNA methyltransferase  39.38 
 
 		 276 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.901296  hitchhiker  0.00503729 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0071  RNA methyltransferase  34.52 
 
 		 231 aa  97.1  2e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.17974  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2152  RNA methyltransferase  31.62 
 
 		 241 aa  97.4  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0159142  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1420  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36.51 
 
 		 257 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1365  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.67 
 
 		 225 aa  96.7  3e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0615  RNA methyltransferase TrmH, group 1  34.91 
 
 		 268 aa  96.3  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000217405  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0828  RNA methyltransferase  32.92 
 
 		 275 aa  96.3  3e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.151565  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2119  RNA methyltransferase  38.75 
 
 		 273 aa  96.7  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2753  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  33.88 
 
 		 244 aa  95.9  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0620173  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0812  RNA methyltransferase TrmH, group 1  34.53 
 
 		 251 aa  96.3  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000476063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1989  RNA methyltransferase  38.75 
 
 		 273 aa  95.9  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.418465 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1230  rRNA methylase, SpoU family  42.17 
 
 		 240 aa  95.5  6e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.420687  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1990  RNA methyltransferase TrmH, group 1  37.18 
 
 		 254 aa  95.5  6e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.25576  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2610  RNA methyltransferase  41.03 
 
 		 247 aa  95.5  7e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1258  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  33.94 
 
 		 245 aa  95.5  7e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00338281  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2161  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  32.78 
 
 		 276 aa  95.1  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0486585  normal  0.265451 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1242  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  38.89 
 
 		 241 aa  95.1  8e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.626014  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2874  RNA methyltransferase  32.11 
 
 		 254 aa  95.1  9e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.718962  hitchhiker  0.0000000232974 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>