281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_2949 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_2949  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  100 
 
 		 239 aa  462  1e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.226864 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3085  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  79.31 
 
 		 237 aa  302  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3186  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  78.02 
 
 		 237 aa  299  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0824201  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2987  tRNA/rRNA methyltransferase, SpoU  78.45 
 
 		 236 aa  299  3e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000142491  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1843  RNA methyltransferase TrmH family, group 1  43.04 
 
 		 257 aa  135  6.0000000000000005e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2705  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  42.79 
 
 		 253 aa  128  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.29092 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2030  RNA methyltransferase  40.87 
 
 		 245 aa  125  5e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.433712  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1552  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  37.56 
 
 		 245 aa  121  8e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000140105 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1550  RNA methyltransferase  37.95 
 
 		 244 aa  121  9e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0671761  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2161  RNA methyltransferase TrmH, group 1  35.74 
 
 		 246 aa  121  9e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00198375  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0827  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  38.91 
 
 		 245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.293121 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0645  RNA methyltransferase  39.33 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0451004  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1322  RNA methyltransferase  33.91 
 
 		 254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000628419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2687  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36.65 
 
 		 245 aa  120  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.491891  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1711  hypothetical protein  35.15 
 
 		 257 aa  117  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1711  hypothetical protein  34.73 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1578  RNA methyltransferase  36.73 
 
 		 263 aa  115  3.9999999999999997e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.373161  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1635  tRNA/rRNA methyltransferase  36.73 
 
 		 263 aa  115  6.9999999999999995e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1369  RNA methyltransferase TrmH, group 1  36.97 
 
 		 248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000282911  hitchhiker  0.0000077591 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3698  RNA methyltransferase  38.43 
 
 		 246 aa  113  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274562  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2700  RNA methyltransferase  43.71 
 
 		 243 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000906061  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2807  RNA methyltransferase  43.71 
 
 		 243 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0201876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2786  RNA methyltransferase  43.71 
 
 		 243 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000395932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2745  RNA methyltransferase  43.71 
 
 		 243 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00735302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2581  RNA methyltransferase  37.84 
 
 		 262 aa  112  6e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0271019  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0788  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.46 
 
 		 248 aa  112  6e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0987211  normal  0.0803398 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2920  RNA methyltransferase  43.71 
 
 		 243 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0175386  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1475  RNA methyltransferase  38.03 
 
 		 255 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0715  hypothetical tRNA/rRNA methyltransferase  37.11 
 
 		 242 aa  111  9e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1119  RNA methyltransferase  34.66 
 
 		 287 aa  111  9e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1234  RNA methyltransferase TrmH, group 1  40 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.600347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1365  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  40.91 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1411  RNA methyltransferase  39.29 
 
 		 267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.993978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4813  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  37.7 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.695937  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3522  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.1 
 
 		 266 aa  110  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.391338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0812  RNA methyltransferase TrmH, group 1  37.55 
 
 		 251 aa  110  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000476063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2062  tRNA/rRNA methyltransferase, TrmH family, group 1  39.33 
 
 		 247 aa  109  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.260682  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1602  RNA methyltransferase TrmH, group 1  36.13 
 
 		 245 aa  109  4.0000000000000004e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.289024  normal  0.479369 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0615  RNA methyltransferase TrmH, group 1  35.43 
 
 		 268 aa  109  5e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000217405  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4339  RNA methyltransferase  38.14 
 
 		 251 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000160755 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0279  tRNA/rRNA methyltransferase  32.3 
 
 		 246 aa  108  5e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3029  RNA methyltransferase  42.51 
 
 		 244 aa  108  5e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00120237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3764  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  43.21 
 
 		 245 aa  108  6e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000603217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2817  RNA methyltransferase  43.21 
 
 		 245 aa  108  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000707701  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02424  predicted methyltransferase  43.21 
 
 		 246 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.438411  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1136  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  43.21 
 
 		 246 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.631773  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2907  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  43.21 
 
 		 246 aa  108  7.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000722285  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02388  hypothetical protein  43.21 
 
 		 246 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.373948  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2684  RNA methyltransferase  43.21 
 
 		 246 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000664328  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1145  RNA methyltransferase  43.21 
 
 		 246 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0763368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3506  RNA methyltransferase  36.44 
 
 		 240 aa  108  7.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.899672 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2427  RNA methyltransferase  36.98 
 
 		 240 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2685  RNA methyltransferase  43.21 
 
 		 246 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0309108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5766  RNA methyltransferase  36.64 
 
 		 261 aa  107  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1420  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  38.6 
 
 		 257 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0670  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  38.35 
 
 		 256 aa  108  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.373785  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0819  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  38.35 
 
 		 256 aa  108  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0412147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14690  putative methyltransferase  37.95 
 
 		 257 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2076  RNA methyltransferase  38.82 
 
 		 260 aa  107  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.780076  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0839  RNA methyltransferase  37.96 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.742035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2753  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.03 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0620173  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2281  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  40.95 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0794239  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1155  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  39.33 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.043355 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3341  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  37.71 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0869  RNA methyltransferase  37.96 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164985  normal  0.267349 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1161  RNA methyltransferase TrmH, group 1  36.82 
 
 		 256 aa  106  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000875813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0682  putative RNA methyltransferase  37.78 
 
 		 228 aa  106  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000176803  normal  0.146747 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1816  RNA methyltransferase  33.05 
 
 		 241 aa  106  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00001341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2632  RNA methyltransferase  35.83 
 
 		 250 aa  106  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.192345 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3144  RNA methyltransferase  37.13 
 
 		 245 aa  106  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317738  normal  0.930486 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1336  RNA methyltransferase TrmH, group 1  35.8 
 
 		 249 aa  106  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1235  RNA methyltransferase  34.85 
 
 		 241 aa  105  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.207917  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40430  RNA methyltransferase TrmH, group 1  37.89 
 
 		 258 aa  106  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.573027  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2283  RNA methyltransferase  33.05 
 
 		 241 aa  105  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000130955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3468  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  37.13 
 
 		 245 aa  106  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.19102  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2610  RNA methyltransferase  44.3 
 
 		 247 aa  105  5e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2261  RNA methyltransferase  32.62 
 
 		 241 aa  105  6e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1296  putative methyltransferase  37.5 
 
 		 308 aa  105  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1517  RNA methyltransferase  33.33 
 
 		 276 aa  105  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.9954 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1736  RNA methyltransferase  33.05 
 
 		 241 aa  105  6e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000887935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1485  RNA methyltransferase  31.69 
 
 		 254 aa  105  6e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0403715  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3629  RNA methyltransferase  35.9 
 
 		 244 aa  105  7e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4615  RNA methyltransferase TrmH, group 1  36.86 
 
 		 264 aa  105  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00452302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0882  RNA methyltransferase  37.96 
 
 		 251 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00955273 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1682  RNA methyltransferase TrmH, group 1  34 
 
 		 254 aa  105  9e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2624  RNA methyltransferase  33.04 
 
 		 260 aa  104  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1133  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.8 
 
 		 253 aa  104  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1079  RNA methyltransferase TrmH  36.59 
 
 		 289 aa  104  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.179328 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0437  RNA methyltransferase  43.48 
 
 		 257 aa  104  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.293753  hitchhiker  0.0000675678 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1989  RNA methyltransferase  40 
 
 		 273 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.418465 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1396  RNA methyltransferase  39.62 
 
 		 276 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.901296  hitchhiker  0.00503729 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01352  putative tRNA/rRNA methyltransferase (trmH family) protein  35.23 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0228097  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0696  RNA methyltransferase TrmH, group 1  36.68 
 
 		 279 aa  104  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1274  RNA methyltransferase  38.18 
 
 		 257 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000271019  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1279  RNA methyltransferase  35.02 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3514  RNA methyltransferase  38.05 
 
 		 262 aa  103  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1166  RNA methyltransferase  43.48 
 
 		 257 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000032697  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2119  RNA methyltransferase  40 
 
 		 273 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1102  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.32 
 
 		 249 aa  103  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0245796  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1258  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.02 
 
 		 245 aa  103  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00338281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>