More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3875 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_3875  RNA methyltransferase  100 
 
 		 248 aa  515  1.0000000000000001e-145  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.250027  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0492  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  64.56 
 
 		 253 aa  309  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2349  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  62.96 
 
 		 243 aa  301  6.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2399  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  63.33 
 
 		 243 aa  298  4e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1148  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  60.68 
 
 		 262 aa  296  3e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1407  RNA methyltransferase TrmH, group 1  63.03 
 
 		 243 aa  295  4e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4224  TrmA family RNA methyltransferase  60.66 
 
 		 245 aa  286  2.9999999999999996e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1602  RNA methyltransferase TrmH, group 1  49.58 
 
 		 245 aa  228  6e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.289024  normal  0.479369 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08981  tRNA/rRNA methyltransferase  47.33 
 
 		 249 aa  202  3e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.723919 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1949  RNA methyltransferase TrmH, group 1  42.21 
 
 		 243 aa  179  2.9999999999999997e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11341  tRNA/rRNA methyltransferase  42.39 
 
 		 246 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.427943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11471  tRNA/rRNA methyltransferase  38.14 
 
 		 236 aa  176  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11611  tRNA/rRNA methyltransferase  38.17 
 
 		 250 aa  174  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15301  tRNA/rRNA methyltransferase  39.17 
 
 		 245 aa  170  2e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.877523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0696  RNA methyltransferase TrmH, group 1  39.92 
 
 		 245 aa  169  4e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11621  tRNA/rRNA methyltransferase  36.1 
 
 		 250 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0640948  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1067  RNA methyltransferase TrmH, group 1  35.92 
 
 		 249 aa  166  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1550  RNA methyltransferase  40.34 
 
 		 244 aa  166  5e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0671761  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1234  RNA methyltransferase TrmH, group 1  41.32 
 
 		 254 aa  160  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.600347  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1420  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  40.57 
 
 		 257 aa  159  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40430  RNA methyltransferase TrmH, group 1  40.16 
 
 		 258 aa  158  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.573027  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2030  RNA methyltransferase  41 
 
 		 245 aa  156  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.433712  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0716  tRNA/rRNA methyltransferase  39.04 
 
 		 253 aa  155  5.0000000000000005e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14690  putative methyltransferase  40.66 
 
 		 257 aa  155  7e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1296  putative methyltransferase  40.25 
 
 		 308 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4615  RNA methyltransferase TrmH, group 1  38.68 
 
 		 264 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00452302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3506  RNA methyltransferase  38.86 
 
 		 240 aa  149  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.899672 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02424  predicted methyltransferase  40.77 
 
 		 246 aa  149  4e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.438411  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1136  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  40.77 
 
 		 246 aa  149  4e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.631773  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2817  RNA methyltransferase  40.77 
 
 		 245 aa  149  4e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000707701  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2684  RNA methyltransferase  40.77 
 
 		 246 aa  149  4e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000664328  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1145  RNA methyltransferase  40.77 
 
 		 246 aa  149  4e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0763368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2685  RNA methyltransferase  40.77 
 
 		 246 aa  149  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0309108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2907  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  40.77 
 
 		 246 aa  149  4e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000722285  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3764  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  40.77 
 
 		 245 aa  149  4e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000603217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02388  hypothetical protein  40.77 
 
 		 246 aa  149  4e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.373948  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3514  RNA methyltransferase  38 
 
 		 262 aa  149  5e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2076  RNA methyltransferase  36.32 
 
 		 260 aa  149  6e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.780076  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3033  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  40.09 
 
 		 241 aa  148  7e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0996868  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1235  RNA methyltransferase  39.91 
 
 		 241 aa  148  8e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.207917  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1242  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  39.66 
 
 		 241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.626014  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2745  RNA methyltransferase  40.34 
 
 		 243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00735302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2700  RNA methyltransferase  40.34 
 
 		 243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000906061  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2807  RNA methyltransferase  40.34 
 
 		 243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0201876  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1711  hypothetical protein  39.76 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4339  RNA methyltransferase  38.46 
 
 		 251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000160755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1816  RNA methyltransferase  37.92 
 
 		 241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00001341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2786  RNA methyltransferase  40.34 
 
 		 243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000395932  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1475  RNA methyltransferase  37.5 
 
 		 255 aa  146  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2920  RNA methyltransferase  39.91 
 
 		 243 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0175386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3029  RNA methyltransferase  40.77 
 
 		 244 aa  146  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00120237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1795  RNA methyltransferase  36.95 
 
 		 249 aa  146  3e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.313918  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1736  RNA methyltransferase  37.92 
 
 		 241 aa  146  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000887935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2283  RNA methyltransferase  37.5 
 
 		 241 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000130955  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1711  hypothetical protein  39.37 
 
 		 257 aa  145  6e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2705  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  39.26 
 
 		 253 aa  145  6e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.29092 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1258  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  37.5 
 
 		 245 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00338281  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0437  RNA methyltransferase  41.03 
 
 		 257 aa  144  9e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.293753  hitchhiker  0.0000675678 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1166  RNA methyltransferase  41.03 
 
 		 257 aa  144  9e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000032697  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1102  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  38.33 
 
 		 249 aa  144  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0245796  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3629  RNA methyltransferase  39.48 
 
 		 244 aa  144  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1274  RNA methyltransferase  41.03 
 
 		 257 aa  144  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000271019  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1990  RNA methyltransferase TrmH, group 1  37.5 
 
 		 254 aa  144  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.25576  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2687  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  37.08 
 
 		 245 aa  143  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.491891  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2261  RNA methyltransferase  37.08 
 
 		 241 aa  143  3e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0882  RNA methyltransferase  36.48 
 
 		 251 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00955273 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1369  RNA methyltransferase TrmH, group 1  40.17 
 
 		 248 aa  142  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000282911  hitchhiker  0.0000077591 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0839  RNA methyltransferase  36.48 
 
 		 251 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.742035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01352  putative tRNA/rRNA methyltransferase (trmH family) protein  37.82 
 
 		 261 aa  142  6e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0228097  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0869  RNA methyltransferase  36.48 
 
 		 279 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164985  normal  0.267349 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1161  RNA methyltransferase TrmH, group 1  36.89 
 
 		 256 aa  140  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000875813  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1552  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36.67 
 
 		 245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000140105 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2753  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  38.79 
 
 		 244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0620173  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0819  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  39.5 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0412147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0670  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  39.5 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.373785  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2427  RNA methyltransferase  36.78 
 
 		 240 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1411  RNA methyltransferase  36.17 
 
 		 267 aa  138  7e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.993978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1279  RNA methyltransferase  36.86 
 
 		 240 aa  137  1e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1646  RNA methyltransferase TrmH, group 1  34.62 
 
 		 247 aa  137  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1455  RNA methyltransferase TrmH, group 1  36.65 
 
 		 259 aa  137  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000119002  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0645  RNA methyltransferase  34.44 
 
 		 251 aa  137  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0451004  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1290  RNA methyltransferase  37.5 
 
 		 240 aa  138  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0442169  normal  0.0143019 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1773  RNA methyltransferase  35 
 
 		 254 aa  137  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.12594  hitchhiker  0.00165952 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0812  RNA methyltransferase TrmH, group 1  37.83 
 
 		 251 aa  137  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000476063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1230  rRNA methylase, SpoU family  36.86 
 
 		 240 aa  137  2e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.420687  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1485  RNA methyltransferase  34.4 
 
 		 254 aa  135  5e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0403715  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2152  RNA methyltransferase  36.25 
 
 		 241 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0159142  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2389  RNA methyltransferase  35.95 
 
 		 242 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000450659  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1958  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.95 
 
 		 242 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000144903  hitchhiker  0.00948062 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2505  RNA methyltransferase  35.95 
 
 		 242 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000223047  normal  0.027536 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2400  RNA methyltransferase  35.95 
 
 		 242 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000262197  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5993  RNA methyltransferase TrmH, group 1  38.17 
 
 		 289 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2084  RNA methyltransferase  38.17 
 
 		 289 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00462385  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01053  rRNA methylase  35.02 
 
 		 239 aa  132  5e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2874  RNA methyltransferase  34.11 
 
 		 254 aa  132  6e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.718962  hitchhiker  0.0000000232974 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2161  RNA methyltransferase TrmH, group 1  34.71 
 
 		 246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00198375  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2320  RNA methyltransferase  35.32 
 
 		 252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000515226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0673  RNA methyltransferase TrmH, group 1  36.17 
 
 		 267 aa  129  3e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000000736147  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004362  tRNA:Cm32/Um32 methyltransferase  35.19 
 
 		 239 aa  129  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00237949  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1594  SpoU rRNA methylase  41.18 
 
 		 243 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>