290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0716 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0716  tRNA/rRNA methyltransferase  100 
 
 		 253 aa  505  9.999999999999999e-143  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1949  RNA methyltransferase TrmH, group 1  67.2 
 
 		 243 aa  337  8e-92  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08981  tRNA/rRNA methyltransferase  60.48 
 
 		 249 aa  284  9e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.723919 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11341  tRNA/rRNA methyltransferase  53.25 
 
 		 246 aa  258  6e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.427943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15301  tRNA/rRNA methyltransferase  48.79 
 
 		 245 aa  249  2e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.877523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0696  RNA methyltransferase TrmH, group 1  49.19 
 
 		 245 aa  246  2e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4224  TrmA family RNA methyltransferase  44.4 
 
 		 245 aa  206  2e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11611  tRNA/rRNA methyltransferase  38.1 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1407  RNA methyltransferase TrmH, group 1  43.6 
 
 		 243 aa  193  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1067  RNA methyltransferase TrmH, group 1  37.85 
 
 		 249 aa  193  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11621  tRNA/rRNA methyltransferase  36.51 
 
 		 250 aa  188  7e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0640948  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11471  tRNA/rRNA methyltransferase  34.14 
 
 		 236 aa  188  7e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1602  RNA methyltransferase TrmH, group 1  43.15 
 
 		 245 aa  176  2e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.289024  normal  0.479369 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2349  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  41.84 
 
 		 243 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2399  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  41.84 
 
 		 243 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0492  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  38.46 
 
 		 253 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3875  RNA methyltransferase  39.53 
 
 		 248 aa  169  3e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.250027  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1148  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36.18 
 
 		 262 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1550  RNA methyltransferase  36.99 
 
 		 244 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0671761  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0645  RNA methyltransferase  33.06 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0451004  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1258  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.41 
 
 		 245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00338281  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2030  RNA methyltransferase  34.26 
 
 		 245 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.433712  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1990  RNA methyltransferase TrmH, group 1  32.66 
 
 		 254 aa  112  5e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.25576  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5766  RNA methyltransferase  33.06 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0463  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.71 
 
 		 256 aa  110  3e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.74203  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2705  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.13 
 
 		 253 aa  110  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.29092 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1803  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  38.12 
 
 		 237 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2687  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  31.47 
 
 		 245 aa  106  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.491891  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1345  RNA methyltransferase  35.67 
 
 		 234 aa  105  5e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1369  RNA methyltransferase TrmH, group 1  32.39 
 
 		 248 aa  105  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000282911  hitchhiker  0.0000077591 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1340  RNA methyltransferase  33.82 
 
 		 254 aa  105  6e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.34341  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1475  RNA methyltransferase  32.13 
 
 		 255 aa  105  8e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1552  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  31.71 
 
 		 245 aa  104  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000140105 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1335  RNA methyltransferase  31.53 
 
 		 234 aa  102  5e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3144  RNA methyltransferase  32.79 
 
 		 245 aa  102  6e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317738  normal  0.930486 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0618  RNA methyltransferase  32.84 
 
 		 234 aa  102  7e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.570279  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4813  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  30.86 
 
 		 248 aa  101  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.695937  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0071  RNA methyltransferase  32.2 
 
 		 231 aa  101  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.17974  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2161  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  29.64 
 
 		 276 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0486585  normal  0.265451 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1843  RNA methyltransferase TrmH family, group 1  31.76 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3341  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  31.56 
 
 		 245 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3468  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  31.56 
 
 		 245 aa  99  6e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.19102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1950  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  29.25 
 
 		 276 aa  99.4  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.168874  normal  0.372622 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1773  RNA methyltransferase  29.96 
 
 		 254 aa  99  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.12594  hitchhiker  0.00165952 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1455  RNA methyltransferase TrmH, group 1  30.08 
 
 		 259 aa  99  7e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000119002  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1736  RNA methyltransferase  29.75 
 
 		 241 aa  97.8  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000887935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1155  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  31.6 
 
 		 266 aa  97.4  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.043355 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0974  RNA methyltransferase  32.11 
 
 		 253 aa  97.1  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2874  RNA methyltransferase  29.96 
 
 		 254 aa  96.7  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.718962  hitchhiker  0.0000000232974 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2152  RNA methyltransferase  30.17 
 
 		 241 aa  96.3  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0159142  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1297  RNA methyltransferase  28.34 
 
 		 257 aa  95.9  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2283  RNA methyltransferase  29.34 
 
 		 241 aa  95.9  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000130955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2320  RNA methyltransferase  30.96 
 
 		 252 aa  95.5  6e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000515226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1816  RNA methyltransferase  29.34 
 
 		 241 aa  95.9  6e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00001341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0828  RNA methyltransferase  28.81 
 
 		 275 aa  95.5  7e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.151565  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1915  tRNA/rRNA methyltransferase  29.76 
 
 		 286 aa  95.5  8e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2433  RNA methyltransferase TrmH, group 1  35.98 
 
 		 231 aa  95.5  8e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0066  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.89 
 
 		 231 aa  95.1  1e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0596195  hitchhiker  0.0096121 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2261  RNA methyltransferase  28.46 
 
 		 241 aa  94.7  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1513  putative tRNA/rRNA methyltransferase  30 
 
 		 255 aa  94  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.217497  normal  0.686219 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3506  RNA methyltransferase  28.8 
 
 		 240 aa  94  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.899672 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1711  hypothetical protein  30.35 
 
 		 257 aa  93.6  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1711  hypothetical protein  30.35 
 
 		 257 aa  93.6  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1290  RNA methyltransferase  28.4 
 
 		 240 aa  93.6  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0442169  normal  0.0143019 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3522  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.84 
 
 		 266 aa  93.2  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.391338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2632  RNA methyltransferase  29.75 
 
 		 250 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.192345 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1365  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  27.42 
 
 		 225 aa  92.8  5e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0441  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  28.28 
 
 		 248 aa  92  7e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1268  RNA methyltransferase  28.69 
 
 		 262 aa  92  8e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.681367  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1375  RNA methyltransferase  28.06 
 
 		 243 aa  91.7  9e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0566977  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1119  RNA methyltransferase  28.46 
 
 		 287 aa  91.3  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1958  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  30.36 
 
 		 242 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000144903  hitchhiker  0.00948062 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1594  SpoU rRNA methylase  29.67 
 
 		 243 aa  91.3  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1485  RNA methyltransferase  26.83 
 
 		 254 aa  90.9  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0403715  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2389  RNA methyltransferase  30.36 
 
 		 242 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000450659  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2161  RNA methyltransferase TrmH, group 1  31.58 
 
 		 246 aa  90.9  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00198375  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2117  RNA methyltransferase TrmH, group 1  35.12 
 
 		 239 aa  90.9  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2505  RNA methyltransferase  30.36 
 
 		 242 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000223047  normal  0.027536 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1322  RNA methyltransferase  26.61 
 
 		 254 aa  90.5  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000628419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1577  RNA methyltransferase TrmH, group 1  30.43 
 
 		 410 aa  90.1  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.68355  normal  0.0119734 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0279  tRNA/rRNA methyltransferase  26.78 
 
 		 246 aa  90.1  3e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1795  RNA methyltransferase  28.57 
 
 		 249 aa  89.7  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.313918  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2400  RNA methyltransferase  30.24 
 
 		 242 aa  89.7  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000262197  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1196  RNA methyltransferase  30.04 
 
 		 276 aa  89.4  5e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2610  RNA methyltransferase  29.8 
 
 		 247 aa  89  6e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40430  RNA methyltransferase TrmH, group 1  30.28 
 
 		 258 aa  89  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.573027  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1158  RNA methyltransferase  30.04 
 
 		 291 aa  89  6e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.357934  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1411  RNA methyltransferase  26.32 
 
 		 267 aa  88.6  8e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.993978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004362  tRNA:Cm32/Um32 methyltransferase  27.38 
 
 		 239 aa  88.6  8e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00237949  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2427  RNA methyltransferase  28.51 
 
 		 240 aa  88.6  9e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1009  RNA methyltransferase TrmH, group 1  29.32 
 
 		 251 aa  88.2  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.197865  normal  0.0384423 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2846  RNA methyltransferase TrmH, group 1  28.33 
 
 		 274 aa  88.6  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5993  RNA methyltransferase TrmH, group 1  29.51 
 
 		 289 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2084  RNA methyltransferase  29.51 
 
 		 289 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00462385  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4570  RNA methyltransferase  31.56 
 
 		 298 aa  87.8  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0223529  normal  0.0756262 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0569  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  28.16 
 
 		 254 aa  87.4  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4951  putative RNA methyltransferase  31.28 
 
 		 228 aa  86.7  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1336  RNA methyltransferase TrmH, group 1  26.69 
 
 		 249 aa  86.7  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3698  RNA methyltransferase  29.84 
 
 		 246 aa  86.7  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274562  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4361  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  31.74 
 
 		 399 aa  86.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.989023  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>