More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_08981 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_08981  tRNA/rRNA methyltransferase  100 
 
 		 249 aa  503  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.723919 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1949  RNA methyltransferase TrmH, group 1  65.56 
 
 		 243 aa  294  7e-79  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11341  tRNA/rRNA methyltransferase  55.92 
 
 		 246 aa  290  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.427943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15301  tRNA/rRNA methyltransferase  50.63 
 
 		 245 aa  259  3e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.877523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0696  RNA methyltransferase TrmH, group 1  51.27 
 
 		 245 aa  257  1e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0716  tRNA/rRNA methyltransferase  60.16 
 
 		 253 aa  255  5e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11611  tRNA/rRNA methyltransferase  43.22 
 
 		 250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1067  RNA methyltransferase TrmH, group 1  42.8 
 
 		 249 aa  213  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11471  tRNA/rRNA methyltransferase  40.6 
 
 		 236 aa  212  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11621  tRNA/rRNA methyltransferase  42.8 
 
 		 250 aa  208  8e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0640948  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4224  TrmA family RNA methyltransferase  45.38 
 
 		 245 aa  203  2e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3875  RNA methyltransferase  47.33 
 
 		 248 aa  202  3e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.250027  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1602  RNA methyltransferase TrmH, group 1  46.64 
 
 		 245 aa  197  1.0000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.289024  normal  0.479369 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0492  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  43.88 
 
 		 253 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1407  RNA methyltransferase TrmH, group 1  45.57 
 
 		 243 aa  193  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1148  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  43.1 
 
 		 262 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2349  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  44.72 
 
 		 243 aa  189  5e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2399  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  43.8 
 
 		 243 aa  188  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1550  RNA methyltransferase  36.8 
 
 		 244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0671761  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1990  RNA methyltransferase TrmH, group 1  34.62 
 
 		 254 aa  125  7e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.25576  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1258  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  39.48 
 
 		 245 aa  124  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00338281  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2705  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.51 
 
 		 253 aa  124  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.29092 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1369  RNA methyltransferase TrmH, group 1  36.48 
 
 		 248 aa  124  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000282911  hitchhiker  0.0000077591 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0645  RNA methyltransferase  35.48 
 
 		 251 aa  122  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0451004  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1475  RNA methyltransferase  34.47 
 
 		 255 aa  118  9e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3341  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  33.77 
 
 		 245 aa  118  9e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1773  RNA methyltransferase  31.97 
 
 		 254 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.12594  hitchhiker  0.00165952 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3468  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  33.33 
 
 		 245 aa  116  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.19102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2030  RNA methyltransferase  34.76 
 
 		 245 aa  116  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.433712  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3144  RNA methyltransferase  32.9 
 
 		 245 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317738  normal  0.930486 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1594  SpoU rRNA methylase  35.71 
 
 		 243 aa  115  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0974  RNA methyltransferase  34.91 
 
 		 253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2433  RNA methyltransferase TrmH, group 1  31.56 
 
 		 231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2687  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  32.34 
 
 		 245 aa  113  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.491891  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2152  RNA methyltransferase  30.96 
 
 		 241 aa  113  3e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0159142  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2320  RNA methyltransferase  32.89 
 
 		 252 aa  113  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000515226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2874  RNA methyltransferase  31.65 
 
 		 254 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.718962  hitchhiker  0.0000000232974 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3506  RNA methyltransferase  33.61 
 
 		 240 aa  112  8.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.899672 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2261  RNA methyltransferase  30.38 
 
 		 241 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0569  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.47 
 
 		 254 aa  110  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1485  RNA methyltransferase  30.8 
 
 		 254 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0403715  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1843  RNA methyltransferase TrmH family, group 1  33.98 
 
 		 257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1736  RNA methyltransferase  30.25 
 
 		 241 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000887935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1816  RNA methyltransferase  30.25 
 
 		 241 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00001341  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1552  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  32.34 
 
 		 245 aa  108  6e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000140105 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2283  RNA methyltransferase  30.25 
 
 		 241 aa  108  6e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000130955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1119  RNA methyltransferase  31.66 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0441  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  31.9 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1340  RNA methyltransferase  40 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.34341  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2505  RNA methyltransferase  31.51 
 
 		 242 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000223047  normal  0.027536 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1958  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  31.51 
 
 		 242 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000144903  hitchhiker  0.00948062 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5766  RNA methyltransferase  32.48 
 
 		 261 aa  106  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0618  RNA methyltransferase  39.62 
 
 		 234 aa  106  3e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.570279  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2389  RNA methyltransferase  31.51 
 
 		 242 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000450659  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1268  RNA methyltransferase  32.78 
 
 		 262 aa  106  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.681367  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1335  RNA methyltransferase  38.99 
 
 		 234 aa  105  5e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2400  RNA methyltransferase  31.09 
 
 		 242 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000262197  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1711  hypothetical protein  32.08 
 
 		 257 aa  105  6e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0066  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.78 
 
 		 231 aa  105  6e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0596195  hitchhiker  0.0096121 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2427  RNA methyltransferase  30.87 
 
 		 240 aa  105  6e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1290  RNA methyltransferase  30.93 
 
 		 240 aa  105  6e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0442169  normal  0.0143019 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2610  RNA methyltransferase  33.19 
 
 		 247 aa  105  7e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2161  RNA methyltransferase TrmH, group 1  33.62 
 
 		 246 aa  105  8e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00198375  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1803  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  40.26 
 
 		 237 aa  104  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1345  RNA methyltransferase  37.74 
 
 		 234 aa  105  1e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1711  hypothetical protein  31.67 
 
 		 257 aa  104  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1455  RNA methyltransferase TrmH, group 1  30.8 
 
 		 259 aa  104  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000119002  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1155  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.6 
 
 		 266 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.043355 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0463  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.06 
 
 		 256 aa  104  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.74203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1795  RNA methyltransferase  30.67 
 
 		 249 aa  103  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.313918  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4813  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  31.17 
 
 		 248 aa  103  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.695937  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1411  RNA methyltransferase  29.83 
 
 		 267 aa  103  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.993978  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2161  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  32.19 
 
 		 276 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0486585  normal  0.265451 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1915  tRNA/rRNA methyltransferase  31.03 
 
 		 286 aa  101  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1420  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  32.64 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1578  RNA methyltransferase  33.48 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.373161  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3731  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.58 
 
 		 398 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.804508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1336  RNA methyltransferase TrmH, group 1  31.67 
 
 		 249 aa  100  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1235  RNA methyltransferase  31.42 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.207917  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1635  tRNA/rRNA methyltransferase  33.48 
 
 		 263 aa  100  3e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1950  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  30.9 
 
 		 276 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.168874  normal  0.372622 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1517  RNA methyltransferase  31.03 
 
 		 276 aa  99  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.9954 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1234  RNA methyltransferase TrmH, group 1  32.92 
 
 		 254 aa  99  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.600347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1301  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  32.23 
 
 		 249 aa  98.6  7e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.375594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1297  RNA methyltransferase  30.17 
 
 		 257 aa  98.6  8e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0071  RNA methyltransferase  28.75 
 
 		 231 aa  98.6  9e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.17974  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2076  RNA methyltransferase  27.31 
 
 		 260 aa  98.2  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.780076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1577  RNA methyltransferase TrmH, group 1  30.7 
 
 		 410 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.68355  normal  0.0119734 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1738  RNA methyltransferase TrmH, group 1  33.77 
 
 		 397 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1375  RNA methyltransferase  30.08 
 
 		 243 aa  97.8  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0566977  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0279  tRNA/rRNA methyltransferase  30 
 
 		 246 aa  97.4  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1365  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  27.35 
 
 		 225 aa  97.1  3e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2187  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  32 
 
 		 271 aa  97.1  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1158  RNA methyltransferase  30.93 
 
 		 291 aa  96.7  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.357934  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1196  RNA methyltransferase  30.93 
 
 		 276 aa  96.7  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0828  RNA methyltransferase  30.51 
 
 		 275 aa  96.3  4e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.151565  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2746  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.06 
 
 		 256 aa  96.3  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.504131  normal  0.782476 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40430  RNA methyltransferase TrmH, group 1  31.54 
 
 		 258 aa  95.9  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.573027  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4361  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  30.7 
 
 		 399 aa  95.5  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.989023  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4615  RNA methyltransferase TrmH, group 1  32.64 
 
 		 264 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00452302  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>