296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1594 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1594  SpoU rRNA methylase  100 
 
 		 243 aa  493  1e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2433  RNA methyltransferase TrmH, group 1  60.43 
 
 		 231 aa  311  4.999999999999999e-84  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1301  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  50.45 
 
 		 249 aa  237  1e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.375594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1009  RNA methyltransferase TrmH, group 1  46.49 
 
 		 251 aa  230  2e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.197865  normal  0.0384423 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1375  RNA methyltransferase  50.21 
 
 		 243 aa  230  2e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0566977  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0861  RNA methyltransferase  48.21 
 
 		 261 aa  224  7e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.242897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0768  RNA methyltransferase  47.58 
 
 		 232 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00615258  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1137  hypothetical protein  48.03 
 
 		 248 aa  218  5e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.836144 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0043  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  43.11 
 
 		 235 aa  196  2.0000000000000003e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2656  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  38.56 
 
 		 237 aa  168  7e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3609  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  40.85 
 
 		 263 aa  164  8e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.653883  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1842  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  40.76 
 
 		 255 aa  161  8.000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1382  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  40.09 
 
 		 290 aa  150  1e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.663649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2774  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.42 
 
 		 241 aa  150  3e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0726338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0071  RNA methyltransferase  36.32 
 
 		 231 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.17974  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1345  RNA methyltransferase  35.44 
 
 		 234 aa  144  1e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0618  RNA methyltransferase  34.76 
 
 		 234 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.570279  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1335  RNA methyltransferase  34.76 
 
 		 234 aa  138  7e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1550  RNA methyltransferase  38.02 
 
 		 244 aa  138  7.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0671761  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2030  RNA methyltransferase  39.06 
 
 		 245 aa  138  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.433712  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1340  RNA methyltransferase  34.19 
 
 		 254 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.34341  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1475  RNA methyltransferase  38.91 
 
 		 255 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0615  RNA methyltransferase TrmH, group 1  36.67 
 
 		 268 aa  134  9.999999999999999e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000217405  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4615  RNA methyltransferase TrmH, group 1  36.11 
 
 		 264 aa  133  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00452302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0812  RNA methyltransferase TrmH, group 1  37.08 
 
 		 251 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000476063  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4224  TrmA family RNA methyltransferase  39.68 
 
 		 245 aa  132  6e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1279  RNA methyltransferase  36.71 
 
 		 240 aa  130  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14690  putative methyltransferase  34.82 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2076  RNA methyltransferase  36.21 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.780076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0715  hypothetical tRNA/rRNA methyltransferase  38.08 
 
 		 242 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2349  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  38.53 
 
 		 243 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2399  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  38.53 
 
 		 243 aa  129  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2687  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.15 
 
 		 245 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.491891  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4339  RNA methyltransferase  36.1 
 
 		 251 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000160755 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3875  RNA methyltransferase  41.18 
 
 		 248 aa  129  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.250027  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1552  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.42 
 
 		 245 aa  129  6e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000140105 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0839  RNA methyltransferase  35.27 
 
 		 251 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.742035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1296  putative methyltransferase  34.82 
 
 		 308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3506  RNA methyltransferase  35.83 
 
 		 240 aa  127  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.899672 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0869  RNA methyltransferase  35.27 
 
 		 279 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164985  normal  0.267349 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0882  RNA methyltransferase  35.27 
 
 		 251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00955273 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2745  RNA methyltransferase  37.25 
 
 		 243 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00735302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1230  rRNA methylase, SpoU family  36.82 
 
 		 240 aa  126  3e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.420687  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2610  RNA methyltransferase  37.61 
 
 		 247 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2807  RNA methyltransferase  37.25 
 
 		 243 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0201876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2700  RNA methyltransferase  37.25 
 
 		 243 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000906061  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0827  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.95 
 
 		 245 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.293121 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2786  RNA methyltransferase  37.25 
 
 		 243 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000395932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1369  RNA methyltransferase TrmH, group 1  36.75 
 
 		 248 aa  125  6e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000282911  hitchhiker  0.0000077591 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1635  tRNA/rRNA methyltransferase  33.05 
 
 		 263 aa  125  8.000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0492  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36.1 
 
 		 253 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1407  RNA methyltransferase TrmH, group 1  38.89 
 
 		 243 aa  124  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3629  RNA methyltransferase  34.68 
 
 		 244 aa  124  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1235  RNA methyltransferase  35.15 
 
 		 241 aa  124  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.207917  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2920  RNA methyltransferase  36.84 
 
 		 243 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0175386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40430  RNA methyltransferase TrmH, group 1  35.22 
 
 		 258 aa  124  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.573027  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1274  RNA methyltransferase  34.29 
 
 		 257 aa  123  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000271019  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1166  RNA methyltransferase  35.1 
 
 		 257 aa  123  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000032697  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0437  RNA methyltransferase  35.1 
 
 		 257 aa  123  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.293753  hitchhiker  0.0000675678 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2846  RNA methyltransferase TrmH, group 1  34.41 
 
 		 274 aa  124  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5993  RNA methyltransferase TrmH, group 1  36.73 
 
 		 289 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2084  RNA methyltransferase  36.73 
 
 		 289 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00462385  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3514  RNA methyltransferase  34.94 
 
 		 262 aa  123  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1578  RNA methyltransferase  32.64 
 
 		 263 aa  123  3e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.373161  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1234  RNA methyltransferase TrmH, group 1  34.43 
 
 		 254 aa  123  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.600347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1197  RNA methyltransferase  37.13 
 
 		 289 aa  123  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0280134 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1242  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.85 
 
 		 241 aa  122  4e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.626014  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1989  RNA methyltransferase  36.07 
 
 		 273 aa  122  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.418465 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02424  predicted methyltransferase  36.84 
 
 		 246 aa  122  5e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.438411  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1136  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36.84 
 
 		 246 aa  122  5e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.631773  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1420  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.01 
 
 		 257 aa  122  5e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1145  RNA methyltransferase  36.84 
 
 		 246 aa  122  5e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0763368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2907  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36.84 
 
 		 246 aa  122  5e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000722285  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02388  hypothetical protein  36.84 
 
 		 246 aa  122  5e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.373948  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3033  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.85 
 
 		 241 aa  122  5e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0996868  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2684  RNA methyltransferase  36.84 
 
 		 246 aa  122  5e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000664328  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2119  RNA methyltransferase  36.07 
 
 		 273 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2817  RNA methyltransferase  36.84 
 
 		 245 aa  122  5e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000707701  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2685  RNA methyltransferase  36.84 
 
 		 246 aa  122  5e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0309108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3764  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36.84 
 
 		 245 aa  122  5e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000603217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1602  RNA methyltransferase TrmH, group 1  33.73 
 
 		 245 aa  122  6e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.289024  normal  0.479369 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1148  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  37.34 
 
 		 262 aa  122  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1646  RNA methyltransferase TrmH, group 1  32.92 
 
 		 247 aa  122  7e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1396  RNA methyltransferase  36.6 
 
 		 276 aa  121  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.901296  hitchhiker  0.00503729 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004362  tRNA:Cm32/Um32 methyltransferase  33.47 
 
 		 239 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00237949  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5390  RNA methyltransferase TrmH, group 1  35.92 
 
 		 289 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1258  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.47 
 
 		 245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00338281  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1119  RNA methyltransferase  33.2 
 
 		 287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2103  RNA methyltransferase  36.33 
 
 		 289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.247201 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1711  hypothetical protein  32.5 
 
 		 257 aa  119  3e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01352  putative tRNA/rRNA methyltransferase (trmH family) protein  35.8 
 
 		 261 aa  119  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0228097  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3029  RNA methyltransferase  36.51 
 
 		 244 aa  120  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00120237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1411  RNA methyltransferase  31.75 
 
 		 267 aa  119  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.993978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1161  RNA methyltransferase TrmH, group 1  34.91 
 
 		 256 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000875813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1843  RNA methyltransferase TrmH family, group 1  35.8 
 
 		 257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01053  rRNA methylase  32.23 
 
 		 239 aa  119  4.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1711  hypothetical protein  32.08 
 
 		 257 aa  118  7.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1663  RNA methyltransferase  34.89 
 
 		 306 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165856  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2753  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.29 
 
 		 244 aa  118  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0620173  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1322  RNA methyltransferase  32.92 
 
 		 254 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000628419  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>