More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0043 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0043  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  100 
 
 		 235 aa  484  1e-136  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1594  SpoU rRNA methylase  43.11 
 
 		 243 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2433  RNA methyltransferase TrmH, group 1  41.59 
 
 		 231 aa  184  9e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1137  hypothetical protein  45.09 
 
 		 248 aa  180  2e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.836144 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1375  RNA methyltransferase  35.98 
 
 		 243 aa  180  2e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0566977  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0768  RNA methyltransferase  39.06 
 
 		 232 aa  171  7.999999999999999e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00615258  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0071  RNA methyltransferase  38.26 
 
 		 231 aa  170  1e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.17974  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0618  RNA methyltransferase  37.02 
 
 		 234 aa  170  2e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.570279  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0861  RNA methyltransferase  39.57 
 
 		 261 aa  170  2e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.242897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1335  RNA methyltransferase  36.6 
 
 		 234 aa  168  6e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1345  RNA methyltransferase  38.1 
 
 		 234 aa  167  1e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1009  RNA methyltransferase TrmH, group 1  38.39 
 
 		 251 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.197865  normal  0.0384423 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1340  RNA methyltransferase  37.23 
 
 		 254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.34341  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2656  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.78 
 
 		 237 aa  160  2e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1842  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  37.29 
 
 		 255 aa  156  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3609  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  37.23 
 
 		 263 aa  155  4e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.653883  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1301  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36 
 
 		 249 aa  151  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.375594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2774  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.06 
 
 		 241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0726338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1382  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  33.19 
 
 		 290 aa  134  9.999999999999999e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.663649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0545  RNA methyltransferase  31.33 
 
 		 257 aa  122  7e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2030  RNA methyltransferase  33.76 
 
 		 245 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.433712  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1258  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  31.12 
 
 		 245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00338281  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1803  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  38.96 
 
 		 237 aa  113  3e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1475  RNA methyltransferase  32.22 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1369  RNA methyltransferase TrmH, group 1  34.03 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000282911  hitchhiker  0.0000077591 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1411  RNA methyltransferase  30.67 
 
 		 267 aa  106  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.993978  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1552  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  29.8 
 
 		 245 aa  105  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000140105 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2687  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  29.8 
 
 		 245 aa  105  7e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.491891  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4615  RNA methyltransferase TrmH, group 1  29.75 
 
 		 264 aa  103  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00452302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2076  RNA methyltransferase  31.51 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.780076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1843  RNA methyltransferase TrmH family, group 1  31.36 
 
 		 257 aa  103  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1297  RNA methyltransferase  30.83 
 
 		 257 aa  103  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69308  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4224  TrmA family RNA methyltransferase  30.89 
 
 		 245 aa  103  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3033  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  32.64 
 
 		 241 aa  102  6e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0996868  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0066  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.71 
 
 		 231 aa  101  8e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0596195  hitchhiker  0.0096121 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1102  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  31.98 
 
 		 249 aa  101  9e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0245796  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1550  RNA methyltransferase  32.08 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0671761  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3670  putative RNA methyltransferase  32.11 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1736  RNA methyltransferase  31.33 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000887935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3864  putative RNA methyltransferase  32.11 
 
 		 228 aa  100  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000175162  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0682  putative RNA methyltransferase  31.16 
 
 		 228 aa  99.8  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000176803  normal  0.146747 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2624  RNA methyltransferase  30.21 
 
 		 260 aa  99.4  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3629  RNA methyltransferase  32.22 
 
 		 244 aa  99.4  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3658  putative RNA methyltransferase  28.45 
 
 		 226 aa  99  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1816  RNA methyltransferase  31.47 
 
 		 241 aa  99.4  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00001341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1578  RNA methyltransferase  28.63 
 
 		 263 aa  98.6  7e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.373161  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1242  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  32.22 
 
 		 241 aa  98.6  7e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.626014  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3522  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.6 
 
 		 266 aa  98.6  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.391338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1635  tRNA/rRNA methyltransferase  28.63 
 
 		 263 aa  98.6  7e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0492  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  27.69 
 
 		 253 aa  98.6  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02424  predicted methyltransferase  34.78 
 
 		 246 aa  98.6  8e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.438411  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1136  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.78 
 
 		 246 aa  98.6  8e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.631773  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1145  RNA methyltransferase  34.78 
 
 		 246 aa  98.6  8e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0763368  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02388  hypothetical protein  34.78 
 
 		 246 aa  98.6  8e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.373948  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2817  RNA methyltransferase  34.78 
 
 		 245 aa  98.6  8e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000707701  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2907  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.78 
 
 		 246 aa  98.6  8e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000722285  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3514  RNA methyltransferase  27.89 
 
 		 262 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2685  RNA methyltransferase  34.78 
 
 		 246 aa  98.6  8e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0309108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2684  RNA methyltransferase  34.78 
 
 		 246 aa  98.6  8e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000664328  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2427  RNA methyltransferase  31.12 
 
 		 240 aa  98.6  8e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3764  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.78 
 
 		 245 aa  98.6  8e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000603217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2745  RNA methyltransferase  34.24 
 
 		 243 aa  98.2  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00735302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2807  RNA methyltransferase  34.24 
 
 		 243 aa  98.2  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0201876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1279  RNA methyltransferase  31.28 
 
 		 240 aa  98.2  9e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2700  RNA methyltransferase  34.24 
 
 		 243 aa  98.2  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000906061  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2786  RNA methyltransferase  34.24 
 
 		 243 aa  98.2  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000395932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14690  putative methyltransferase  28.63 
 
 		 257 aa  98.2  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1230  rRNA methylase, SpoU family  31.28 
 
 		 240 aa  97.8  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.420687  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2349  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  28.1 
 
 		 243 aa  97.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2283  RNA methyltransferase  31.03 
 
 		 241 aa  98.2  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000130955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1119  RNA methyltransferase  28.29 
 
 		 287 aa  97.8  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2261  RNA methyltransferase  31.03 
 
 		 241 aa  97.1  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1407  RNA methyltransferase TrmH, group 1  30.58 
 
 		 243 aa  97.1  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1296  putative methyltransferase  28.63 
 
 		 308 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2920  RNA methyltransferase  33.7 
 
 		 243 aa  96.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0175386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2320  RNA methyltransferase  30.2 
 
 		 252 aa  96.7  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000515226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2399  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  28.1 
 
 		 243 aa  96.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2152  RNA methyltransferase  30.49 
 
 		 241 aa  96.3  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0159142  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01352  putative tRNA/rRNA methyltransferase (trmH family) protein  31.09 
 
 		 261 aa  96.7  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0228097  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3875  RNA methyltransferase  27.64 
 
 		 248 aa  96.7  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.250027  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1290  RNA methyltransferase  33.07 
 
 		 240 aa  96.7  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0442169  normal  0.0143019 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0279  tRNA/rRNA methyltransferase  34.62 
 
 		 246 aa  96.3  4e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1577  RNA methyltransferase TrmH, group 1  28.81 
 
 		 410 aa  95.9  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.68355  normal  0.0119734 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1155  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  27.8 
 
 		 266 aa  95.9  5e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.043355 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2161  RNA methyltransferase TrmH, group 1  27.31 
 
 		 246 aa  95.5  7e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00198375  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3506  RNA methyltransferase  30.04 
 
 		 240 aa  95.1  8e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.899672 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40430  RNA methyltransferase TrmH, group 1  28.75 
 
 		 258 aa  95.1  8e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.573027  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0839  RNA methyltransferase  28.94 
 
 		 251 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.742035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3029  RNA methyltransferase  33.7 
 
 		 244 aa  95.1  9e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00120237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0882  RNA methyltransferase  29.36 
 
 		 251 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00955273 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4339  RNA methyltransferase  29.36 
 
 		 251 aa  94.7  9e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000160755 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1711  hypothetical protein  31.17 
 
 		 257 aa  94.4  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1711  hypothetical protein  31.17 
 
 		 257 aa  94.4  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1235  RNA methyltransferase  31.36 
 
 		 241 aa  94.4  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.207917  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1773  RNA methyltransferase  31.1 
 
 		 254 aa  93.6  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.12594  hitchhiker  0.00165952 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2187  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  28.86 
 
 		 271 aa  93.6  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004362  tRNA:Cm32/Um32 methyltransferase  30.38 
 
 		 239 aa  94  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00237949  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0869  RNA methyltransferase  29.36 
 
 		 279 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164985  normal  0.267349 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0819  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  32.5 
 
 		 256 aa  94.4  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0412147  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2705  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  28.09 
 
 		 253 aa  93.6  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.29092 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>