More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2656 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2656  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  100 
 
 		 237 aa  482  1e-135  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2774  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  70.04 
 
 		 241 aa  351  5e-96  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0726338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1842  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  61.54 
 
 		 255 aa  296  2e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1382  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  64.6 
 
 		 290 aa  296  3e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.663649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3609  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  59.4 
 
 		 263 aa  291  6e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.653883  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1594  SpoU rRNA methylase  38.56 
 
 		 243 aa  168  6e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2433  RNA methyltransferase TrmH, group 1  39.24 
 
 		 231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0043  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.78 
 
 		 235 aa  160  2e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1137  hypothetical protein  37.02 
 
 		 248 aa  158  8e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.836144 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0768  RNA methyltransferase  39.66 
 
 		 232 aa  156  3e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00615258  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1301  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  39.15 
 
 		 249 aa  155  4e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.375594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1009  RNA methyltransferase TrmH, group 1  36.44 
 
 		 251 aa  155  6e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.197865  normal  0.0384423 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0861  RNA methyltransferase  38.56 
 
 		 261 aa  152  4e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.242897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1375  RNA methyltransferase  36.78 
 
 		 243 aa  150  2e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0566977  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0071  RNA methyltransferase  35.06 
 
 		 231 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.17974  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2427  RNA methyltransferase  33.33 
 
 		 240 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2320  RNA methyltransferase  32.38 
 
 		 252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000515226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1816  RNA methyltransferase  32.08 
 
 		 241 aa  119  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00001341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1345  RNA methyltransferase  31.51 
 
 		 234 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2283  RNA methyltransferase  32.08 
 
 		 241 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000130955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1736  RNA methyltransferase  32.08 
 
 		 241 aa  119  6e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000887935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1485  RNA methyltransferase  32.81 
 
 		 254 aa  119  6e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0403715  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2505  RNA methyltransferase  33.06 
 
 		 242 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000223047  normal  0.027536 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1958  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  33.06 
 
 		 242 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000144903  hitchhiker  0.00948062 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2400  RNA methyltransferase  33.73 
 
 		 242 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000262197  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2389  RNA methyltransferase  33.06 
 
 		 242 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000450659  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2152  RNA methyltransferase  32.38 
 
 		 241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0159142  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2261  RNA methyltransferase  31.67 
 
 		 241 aa  116  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1235  RNA methyltransferase  33.74 
 
 		 241 aa  116  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.207917  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2874  RNA methyltransferase  32.14 
 
 		 254 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.718962  hitchhiker  0.0000000232974 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1335  RNA methyltransferase  32.05 
 
 		 234 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3506  RNA methyltransferase  34.3 
 
 		 240 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.899672 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2076  RNA methyltransferase  33.2 
 
 		 260 aa  113  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.780076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1773  RNA methyltransferase  30.56 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.12594  hitchhiker  0.00165952 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01352  putative tRNA/rRNA methyltransferase (trmH family) protein  32.79 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0228097  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1290  RNA methyltransferase  32.08 
 
 		 240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0442169  normal  0.0143019 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02424  predicted methyltransferase  31.17 
 
 		 246 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.438411  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1136  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  31.17 
 
 		 246 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.631773  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02388  hypothetical protein  31.17 
 
 		 246 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.373948  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2907  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  31.17 
 
 		 246 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000722285  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2685  RNA methyltransferase  31.17 
 
 		 246 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0309108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2684  RNA methyltransferase  31.17 
 
 		 246 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000664328  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2745  RNA methyltransferase  31.58 
 
 		 243 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00735302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3764  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  31.17 
 
 		 245 aa  112  5e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000603217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3629  RNA methyltransferase  31.82 
 
 		 244 aa  112  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1145  RNA methyltransferase  31.17 
 
 		 246 aa  112  5e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0763368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2817  RNA methyltransferase  31.17 
 
 		 245 aa  112  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000707701  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2807  RNA methyltransferase  32.4 
 
 		 243 aa  112  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0201876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2700  RNA methyltransferase  32.4 
 
 		 243 aa  112  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000906061  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0618  RNA methyltransferase  33.76 
 
 		 234 aa  111  9e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.570279  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2920  RNA methyltransferase  32.4 
 
 		 243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0175386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2687  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.71 
 
 		 245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.491891  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4224  TrmA family RNA methyltransferase  32.79 
 
 		 245 aa  110  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2786  RNA methyltransferase  32.4 
 
 		 243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000395932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1274  RNA methyltransferase  31.4 
 
 		 257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000271019  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1407  RNA methyltransferase TrmH, group 1  36.51 
 
 		 243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0437  RNA methyltransferase  31.4 
 
 		 257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.293753  hitchhiker  0.0000675678 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4615  RNA methyltransferase TrmH, group 1  32.14 
 
 		 264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00452302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1455  RNA methyltransferase TrmH, group 1  29.66 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000119002  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1166  RNA methyltransferase  31.4 
 
 		 257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000032697  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2030  RNA methyltransferase  34.45 
 
 		 245 aa  110  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.433712  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004362  tRNA:Cm32/Um32 methyltransferase  31.98 
 
 		 239 aa  109  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00237949  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01053  rRNA methylase  32.11 
 
 		 239 aa  109  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1340  RNA methyltransferase  32.47 
 
 		 254 aa  108  5e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.34341  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3514  RNA methyltransferase  32.13 
 
 		 262 aa  107  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0819  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36.1 
 
 		 256 aa  108  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0412147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0670  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36.1 
 
 		 256 aa  108  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.373785  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3033  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  31.67 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0996868  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1552  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.6 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000140105 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1242  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  31.95 
 
 		 241 aa  106  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.626014  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1322  RNA methyltransferase  32.11 
 
 		 254 aa  106  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000628419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3875  RNA methyltransferase  31.69 
 
 		 248 aa  106  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.250027  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3029  RNA methyltransferase  32.27 
 
 		 244 aa  105  7e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00120237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0715  hypothetical tRNA/rRNA methyltransferase  31.69 
 
 		 242 aa  105  7e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2846  RNA methyltransferase TrmH, group 1  31.89 
 
 		 274 aa  105  8e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1369  RNA methyltransferase TrmH, group 1  34.75 
 
 		 248 aa  105  9e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000282911  hitchhiker  0.0000077591 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1102  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  30.13 
 
 		 249 aa  104  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0245796  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1420  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  33.33 
 
 		 257 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4339  RNA methyltransferase  31.17 
 
 		 251 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000160755 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1234  RNA methyltransferase TrmH, group 1  33.73 
 
 		 254 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.600347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3522  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.62 
 
 		 266 aa  104  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.391338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2753  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  30.58 
 
 		 244 aa  104  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0620173  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0869  RNA methyltransferase  32.11 
 
 		 279 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164985  normal  0.267349 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5766  RNA methyltransferase  32.63 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0882  RNA methyltransferase  32.11 
 
 		 251 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00955273 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1711  hypothetical protein  31.97 
 
 		 257 aa  103  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1711  hypothetical protein  31.97 
 
 		 257 aa  103  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1950  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  29.66 
 
 		 276 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.168874  normal  0.372622 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2062  tRNA/rRNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.86 
 
 		 247 aa  102  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.260682  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40430  RNA methyltransferase TrmH, group 1  32.93 
 
 		 258 aa  102  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.573027  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0839  RNA methyltransferase  31.71 
 
 		 251 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.742035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1258  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  33.19 
 
 		 245 aa  102  6e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00338281  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1843  RNA methyltransferase TrmH family, group 1  34.31 
 
 		 257 aa  102  6e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2161  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  29.96 
 
 		 276 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0486585  normal  0.265451 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1578  RNA methyltransferase  33.61 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.373161  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2161  RNA methyltransferase TrmH, group 1  33.2 
 
 		 246 aa  100  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00198375  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1990  RNA methyltransferase TrmH, group 1  32.66 
 
 		 254 aa  99.8  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.25576  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0279  tRNA/rRNA methyltransferase  29.84 
 
 		 246 aa  99.8  3e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1411  RNA methyltransferase  29.96 
 
 		 267 aa  99.4  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.993978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1577  RNA methyltransferase TrmH, group 1  31.88 
 
 		 410 aa  99.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.68355  normal  0.0119734 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>