266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1009 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1009  RNA methyltransferase TrmH, group 1  100 
 
 		 251 aa  520  1e-147  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.197865  normal  0.0384423 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0768  RNA methyltransferase  65.79 
 
 		 232 aa  332  5e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00615258  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0861  RNA methyltransferase  66.52 
 
 		 261 aa  323  2e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.242897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1301  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  62.2 
 
 		 249 aa  316  2e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.375594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1137  hypothetical protein  59.74 
 
 		 248 aa  293  3e-78  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.836144 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1594  SpoU rRNA methylase  46.49 
 
 		 243 aa  230  2e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2433  RNA methyltransferase TrmH, group 1  46.22 
 
 		 231 aa  219  3e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1375  RNA methyltransferase  41.49 
 
 		 243 aa  195  5.000000000000001e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0566977  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0043  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  38.39 
 
 		 235 aa  165  6.9999999999999995e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2656  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36.44 
 
 		 237 aa  155  7e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3609  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  38.89 
 
 		 263 aa  149  3e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.653883  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2774  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.31 
 
 		 241 aa  149  3e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0726338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1842  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  37.18 
 
 		 255 aa  148  9e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1382  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.45 
 
 		 290 aa  135  6.0000000000000005e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.663649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1345  RNA methyltransferase  33.19 
 
 		 234 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0618  RNA methyltransferase  33.92 
 
 		 234 aa  128  8.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.570279  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0071  RNA methyltransferase  34.67 
 
 		 231 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.17974  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1335  RNA methyltransferase  33.92 
 
 		 234 aa  125  5e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1340  RNA methyltransferase  33.48 
 
 		 254 aa  125  6e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.34341  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4224  TrmA family RNA methyltransferase  36.25 
 
 		 245 aa  124  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0545  RNA methyltransferase  32.3 
 
 		 257 aa  122  6e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2161  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  32.95 
 
 		 276 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0486585  normal  0.265451 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1407  RNA methyltransferase TrmH, group 1  36.51 
 
 		 243 aa  116  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1950  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  32.31 
 
 		 276 aa  116  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.168874  normal  0.372622 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1578  RNA methyltransferase  33.9 
 
 		 263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.373161  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1635  tRNA/rRNA methyltransferase  33.9 
 
 		 263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2349  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.47 
 
 		 243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1602  RNA methyltransferase TrmH, group 1  34.44 
 
 		 245 aa  113  3e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.289024  normal  0.479369 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2399  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.47 
 
 		 243 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3506  RNA methyltransferase  33.47 
 
 		 240 aa  112  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.899672 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1711  hypothetical protein  34.43 
 
 		 257 aa  112  5e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11341  tRNA/rRNA methyltransferase  34.15 
 
 		 246 aa  112  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.427943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1148  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  31.2 
 
 		 262 aa  112  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0839  RNA methyltransferase  33.33 
 
 		 251 aa  111  9e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.742035  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1711  hypothetical protein  34.02 
 
 		 257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0437  RNA methyltransferase  32.4 
 
 		 257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.293753  hitchhiker  0.0000675678 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0882  RNA methyltransferase  33.33 
 
 		 251 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00955273 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1274  RNA methyltransferase  32.4 
 
 		 257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000271019  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1166  RNA methyltransferase  32.4 
 
 		 257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000032697  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0492  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  33.59 
 
 		 253 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0869  RNA methyltransferase  33.33 
 
 		 279 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164985  normal  0.267349 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2517  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  32.13 
 
 		 353 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127237  hitchhiker  0.00000580733 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1234  RNA methyltransferase TrmH, group 1  32.38 
 
 		 254 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.600347  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1420  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  31.98 
 
 		 257 aa  108  6e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1620  RNA methyltransferase TrmH, group 1  31.7 
 
 		 278 aa  108  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.298646 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1485  RNA methyltransferase  31.58 
 
 		 254 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0403715  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1736  RNA methyltransferase  30.38 
 
 		 241 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000887935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4339  RNA methyltransferase  33.73 
 
 		 251 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000160755 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2874  RNA methyltransferase  31.06 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.718962  hitchhiker  0.0000000232974 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2261  RNA methyltransferase  30.38 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1411  RNA methyltransferase  31.65 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.993978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3629  RNA methyltransferase  32.91 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1816  RNA methyltransferase  30.38 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00001341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2283  RNA methyltransferase  30.38 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000130955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4615  RNA methyltransferase TrmH, group 1  31.2 
 
 		 264 aa  106  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00452302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1843  RNA methyltransferase TrmH family, group 1  31.84 
 
 		 257 aa  106  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2030  RNA methyltransferase  32.66 
 
 		 245 aa  106  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.433712  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1396  RNA methyltransferase  34.32 
 
 		 276 aa  105  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.901296  hitchhiker  0.00503729 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2119  RNA methyltransferase  33.6 
 
 		 273 aa  105  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5426  putative tRNA/rRNA methyltransferase  33.33 
 
 		 399 aa  105  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.138819 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1989  RNA methyltransferase  33.6 
 
 		 273 aa  105  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.418465 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2427  RNA methyltransferase  32.07 
 
 		 240 aa  105  6e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3875  RNA methyltransferase  34.02 
 
 		 248 aa  105  8e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.250027  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1119  RNA methyltransferase  32.11 
 
 		 287 aa  105  8e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2753  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  32.5 
 
 		 244 aa  105  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0620173  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5993  RNA methyltransferase TrmH, group 1  34.85 
 
 		 289 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2084  RNA methyltransferase  34.85 
 
 		 289 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00462385  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3514  RNA methyltransferase  32.41 
 
 		 262 aa  104  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2320  RNA methyltransferase  31.8 
 
 		 252 aa  105  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000515226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2103  RNA methyltransferase  32.68 
 
 		 289 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.247201 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1102  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  31.8 
 
 		 249 aa  103  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0245796  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1475  RNA methyltransferase  31.71 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0615  RNA methyltransferase TrmH, group 1  32.51 
 
 		 268 aa  103  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000217405  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1369  RNA methyltransferase TrmH, group 1  31.73 
 
 		 248 aa  102  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000282911  hitchhiker  0.0000077591 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1158  RNA methyltransferase  32.03 
 
 		 291 aa  102  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.357934  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1196  RNA methyltransferase  32.03 
 
 		 276 aa  102  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2632  RNA methyltransferase  34.18 
 
 		 250 aa  102  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.192345 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4813  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  33.76 
 
 		 248 aa  102  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.695937  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2786  RNA methyltransferase  32.38 
 
 		 243 aa  102  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000395932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1773  RNA methyltransferase  30.92 
 
 		 254 aa  102  8e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.12594  hitchhiker  0.00165952 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1995  RNA methyltransferase  32.19 
 
 		 281 aa  102  8e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.720646  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5390  RNA methyltransferase TrmH, group 1  32.81 
 
 		 289 aa  101  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1958  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  32.08 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000144903  hitchhiker  0.00948062 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2389  RNA methyltransferase  32.08 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000450659  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2505  RNA methyltransferase  32.08 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000223047  normal  0.027536 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1136  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  32.5 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.631773  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2685  RNA methyltransferase  32.5 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0309108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0670  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  32.95 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.373785  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2745  RNA methyltransferase  31.97 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00735302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3764  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  32.38 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000603217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2076  RNA methyltransferase  31.68 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.780076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2400  RNA methyltransferase  32.08 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000262197  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2604  RNA methyltransferase  33.33 
 
 		 311 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.574279  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2700  RNA methyltransferase  31.97 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000906061  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0819  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  32.95 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0412147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1145  RNA methyltransferase  32.5 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0763368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1440  RNA methyltransferase  33.33 
 
 		 303 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.302799  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0279  tRNA/rRNA methyltransferase  30.99 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2907  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  32.5 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000722285  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2807  RNA methyltransferase  31.97 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0201876  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>