More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2117 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2117  RNA methyltransferase TrmH, group 1  100 
 
 		 239 aa  488  1e-137  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1365  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  40.62 
 
 		 225 aa  148  8e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1411  RNA methyltransferase  35.39 
 
 		 267 aa  140  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.993978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1155  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36.07 
 
 		 266 aa  135  4e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.043355 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1711  hypothetical protein  34.87 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1711  hypothetical protein  34.87 
 
 		 257 aa  133  3e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3506  RNA methyltransferase  35.29 
 
 		 240 aa  133  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.899672 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2624  RNA methyltransferase  36.84 
 
 		 260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0615  RNA methyltransferase TrmH, group 1  36.89 
 
 		 268 aa  128  6e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000217405  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3810  hypothetical protein  39.08 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0410022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1235  RNA methyltransferase  36.78 
 
 		 241 aa  125  5e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.207917  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3829  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  37.97 
 
 		 243 aa  125  7e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.542381  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3522  RNA methyltransferase  37.97 
 
 		 243 aa  125  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0833085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1646  RNA methyltransferase TrmH, group 1  35.44 
 
 		 247 aa  125  8.000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1773  RNA methyltransferase  34.41 
 
 		 254 aa  125  9e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.12594  hitchhiker  0.00165952 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2874  RNA methyltransferase  35.22 
 
 		 254 aa  124  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.718962  hitchhiker  0.0000000232974 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2427  RNA methyltransferase  35.12 
 
 		 240 aa  124  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4615  RNA methyltransferase TrmH, group 1  33.86 
 
 		 264 aa  122  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00452302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1635  tRNA/rRNA methyltransferase  36.72 
 
 		 263 aa  120  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4224  TrmA family RNA methyltransferase  34.18 
 
 		 245 aa  121  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0941  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.34 
 
 		 250 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1578  RNA methyltransferase  36.72 
 
 		 263 aa  120  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.373161  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0492  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  33.76 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1455  RNA methyltransferase TrmH, group 1  33.2 
 
 		 259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000119002  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1736  RNA methyltransferase  34.89 
 
 		 241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000887935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01352  putative tRNA/rRNA methyltransferase (trmH family) protein  34.87 
 
 		 261 aa  119  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0228097  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2152  RNA methyltransferase  35.32 
 
 		 241 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0159142  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2433  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  37.61 
 
 		 258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.127939  normal  0.10084 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1816  RNA methyltransferase  34.89 
 
 		 241 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00001341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2320  RNA methyltransferase  33.89 
 
 		 252 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000515226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2283  RNA methyltransferase  34.47 
 
 		 241 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000130955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1407  RNA methyltransferase TrmH, group 1  37.5 
 
 		 243 aa  117  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1485  RNA methyltransferase  32.54 
 
 		 254 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0403715  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1279  RNA methyltransferase  33.33 
 
 		 240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2505  RNA methyltransferase  33.61 
 
 		 242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000223047  normal  0.027536 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1958  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  33.61 
 
 		 242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000144903  hitchhiker  0.00948062 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2389  RNA methyltransferase  33.61 
 
 		 242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000450659  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1119  RNA methyltransferase  33.87 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2076  RNA methyltransferase  34.17 
 
 		 260 aa  116  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.780076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1290  RNA methyltransferase  33.9 
 
 		 240 aa  116  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0442169  normal  0.0143019 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1234  RNA methyltransferase TrmH, group 1  33.87 
 
 		 254 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.600347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2400  RNA methyltransferase  33.61 
 
 		 242 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000262197  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1336  RNA methyltransferase TrmH, group 1  35.56 
 
 		 249 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2746  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.98 
 
 		 256 aa  115  5e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.504131  normal  0.782476 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3514  RNA methyltransferase  33.6 
 
 		 262 aa  115  5e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2261  RNA methyltransferase  34.18 
 
 		 241 aa  115  6e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2687  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.45 
 
 		 245 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.491891  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1550  RNA methyltransferase  34.05 
 
 		 244 aa  115  8.999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0671761  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3629  RNA methyltransferase  33.2 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1990  RNA methyltransferase TrmH, group 1  36.6 
 
 		 254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.25576  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0839  RNA methyltransferase  31.3 
 
 		 251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.742035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2399  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.89 
 
 		 243 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0869  RNA methyltransferase  31.3 
 
 		 279 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164985  normal  0.267349 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1513  putative tRNA/rRNA methyltransferase  36.29 
 
 		 255 aa  113  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.217497  normal  0.686219 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2349  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.89 
 
 		 243 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0819  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  37.68 
 
 		 256 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0412147  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1420  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  32.67 
 
 		 257 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1133  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.47 
 
 		 253 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0670  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  37.68 
 
 		 256 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.373785  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0882  RNA methyltransferase  31.3 
 
 		 251 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00955273 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3875  RNA methyltransferase  34.6 
 
 		 248 aa  112  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.250027  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1230  rRNA methylase, SpoU family  32.91 
 
 		 240 aa  112  6e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.420687  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2610  RNA methyltransferase  36.82 
 
 		 247 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1552  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.03 
 
 		 245 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000140105 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40430  RNA methyltransferase TrmH, group 1  33.07 
 
 		 258 aa  111  9e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.573027  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14690  putative methyltransferase  41.77 
 
 		 257 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2243  tRNA/rRNA methyltransferase  34.63 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.425244  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1102  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  31.93 
 
 		 249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0245796  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2030  RNA methyltransferase  33.63 
 
 		 245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.433712  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0645  RNA methyltransferase  33.05 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0451004  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2846  RNA methyltransferase TrmH, group 1  34.68 
 
 		 274 aa  109  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1258  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36.52 
 
 		 245 aa  109  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00338281  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1296  putative methyltransferase  41.77 
 
 		 308 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4339  RNA methyltransferase  31.98 
 
 		 251 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000160755 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1274  RNA methyltransferase  32.27 
 
 		 257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000271019  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1166  RNA methyltransferase  32.27 
 
 		 257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000032697  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0437  RNA methyltransferase  32.27 
 
 		 257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.293753  hitchhiker  0.0000675678 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3029  RNA methyltransferase  33.87 
 
 		 244 aa  109  4.0000000000000004e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00120237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1322  RNA methyltransferase  31.63 
 
 		 254 aa  108  6e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000628419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2949  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.96 
 
 		 239 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.226864 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004362  tRNA:Cm32/Um32 methyltransferase  31.82 
 
 		 239 aa  107  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00237949  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1369  RNA methyltransferase TrmH, group 1  32.63 
 
 		 248 aa  107  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000282911  hitchhiker  0.0000077591 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2753  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  33.05 
 
 		 244 aa  107  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0620173  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2786  RNA methyltransferase  32.66 
 
 		 243 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000395932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0569  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.05 
 
 		 254 aa  107  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02424  predicted methyltransferase  32.26 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.438411  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1136  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  32.26 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.631773  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2684  RNA methyltransferase  32.26 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000664328  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2817  RNA methyltransferase  32.26 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000707701  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2907  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  32.26 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000722285  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3764  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  32.26 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000603217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02388  hypothetical protein  32.26 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.373948  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1145  RNA methyltransferase  32.26 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0763368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0279  tRNA/rRNA methyltransferase  33.06 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2685  RNA methyltransferase  32.26 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0309108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2581  RNA methyltransferase  34.45 
 
 		 262 aa  106  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0271019  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1375  RNA methyltransferase  34.3 
 
 		 243 aa  107  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0566977  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3698  RNA methyltransferase  35.96 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274562  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1129  RNA methyltransferase  39.04 
 
 		 273 aa  106  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2807  RNA methyltransferase  32.26 
 
 		 243 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0201876  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>