More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1129 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1129  RNA methyltransferase  100 
 
 		 273 aa  571  1.0000000000000001e-162  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1235  RNA methyltransferase  63.04 
 
 		 241 aa  340  2e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.207917  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01352  putative tRNA/rRNA methyltransferase (trmH family) protein  61.87 
 
 		 261 aa  329  3e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0228097  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1145  RNA methyltransferase  58.66 
 
 		 246 aa  306  3e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0763368  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02424  predicted methyltransferase  58.66 
 
 		 246 aa  305  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.438411  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1136  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  58.66 
 
 		 246 aa  305  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.631773  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2684  RNA methyltransferase  58.66 
 
 		 246 aa  305  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000664328  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2807  RNA methyltransferase  57.81 
 
 		 243 aa  305  4.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0201876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2907  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  58.66 
 
 		 246 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000722285  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2685  RNA methyltransferase  58.66 
 
 		 246 aa  305  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0309108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2745  RNA methyltransferase  57.81 
 
 		 243 aa  305  4.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00735302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2817  RNA methyltransferase  58.66 
 
 		 245 aa  305  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000707701  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2700  RNA methyltransferase  57.81 
 
 		 243 aa  305  4.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000906061  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02388  hypothetical protein  58.66 
 
 		 246 aa  305  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.373948  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3764  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  58.66 
 
 		 245 aa  305  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000603217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2920  RNA methyltransferase  57.42 
 
 		 243 aa  303  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0175386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2786  RNA methyltransferase  57.42 
 
 		 243 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000395932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1322  RNA methyltransferase  58.33 
 
 		 254 aa  302  3.0000000000000004e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000628419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3629  RNA methyltransferase  55.47 
 
 		 244 aa  298  5e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004362  tRNA:Cm32/Um32 methyltransferase  60.16 
 
 		 239 aa  298  8e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00237949  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3029  RNA methyltransferase  56.64 
 
 		 244 aa  298  9e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00120237  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3033  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  56.86 
 
 		 241 aa  298  9e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0996868  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01053  rRNA methylase  59.76 
 
 		 239 aa  297  2e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0437  RNA methyltransferase  56.69 
 
 		 257 aa  296  2e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.293753  hitchhiker  0.0000675678 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1274  RNA methyltransferase  56.69 
 
 		 257 aa  296  2e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000271019  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1166  RNA methyltransferase  56.69 
 
 		 257 aa  296  2e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000032697  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1242  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  56.08 
 
 		 241 aa  295  4e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.626014  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0715  hypothetical tRNA/rRNA methyltransferase  58.2 
 
 		 242 aa  295  7e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1102  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  56.13 
 
 		 249 aa  295  8e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0245796  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2753  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  55.82 
 
 		 244 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0620173  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0275  RNA methyltransferase  56.64 
 
 		 244 aa  281  7.000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00988641  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1455  RNA methyltransferase TrmH, group 1  54.55 
 
 		 259 aa  279  3e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000119002  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1773  RNA methyltransferase  53.28 
 
 		 254 aa  276  2e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.12594  hitchhiker  0.00165952 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1290  RNA methyltransferase  54.69 
 
 		 240 aa  276  3e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0442169  normal  0.0143019 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1485  RNA methyltransferase  54.37 
 
 		 254 aa  275  5e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0403715  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2152  RNA methyltransferase  53.88 
 
 		 241 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0159142  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2874  RNA methyltransferase  52.73 
 
 		 254 aa  272  4.0000000000000004e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.718962  hitchhiker  0.0000000232974 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1958  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  52.71 
 
 		 242 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000144903  hitchhiker  0.00948062 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2505  RNA methyltransferase  52.71 
 
 		 242 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000223047  normal  0.027536 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2389  RNA methyltransferase  52.71 
 
 		 242 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000450659  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2320  RNA methyltransferase  51.39 
 
 		 252 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000515226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2400  RNA methyltransferase  52.71 
 
 		 242 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000262197  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2427  RNA methyltransferase  53.39 
 
 		 240 aa  267  1e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1816  RNA methyltransferase  52.78 
 
 		 241 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00001341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1736  RNA methyltransferase  52.78 
 
 		 241 aa  265  4e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000887935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2283  RNA methyltransferase  52.78 
 
 		 241 aa  266  4e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000130955  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2261  RNA methyltransferase  52.19 
 
 		 241 aa  264  1e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1234  RNA methyltransferase TrmH, group 1  49.8 
 
 		 254 aa  250  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.600347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4615  RNA methyltransferase TrmH, group 1  47.21 
 
 		 264 aa  248  9e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00452302  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1420  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  49.02 
 
 		 257 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0869  RNA methyltransferase  49.41 
 
 		 279 aa  242  5e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164985  normal  0.267349 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0839  RNA methyltransferase  48.81 
 
 		 251 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.742035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4339  RNA methyltransferase  47.06 
 
 		 251 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000160755 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0882  RNA methyltransferase  48.81 
 
 		 251 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00955273 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1411  RNA methyltransferase  48.61 
 
 		 267 aa  238  8e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.993978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3514  RNA methyltransferase  49.61 
 
 		 262 aa  235  7e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14690  putative methyltransferase  47.06 
 
 		 257 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1296  putative methyltransferase  47.06 
 
 		 308 aa  228  5e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0279  tRNA/rRNA methyltransferase  47.81 
 
 		 246 aa  228  8e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40430  RNA methyltransferase TrmH, group 1  46.9 
 
 		 258 aa  223  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.573027  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2076  RNA methyltransferase  44.66 
 
 		 260 aa  223  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.780076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1161  RNA methyltransferase TrmH, group 1  47.64 
 
 		 256 aa  223  3e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000875813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1119  RNA methyltransferase  45.21 
 
 		 287 aa  222  6e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3506  RNA methyltransferase  46.03 
 
 		 240 aa  219  3.9999999999999997e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.899672 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1711  hypothetical protein  45.02 
 
 		 257 aa  212  5.999999999999999e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1711  hypothetical protein  45.02 
 
 		 257 aa  211  7e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1279  RNA methyltransferase  49 
 
 		 240 aa  211  1e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2846  RNA methyltransferase TrmH, group 1  43.59 
 
 		 274 aa  210  2e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2062  tRNA/rRNA methyltransferase, TrmH family, group 1  48.43 
 
 		 247 aa  208  7e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.260682  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1646  RNA methyltransferase TrmH, group 1  44.09 
 
 		 247 aa  207  1e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1230  rRNA methylase, SpoU family  48.61 
 
 		 240 aa  207  1e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.420687  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0812  RNA methyltransferase TrmH, group 1  45.2 
 
 		 251 aa  207  2e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000476063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2161  RNA methyltransferase TrmH, group 1  43.48 
 
 		 246 aa  205  5e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00198375  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0827  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  44.84 
 
 		 245 aa  201  9e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.293121 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0615  RNA methyltransferase TrmH, group 1  43.89 
 
 		 268 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000217405  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2610  RNA methyltransferase  42.91 
 
 		 247 aa  192  7e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2746  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  44.44 
 
 		 256 aa  183  3e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.504131  normal  0.782476 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1245  RNA methyltransferase  43.95 
 
 		 260 aa  180  2e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1795  RNA methyltransferase  40.56 
 
 		 249 aa  179  4e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.313918  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0673  RNA methyltransferase TrmH, group 1  42.06 
 
 		 267 aa  178  7e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000000736147  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0670  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  42.91 
 
 		 256 aa  178  9e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.373785  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0819  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  42.91 
 
 		 256 aa  178  9e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0412147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1682  RNA methyltransferase TrmH, group 1  42.23 
 
 		 254 aa  176  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1635  tRNA/rRNA methyltransferase  41.77 
 
 		 263 aa  175  7e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1396  RNA methyltransferase  39.39 
 
 		 276 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.901296  hitchhiker  0.00503729 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5390  RNA methyltransferase TrmH, group 1  39.02 
 
 		 289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1578  RNA methyltransferase  41.37 
 
 		 263 aa  173  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.373161  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5993  RNA methyltransferase TrmH, group 1  40.53 
 
 		 289 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2119  RNA methyltransferase  40.91 
 
 		 273 aa  172  5e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2084  RNA methyltransferase  40.53 
 
 		 289 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00462385  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1989  RNA methyltransferase  40.23 
 
 		 273 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.418465 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2281  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  39.6 
 
 		 245 aa  171  9e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0794239  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2517  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  40.77 
 
 		 353 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127237  hitchhiker  0.00000580733 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1197  RNA methyltransferase  40.93 
 
 		 289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0280134 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2103  RNA methyltransferase  40.53 
 
 		 289 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.247201 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1620  RNA methyltransferase TrmH, group 1  40.96 
 
 		 278 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.298646 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1161  putative tRNA/rRNA methyltransferase protein  38.82 
 
 		 287 aa  154  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.539621  normal  0.325888 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2552  RNA methyltransferase  41.09 
 
 		 303 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2688  RNA methyltransferase  40.7 
 
 		 346 aa  152  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110135  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2167  RNA methyltransferase  40.7 
 
 		 303 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>