285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3670 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3670  putative RNA methyltransferase  100 
 
 		 228 aa  466  9.999999999999999e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3864  putative RNA methyltransferase  93.86 
 
 		 228 aa  439  9.999999999999999e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000175162  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0532  putative RNA methyltransferase  76.21 
 
 		 233 aa  355  2.9999999999999997e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.669488  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0682  putative RNA methyltransferase  74.12 
 
 		 228 aa  344  6e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000176803  normal  0.146747 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0571  putative RNA methyltransferase  73.13 
 
 		 232 aa  340  1e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.918985  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04279  predicted rRNA methyltransferase  72.37 
 
 		 228 aa  331  5e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.42509  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0563  putative RNA methyltransferase  70.18 
 
 		 228 aa  331  6e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3595  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  72.37 
 
 		 228 aa  330  1e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5002  putative RNA methyltransferase  71.93 
 
 		 228 aa  330  1e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.985383  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3654  putative RNA methyltransferase  71.93 
 
 		 228 aa  330  1e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.749587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4639  putative RNA methyltransferase  71.93 
 
 		 228 aa  330  1e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0771017  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4951  putative RNA methyltransferase  71.93 
 
 		 228 aa  329  2e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5917  putative RNA methyltransferase  72.37 
 
 		 228 aa  329  2e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.579463  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04244  hypothetical protein  73.21 
 
 		 229 aa  328  4e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.474668  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4953  putative RNA methyltransferase  71.93 
 
 		 228 aa  328  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.396739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4923  putative RNA methyltransferase  71.93 
 
 		 228 aa  307  8e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000405999  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4957  putative RNA methyltransferase  71.49 
 
 		 228 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.914631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5013  putative RNA methyltransferase  71.49 
 
 		 228 aa  304  7e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.129781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5009  putative RNA methyltransferase  71.05 
 
 		 228 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.954337 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4850  putative RNA methyltransferase  71.43 
 
 		 203 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0238546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3658  putative RNA methyltransferase  46.02 
 
 		 226 aa  192  5e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1753  putative RNA methyltransferase  47.51 
 
 		 225 aa  175  6e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.005917  hitchhiker  0.00815274 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1258  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  37 
 
 		 245 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00338281  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1369  RNA methyltransferase TrmH, group 1  35.93 
 
 		 248 aa  124  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000282911  hitchhiker  0.0000077591 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0645  RNA methyltransferase  34.39 
 
 		 251 aa  122  6e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0451004  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3468  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.62 
 
 		 245 aa  121  7e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.19102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3698  RNA methyltransferase  38.35 
 
 		 246 aa  121  8e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274562  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3144  RNA methyltransferase  35.62 
 
 		 245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317738  normal  0.930486 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3341  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36.07 
 
 		 245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1475  RNA methyltransferase  36.4 
 
 		 255 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2030  RNA methyltransferase  34.48 
 
 		 245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.433712  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1682  RNA methyltransferase TrmH, group 1  35.47 
 
 		 254 aa  116  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5766  RNA methyltransferase  36.53 
 
 		 261 aa  115  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4615  RNA methyltransferase TrmH, group 1  35.68 
 
 		 264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00452302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1335  RNA methyltransferase  41.77 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40430  RNA methyltransferase TrmH, group 1  35.29 
 
 		 258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.573027  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2517  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  44.16 
 
 		 353 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127237  hitchhiker  0.00000580733 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2688  RNA methyltransferase  37.97 
 
 		 346 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110135  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2552  RNA methyltransferase  37.97 
 
 		 303 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2167  RNA methyltransferase  38.14 
 
 		 303 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1663  RNA methyltransferase  38.14 
 
 		 306 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165856  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1440  RNA methyltransferase  38.14 
 
 		 303 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.302799  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1235  RNA methyltransferase  34.89 
 
 		 241 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.207917  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2604  RNA methyltransferase  38.14 
 
 		 311 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.574279  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3150  RNA methyltransferase  38.14 
 
 		 303 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5993  RNA methyltransferase TrmH, group 1  39 
 
 		 289 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2084  RNA methyltransferase  39 
 
 		 289 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00462385  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5390  RNA methyltransferase TrmH, group 1  37.92 
 
 		 289 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1935  RNA methyltransferase  37.13 
 
 		 338 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.136994  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1711  hypothetical protein  32.07 
 
 		 257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2119  RNA methyltransferase  36.55 
 
 		 273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01352  putative tRNA/rRNA methyltransferase (trmH family) protein  36.9 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0228097  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1620  RNA methyltransferase TrmH, group 1  43.51 
 
 		 278 aa  109  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.298646 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1197  RNA methyltransferase  37.55 
 
 		 289 aa  109  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0280134 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1340  RNA methyltransferase  40.91 
 
 		 254 aa  108  5e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.34341  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1711  hypothetical protein  31.65 
 
 		 257 aa  108  6e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2103  RNA methyltransferase  37.82 
 
 		 289 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.247201 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0618  RNA methyltransferase  39.87 
 
 		 234 aa  108  6e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.570279  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0869  RNA methyltransferase  32.77 
 
 		 279 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164985  normal  0.267349 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0839  RNA methyltransferase  32.77 
 
 		 251 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.742035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3506  RNA methyltransferase  34.57 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.899672 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0071  RNA methyltransferase  39.62 
 
 		 231 aa  107  1e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.17974  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1268  RNA methyltransferase  37.43 
 
 		 262 aa  107  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.681367  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1989  RNA methyltransferase  36.13 
 
 		 273 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.418465 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4813  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.7 
 
 		 248 aa  107  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.695937  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1345  RNA methyltransferase  39.24 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0492  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  40.62 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1995  RNA methyltransferase  37.75 
 
 		 281 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.720646  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2632  RNA methyltransferase  33.76 
 
 		 250 aa  106  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.192345 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2581  RNA methyltransferase  40.52 
 
 		 262 aa  106  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0271019  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0819  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36.98 
 
 		 256 aa  105  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0412147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0670  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  36.98 
 
 		 256 aa  105  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.373785  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2687  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.05 
 
 		 245 aa  105  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.491891  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1552  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  32.64 
 
 		 245 aa  105  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000140105 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0812  RNA methyltransferase TrmH, group 1  34.26 
 
 		 251 aa  105  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000476063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3629  RNA methyltransferase  36.41 
 
 		 244 aa  105  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1915  tRNA/rRNA methyltransferase  36.42 
 
 		 286 aa  105  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0882  RNA methyltransferase  32.35 
 
 		 251 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00955273 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2753  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  37.63 
 
 		 244 aa  105  8e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0620173  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1990  RNA methyltransferase TrmH, group 1  40.99 
 
 		 254 aa  105  8e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.25576  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1161  RNA methyltransferase TrmH, group 1  41.18 
 
 		 256 aa  104  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000875813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1396  RNA methyltransferase  35.59 
 
 		 276 aa  104  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.901296  hitchhiker  0.00503729 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1230  rRNA methylase, SpoU family  36.11 
 
 		 240 aa  104  1e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.420687  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2161  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  34.92 
 
 		 276 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0486585  normal  0.265451 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1773  RNA methyltransferase  31.58 
 
 		 254 aa  104  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.12594  hitchhiker  0.00165952 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1119  RNA methyltransferase  33.61 
 
 		 287 aa  104  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1196  RNA methyltransferase  37.09 
 
 		 276 aa  103  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3514  RNA methyltransferase  33.89 
 
 		 262 aa  103  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1950  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  35.45 
 
 		 276 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.168874  normal  0.372622 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2433  RNA methyltransferase TrmH, group 1  36.02 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1158  RNA methyltransferase  37.09 
 
 		 291 aa  103  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.357934  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1279  RNA methyltransferase  36.11 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1411  RNA methyltransferase  38.31 
 
 		 267 aa  103  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.993978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1485  RNA methyltransferase  37.87 
 
 		 254 aa  103  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0403715  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2427  RNA methyltransferase  34.92 
 
 		 240 aa  102  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1517  RNA methyltransferase  34.92 
 
 		 276 aa  102  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.9954 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0696  RNA methyltransferase TrmH, group 1  32.49 
 
 		 279 aa  102  6e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1365  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35 
 
 		 225 aa  102  6e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1420  RNA methyltransferase, TrmH family, group 1  32.51 
 
 		 257 aa  102  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14690  putative methyltransferase  32.64 
 
 		 257 aa  102  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>