143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0344 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0344  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  100 
 
 		 128 aa  263  7e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0493  molydopterin dinucleotide-binding region  97.66 
 
 		 128 aa  258  2e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.461417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1426  molydopterin dinucleotide-binding region  96.09 
 
 		 128 aa  254  2e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0422666  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0561  molydopterin dinucleotide-binding region  85.16 
 
 		 128 aa  231  2.0000000000000002e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1463  molydopterin dinucleotide-binding region  42.19 
 
 		 130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0101  molydopterin dinucleotide-binding region  41.41 
 
 		 130 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.526644  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0621  molydopterin dinucleotide-binding region  46.83 
 
 		 133 aa  106  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.270676  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2236  molydopterin dinucleotide-binding region  43.2 
 
 		 134 aa  98.2  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.750152  normal  0.0387564 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1984  molydopterin dinucleotide-binding region  44.17 
 
 		 133 aa  97.8  4e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.191705 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2237  molydopterin dinucleotide-binding region  44.53 
 
 		 134 aa  97.8  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.255256  normal  0.0380736 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1095  molydopterin dinucleotide-binding region  42.4 
 
 		 123 aa  95.9  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0243  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  46.09 
 
 		 131 aa  95.5  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.208129  normal  0.212279 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1186  molydopterin dinucleotide-binding region  39.84 
 
 		 129 aa  89.7  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0619924  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1389  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  37.7 
 
 		 574 aa  87  7e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1470  molydopterin dinucleotide-binding region  41.03 
 
 		 136 aa  84.7  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0878  molydopterin dinucleotide-binding region  41.6 
 
 		 136 aa  84.7  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.385852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2107  molydopterin dinucleotide-binding region  36.29 
 
 		 129 aa  84  7e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0976  molydopterin dinucleotide-binding region  37.1 
 
 		 125 aa  83.6  7e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0204  molydopterin dinucleotide-binding region  39.45 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0715847 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0373  molydopterin dinucleotide-binding region  39.81 
 
 		 129 aa  77  0.00000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.827239  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1987  molydopterin dinucleotide-binding region  39.22 
 
 		 137 aa  74.3  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.295284  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1993  molydopterin dinucleotide-binding region  37.7 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0699041  normal  0.338946 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1291  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  35.38 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.75311 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0381  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  40 
 
 		 415 aa  65.5  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0282  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  33.59 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.24864  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1450  formylmethanofuran dehydrogenase  39.17 
 
 		 415 aa  62.8  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0084  formylmethanofuran dehydrogenase  36.89 
 
 		 425 aa  62  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1531  formylmethanofuran dehydrogenase  38.33 
 
 		 415 aa  61.6  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000509371 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1663  formylmethanofuran dehydrogenase  33.08 
 
 		 424 aa  60.5  0.000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1829  molydopterin dinucleotide-binding region  33.93 
 
 		 587 aa  60.1  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2923  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  29.41 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0830145  hitchhiker  0.000724487 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2383  nitrate reductase catalytic subunit  34.18 
 
 		 831 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0655186  normal  0.338033 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1910  nitrate reductase catalytic subunit  34.18 
 
 		 829 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.930767  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1770  nitrate reductase catalytic subunit  32.53 
 
 		 831 aa  49.7  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1936  nitrate reductase catalytic subunit  34.18 
 
 		 829 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.243568  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1943  nitrate reductase catalytic subunit  34.18 
 
 		 829 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.212211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2438  nitrate reductase catalytic subunit  35.8 
 
 		 839 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.627702 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2844  nitrate reductase catalytic subunit  35.8 
 
 		 838 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1900  nitrate reductase catalytic subunit  32.91 
 
 		 829 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000194918 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1842  nitrate reductase catalytic subunit  32.91 
 
 		 829 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.889762  hitchhiker  0.000540114 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2135  nitrate reductase catalytic subunit  32.91 
 
 		 829 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000411106 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1903  nitrate reductase catalytic subunit  32.91 
 
 		 829 aa  48.5  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1999  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.82 
 
 		 657 aa  48.1  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1622  nitrate reductase catalytic subunit  34.18 
 
 		 831 aa  47.8  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0868309  normal  0.125549 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4063  nitrate reductase catalytic subunit  35 
 
 		 831 aa  47.4  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.127996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2553  nitrate reductase catalytic subunit  31.65 
 
 		 829 aa  47.8  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.4401  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2427  nitrate reductase catalytic subunit  31.65 
 
 		 829 aa  47.8  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0968104  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0438  nitrate reductase catalytic subunit  40.68 
 
 		 934 aa  47.4  0.00007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000251806  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0167  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.91 
 
 		 886 aa  47  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0530728  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0367  nitrate reductase catalytic subunit  32.38 
 
 		 827 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.870731  hitchhiker  0.000366868 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4442  molydopterin dinucleotide-binding region  41.07 
 
 		 720 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.510451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2680  nitrate reductase catalytic subunit  31.65 
 
 		 831 aa  46.6  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.232785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1561  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  30.86 
 
 		 695 aa  45.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0952  nitrate reductase catalytic subunit  28.95 
 
 		 837 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1497  nitrate reductase catalytic subunit  31.65 
 
 		 829 aa  46.2  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3942  formate dehydrogenase  44.64 
 
 		 721 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4016  formate dehydrogenase  44.64 
 
 		 721 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3956  formate dehydrogenase  44.64 
 
 		 721 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0923262  decreased coverage  0.00564803 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1862  nitrate reductase catalytic subunit  27.83 
 
 		 834 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4746  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.43 
 
 		 1111 aa  46.2  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.879601  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0772  trimethylamine-N-oxide reductase precursor  42 
 
 		 820 aa  45.4  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0084  nitrate reductase catalytic subunit  33.33 
 
 		 831 aa  45.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0724  periplasmic nitrate reductase, large subunit  39.66 
 
 		 929 aa  45.1  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1109  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.51 
 
 		 963 aa  45.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.612386  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1716  nitrate reductase catalytic subunit  34.57 
 
 		 920 aa  45.1  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.207825  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0546  molybdopterin oxidoreductase  32.93 
 
 		 1409 aa  45.1  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1624  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.67 
 
 		 687 aa  44.7  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0337  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  26.04 
 
 		 132 aa  44.3  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07590  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  32.93 
 
 		 851 aa  43.9  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.676481 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2338  molybdopterin oxidoreductase  31.75 
 
 		 884 aa  43.9  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.33 
 
 		 686 aa  43.9  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0413343  normal  0.361775 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1813  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.1 
 
 		 688 aa  43.5  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5704  arsenite oxidase, large subunit  28.97 
 
 		 829 aa  43.5  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.342827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24550  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  38 
 
 		 814 aa  43.5  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1631  formate dehydrogenase  37.5 
 
 		 647 aa  43.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1739  molybdopterin oxidoreductase  42.31 
 
 		 854 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.418465  normal  0.0195226 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0214  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  39.22 
 
 		 840 aa  43.5  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.75 
 
 		 879 aa  43.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.9 
 
 		 893 aa  43.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0090  molybdopterin oxidoreductase  37.29 
 
 		 697 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0958221 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01857  hypothetical protein  42 
 
 		 820 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1913  nitrate reductase catalytic subunit  35 
 
 		 829 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000463649  normal  0.796386 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2333  molybdopterin oxidoreductase  34.62 
 
 		 880 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4763  nitrate reductase catalytic subunit  32.5 
 
 		 831 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  40.82 
 
 		 745 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3238  molydopterin dinucleotide-binding region  33.33 
 
 		 687 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0973988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1751  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  37.25 
 
 		 824 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49250  nitrate reductase catalytic subunit  31.71 
 
 		 834 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.562968  normal  0.0276876 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0987  trimethylamine-N-oxide reductase  38.46 
 
 		 829 aa  42.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6171  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.11 
 
 		 989 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.796652 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2249  formate dehydrogenase  39.29 
 
 		 720 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.404887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3990  nitrate reductase catalytic subunit  33.33 
 
 		 831 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.214468  normal  0.774592 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1296  trimethylamine-N-oxide reductase  36.92 
 
 		 820 aa  42.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0848  molybdopterin oxidoreductase domain-containing protein  42 
 
 		 816 aa  42.4  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3950  arsenite oxidase large subunit  29.81 
 
 		 820 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.616487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3343  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  35.38 
 
 		 830 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.922902  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3165  nitrate reductase catalytic subunit  32.05 
 
 		 831 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003825  trimethylamine-N-oxide reductase  38.46 
 
 		 820 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000513  periplasmic nitrate reductase precursor  36.67 
 
 		 829 aa  41.6  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1331  molybdopterin oxidoreductase  36.71 
 
 		 1342 aa  42  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0643917 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>