110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1426 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1426  molydopterin dinucleotide-binding region  100 
 
 		 128 aa  262  1e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0422666  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0493  molydopterin dinucleotide-binding region  96.88 
 
 		 128 aa  256  7e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.461417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0344  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  96.09 
 
 		 128 aa  254  2e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0561  molydopterin dinucleotide-binding region  85.94 
 
 		 128 aa  233  7e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0101  molydopterin dinucleotide-binding region  42.97 
 
 		 130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.526644  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1463  molydopterin dinucleotide-binding region  41.41 
 
 		 130 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0621  molydopterin dinucleotide-binding region  49.61 
 
 		 133 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.270676  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2237  molydopterin dinucleotide-binding region  48.03 
 
 		 134 aa  100  7e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.255256  normal  0.0380736 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2236  molydopterin dinucleotide-binding region  45.31 
 
 		 134 aa  100  8e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.750152  normal  0.0387564 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1984  molydopterin dinucleotide-binding region  46.28 
 
 		 133 aa  99.4  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.191705 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0243  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  48.28 
 
 		 131 aa  96.3  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.208129  normal  0.212279 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1095  molydopterin dinucleotide-binding region  42.4 
 
 		 123 aa  92.8  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1186  molydopterin dinucleotide-binding region  41.8 
 
 		 129 aa  91.7  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0619924  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1389  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  38.52 
 
 		 574 aa  89.4  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0878  molydopterin dinucleotide-binding region  40.83 
 
 		 136 aa  86.7  9e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.385852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2107  molydopterin dinucleotide-binding region  36.29 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1470  molydopterin dinucleotide-binding region  40.17 
 
 		 136 aa  83.2  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0976  molydopterin dinucleotide-binding region  34.68 
 
 		 125 aa  79.3  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0373  molydopterin dinucleotide-binding region  40.2 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.827239  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0204  molydopterin dinucleotide-binding region  38.26 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0715847 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1987  molydopterin dinucleotide-binding region  38.24 
 
 		 137 aa  73.9  0.0000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.295284  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1993  molydopterin dinucleotide-binding region  36 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0699041  normal  0.338946 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1291  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  34.62 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.75311 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0381  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  36.72 
 
 		 415 aa  61.6  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1450  formylmethanofuran dehydrogenase  36.92 
 
 		 415 aa  61.6  0.000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0282  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  32.56 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.24864  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1531  formylmethanofuran dehydrogenase  36.15 
 
 		 415 aa  60.5  0.000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000509371 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0084  formylmethanofuran dehydrogenase  32.54 
 
 		 425 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1829  molydopterin dinucleotide-binding region  33.04 
 
 		 587 aa  57  0.00000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1663  formylmethanofuran dehydrogenase  31.54 
 
 		 424 aa  57  0.00000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2923  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  28.43 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0830145  hitchhiker  0.000724487 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1999  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.73 
 
 		 657 aa  48.1  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1910  nitrate reductase catalytic subunit  32.91 
 
 		 829 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.930767  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1770  nitrate reductase catalytic subunit  31.33 
 
 		 831 aa  47.8  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1936  nitrate reductase catalytic subunit  32.91 
 
 		 829 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.243568  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1943  nitrate reductase catalytic subunit  32.91 
 
 		 829 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.212211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2383  nitrate reductase catalytic subunit  32.91 
 
 		 831 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0655186  normal  0.338033 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1900  nitrate reductase catalytic subunit  31.65 
 
 		 829 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000194918 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.57 
 
 		 686 aa  47.4  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0413343  normal  0.361775 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1622  nitrate reductase catalytic subunit  32.91 
 
 		 831 aa  47  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0868309  normal  0.125549 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1842  nitrate reductase catalytic subunit  31.65 
 
 		 829 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.889762  hitchhiker  0.000540114 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2135  nitrate reductase catalytic subunit  31.65 
 
 		 829 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000411106 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1903  nitrate reductase catalytic subunit  31.65 
 
 		 829 aa  46.6  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2844  nitrate reductase catalytic subunit  32.5 
 
 		 838 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0438  nitrate reductase catalytic subunit  37.93 
 
 		 934 aa  46.2  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000251806  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2438  nitrate reductase catalytic subunit  32.5 
 
 		 839 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.627702 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1561  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  30.86 
 
 		 695 aa  45.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4063  nitrate reductase catalytic subunit  32.5 
 
 		 831 aa  45.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.127996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2553  nitrate reductase catalytic subunit  30.38 
 
 		 829 aa  45.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.4401  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1624  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.93 
 
 		 687 aa  46.2  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2427  nitrate reductase catalytic subunit  30.38 
 
 		 829 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0968104  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0952  nitrate reductase catalytic subunit  28.07 
 
 		 837 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0367  nitrate reductase catalytic subunit  29.81 
 
 		 827 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.870731  hitchhiker  0.000366868 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1862  nitrate reductase catalytic subunit  25.44 
 
 		 834 aa  44.7  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2680  nitrate reductase catalytic subunit  30.38 
 
 		 831 aa  44.7  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.232785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0084  nitrate reductase catalytic subunit  32.1 
 
 		 831 aa  44.3  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3238  molydopterin dinucleotide-binding region  33.33 
 
 		 687 aa  44.3  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0973988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1497  nitrate reductase catalytic subunit  30.38 
 
 		 829 aa  44.3  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0724  periplasmic nitrate reductase, large subunit  37.93 
 
 		 929 aa  44.3  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0987  trimethylamine-N-oxide reductase  44 
 
 		 829 aa  43.9  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3950  arsenite oxidase large subunit  30.77 
 
 		 820 aa  43.9  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.616487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5704  arsenite oxidase, large subunit  28.97 
 
 		 829 aa  43.9  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.342827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1739  molybdopterin oxidoreductase  45.83 
 
 		 854 aa  43.9  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.418465  normal  0.0195226 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07590  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  32.93 
 
 		 851 aa  43.9  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.676481 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4116  nitrate reductase catalytic subunit  30.86 
 
 		 831 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.568266  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4442  molydopterin dinucleotide-binding region  37.5 
 
 		 720 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.510451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1109  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.27 
 
 		 963 aa  43.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.612386  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3990  nitrate reductase catalytic subunit  33.33 
 
 		 831 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.214468  normal  0.774592 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1716  nitrate reductase catalytic subunit  33.33 
 
 		 920 aa  43.1  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.207825  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0104  formate dehydrogenase, alpha subunit  35 
 
 		 724 aa  43.5  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.5 
 
 		 879 aa  43.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0772  trimethylamine-N-oxide reductase precursor  40 
 
 		 820 aa  43.5  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0167  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.65 
 
 		 886 aa  43.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0530728  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2338  molybdopterin oxidoreductase  31.75 
 
 		 884 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  42.86 
 
 		 745 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1631  formate dehydrogenase  37.5 
 
 		 647 aa  42.4  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24550  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  38 
 
 		 814 aa  42.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4746  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.48 
 
 		 1111 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.879601  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2333  molybdopterin oxidoreductase  34.62 
 
 		 880 aa  42  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1813  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.1 
 
 		 688 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1751  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  37.25 
 
 		 824 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3942  formate dehydrogenase  41.07 
 
 		 721 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49250  nitrate reductase catalytic subunit  30.49 
 
 		 834 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.562968  normal  0.0276876 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4016  formate dehydrogenase  41.07 
 
 		 721 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3956  formate dehydrogenase  41.07 
 
 		 721 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0923262  decreased coverage  0.00564803 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3493  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.21 
 
 		 1425 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1913  nitrate reductase catalytic subunit  32.2 
 
 		 829 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000463649  normal  0.796386 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3616  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.21 
 
 		 1421 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.47 
 
 		 893 aa  41.6  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3421  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.21 
 
 		 1425 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0337  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  24.55 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4721  nitrate reductase catalytic subunit  34.48 
 
 		 831 aa  41.6  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.068762  normal  0.0333447 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1381  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.1 
 
 		 688 aa  41.6  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0871  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.21 
 
 		 1425 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.510403  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01857  hypothetical protein  40 
 
 		 820 aa  41.6  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3165  nitrate reductase catalytic subunit  30.77 
 
 		 831 aa  41.2  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0214  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  37.25 
 
 		 840 aa  41.2  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001399  formate dehydrogenase-O major subunit  28.69 
 
 		 1387 aa  40.8  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2981  nitrate reductase catalytic subunit  28.4 
 
 		 834 aa  40.8  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.237893  normal  0.139992 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4205  nitrate reductase catalytic subunit  29.27 
 
 		 834 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.153264  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>