36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2107 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2107  molydopterin dinucleotide-binding region  100 
 
 
129 aa  260  4e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1186  molydopterin dinucleotide-binding region  48.84 
 
 
129 aa  118  3e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0619924  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1389  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  44.09 
 
 
574 aa  118  3e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1095  molydopterin dinucleotide-binding region  39.5 
 
 
123 aa  86.3  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0344  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  36.29 
 
 
128 aa  84  7e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1426  molydopterin dinucleotide-binding region  36.29 
 
 
128 aa  83.2  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0422666  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0493  molydopterin dinucleotide-binding region  35.48 
 
 
128 aa  82  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.461417  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0561  molydopterin dinucleotide-binding region  35.77 
 
 
128 aa  78.6  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1829  molydopterin dinucleotide-binding region  37.37 
 
 
587 aa  75.9  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0621  molydopterin dinucleotide-binding region  34.43 
 
 
133 aa  74.7  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.270676  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0878  molydopterin dinucleotide-binding region  37.21 
 
 
136 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.385852  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2237  molydopterin dinucleotide-binding region  35.43 
 
 
134 aa  68.6  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.255256  normal  0.0380736 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0243  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  34.31 
 
 
131 aa  67  0.00000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.208129  normal  0.212279 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0976  molydopterin dinucleotide-binding region  34.13 
 
 
125 aa  65.1  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0101  molydopterin dinucleotide-binding region  30.7 
 
 
130 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.526644  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1463  molydopterin dinucleotide-binding region  29.82 
 
 
130 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2236  molydopterin dinucleotide-binding region  31.75 
 
 
134 aa  63.9  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.750152  normal  0.0387564 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0084  formylmethanofuran dehydrogenase  31.48 
 
 
425 aa  60.8  0.000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0381  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  29.51 
 
 
415 aa  60.8  0.000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1470  molydopterin dinucleotide-binding region  33.33 
 
 
136 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1531  formylmethanofuran dehydrogenase  29.51 
 
 
415 aa  60.1  0.000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000509371 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1984  molydopterin dinucleotide-binding region  31.71 
 
 
133 aa  59.7  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.191705 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1450  formylmethanofuran dehydrogenase  29.51 
 
 
415 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1663  formylmethanofuran dehydrogenase  28.07 
 
 
424 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0373  molydopterin dinucleotide-binding region  28.8 
 
 
129 aa  57.4  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.827239  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1993  molydopterin dinucleotide-binding region  31.62 
 
 
134 aa  55.1  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0699041  normal  0.338946 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1987  molydopterin dinucleotide-binding region  33.93 
 
 
137 aa  53.9  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.295284  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0204  molydopterin dinucleotide-binding region  31.06 
 
 
137 aa  53.1  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0715847 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1291  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  26.32 
 
 
129 aa  52.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.75311 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0282  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  27.52 
 
 
129 aa  51.2  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.24864  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0337  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  30.25 
 
 
132 aa  48.9  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2923  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  29.27 
 
 
132 aa  48.5  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0830145  hitchhiker  0.000724487 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1746  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  37.11 
 
 
704 aa  45.4  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.647009 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1624  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.06 
 
 
687 aa  42.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1155  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  28.38 
 
 
823 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0463  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  28.32 
 
 
689 aa  40.8  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>