30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1291 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1291  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  100 
 
 
129 aa  265  2e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.75311 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0282  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  70.54 
 
 
129 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.24864  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0381  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  48 
 
 
415 aa  130  7.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1450  formylmethanofuran dehydrogenase  48 
 
 
415 aa  130  9e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1531  formylmethanofuran dehydrogenase  48 
 
 
415 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000509371 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1663  formylmethanofuran dehydrogenase  48.82 
 
 
424 aa  124  6e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0084  formylmethanofuran dehydrogenase  43.65 
 
 
425 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1984  molydopterin dinucleotide-binding region  38.71 
 
 
133 aa  76.6  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.191705 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0621  molydopterin dinucleotide-binding region  35.71 
 
 
133 aa  70.1  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.270676  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0493  molydopterin dinucleotide-binding region  35.38 
 
 
128 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.461417  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0344  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  35.38 
 
 
128 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0243  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  37.7 
 
 
131 aa  68.2  0.00000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.208129  normal  0.212279 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2237  molydopterin dinucleotide-binding region  36.22 
 
 
134 aa  65.9  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.255256  normal  0.0380736 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1426  molydopterin dinucleotide-binding region  34.62 
 
 
128 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0422666  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1095  molydopterin dinucleotide-binding region  29.27 
 
 
123 aa  65.1  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2236  molydopterin dinucleotide-binding region  34.92 
 
 
134 aa  64.7  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.750152  normal  0.0387564 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0561  molydopterin dinucleotide-binding region  33.85 
 
 
128 aa  63.5  0.0000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0101  molydopterin dinucleotide-binding region  31.62 
 
 
130 aa  62  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.526644  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1463  molydopterin dinucleotide-binding region  31.62 
 
 
130 aa  61.2  0.000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1470  molydopterin dinucleotide-binding region  33.91 
 
 
136 aa  61.2  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1186  molydopterin dinucleotide-binding region  32.17 
 
 
129 aa  60.8  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0619924  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0373  molydopterin dinucleotide-binding region  34.91 
 
 
129 aa  57  0.00000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.827239  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0976  molydopterin dinucleotide-binding region  30.19 
 
 
125 aa  56.2  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1389  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  26.61 
 
 
574 aa  54.7  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0204  molydopterin dinucleotide-binding region  32.17 
 
 
137 aa  53.5  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0715847 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2107  molydopterin dinucleotide-binding region  26.32 
 
 
129 aa  52.8  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0878  molydopterin dinucleotide-binding region  31.97 
 
 
136 aa  51.2  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.385852  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1829  molydopterin dinucleotide-binding region  35.29 
 
 
587 aa  49.7  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1987  molydopterin dinucleotide-binding region  28.07 
 
 
137 aa  48.9  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.295284  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1993  molydopterin dinucleotide-binding region  29.46 
 
 
134 aa  45.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0699041  normal  0.338946 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>