131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0381 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1450  formylmethanofuran dehydrogenase  93.98 
 
 		 415 aa  784    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1531  formylmethanofuran dehydrogenase  96.14 
 
 		 415 aa  803    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000509371 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0381  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  100 
 
 		 415 aa  829    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1663  formylmethanofuran dehydrogenase  72.53 
 
 		 424 aa  615  1e-175  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0084  formylmethanofuran dehydrogenase  45.88 
 
 		 425 aa  349  5e-95  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1290  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  50.55 
 
 		 301 aa  256  4e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0283  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  50.55 
 
 		 269 aa  241  2e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.363907  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0495  formylmethanofuran dehydrogenase  41.37 
 
 		 272 aa  181  2e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.943026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1442  formylmethanofuran dehydrogenase  45.28 
 
 		 294 aa  178  2e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.717791  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1424  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  40.65 
 
 		 272 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.176644  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0342  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  40.5 
 
 		 272 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0563  formylmethanofuran dehydrogenase  36.23 
 
 		 289 aa  164  3e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0618  formylmethanofuran dehydrogenase  38.29 
 
 		 268 aa  160  6e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.031501  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0201  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  38.54 
 
 		 307 aa  155  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0127762  normal  0.0655916 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2233  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  40.54 
 
 		 304 aa  150  4e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.457097  normal  0.0399291 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0875  formylmethanofuran dehydrogenase  38.16 
 
 		 266 aa  149  8e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.118005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0370  formylmethanofuran dehydrogenase  39.91 
 
 		 266 aa  142  9e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1473  formylmethanofuran dehydrogenase  37.84 
 
 		 275 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.143119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0282  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  52 
 
 		 129 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.24864  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1990  formylmethanofuran dehydrogenase  37.72 
 
 		 266 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.114316  normal  0.184502 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1098  formylmethanofuran dehydrogenase  41.74 
 
 		 257 aa  136  7.000000000000001e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0246  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  33.6 
 
 		 266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.314224 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1981  formylmethanofuran dehydrogenase  38.39 
 
 		 332 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.372116 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2112  formylmethanofuran dehydrogenase  33.59 
 
 		 254 aa  130  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1291  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  48 
 
 		 129 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.75311 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2857  formylmethanofurane dehydrogenase subunit, putative  34.98 
 
 		 270 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000000505673  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0575  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  35.88 
 
 		 256 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00575915  decreased coverage  0.000443842 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1189  glutamate synthase alpha subunit  33.83 
 
 		 255 aa  117  3e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6507  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  31.86 
 
 		 286 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0305137 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2403  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  31.52 
 
 		 268 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2626  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  32.59 
 
 		 269 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1665  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  34.69 
 
 		 269 aa  107  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.477479  normal  0.947493 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3064  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  34.85 
 
 		 276 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5932  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  31.7 
 
 		 274 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0388185  normal  0.0470213 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0022  formylmethanofuran dehydrogenase  32.7 
 
 		 272 aa  103  8e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3133  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  31.6 
 
 		 281 aa  97.1  5e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2464  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  28.63 
 
 		 281 aa  96.3  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.109296 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1775  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  32 
 
 		 265 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal  0.875805 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2159  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  33.33 
 
 		 265 aa  82.8  0.000000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0901303 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5773  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  33.33 
 
 		 265 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14713  normal  0.931253 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1824  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  32.96 
 
 		 265 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1793  glutamate synthase alpha subunit  34.95 
 
 		 267 aa  76.6  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0607708  normal  0.627493 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0523  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  31.43 
 
 		 264 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300278  normal  0.650549 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1421  glutamate synthase alpha subunit domain protein  32.64 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5997  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  34.78 
 
 		 265 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128161  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0878  molydopterin dinucleotide-binding region  39.2 
 
 		 136 aa  68.9  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.385852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1470  molydopterin dinucleotide-binding region  37.19 
 
 		 136 aa  67  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0561  molydopterin dinucleotide-binding region  39.17 
 
 		 128 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0243  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  36.67 
 
 		 131 aa  65.1  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.208129  normal  0.212279 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0344  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  40 
 
 		 128 aa  65.5  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0101  molydopterin dinucleotide-binding region  33.9 
 
 		 130 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.526644  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0493  molydopterin dinucleotide-binding region  36.92 
 
 		 128 aa  62.8  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.461417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0373  molydopterin dinucleotide-binding region  40 
 
 		 129 aa  62.4  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.827239  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1426  molydopterin dinucleotide-binding region  36.72 
 
 		 128 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0422666  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1463  molydopterin dinucleotide-binding region  33.05 
 
 		 130 aa  61.2  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2107  molydopterin dinucleotide-binding region  29.51 
 
 		 129 aa  60.8  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1762  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  46.58 
 
 		 105 aa  58.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1984  molydopterin dinucleotide-binding region  33.9 
 
 		 133 aa  58.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.191705 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0621  molydopterin dinucleotide-binding region  36.36 
 
 		 133 aa  58.2  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.270676  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1186  molydopterin dinucleotide-binding region  34.78 
 
 		 129 aa  58.2  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0619924  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5750  formyl-methanofuran dehydrogenase  34.58 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3292  glutamate synthase alpha subunit  43.66 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5639  glutamate synthase alpha subunit domain protein  34.58 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.55547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2237  molydopterin dinucleotide-binding region  37.5 
 
 		 134 aa  55.8  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.255256  normal  0.0380736 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6007  glutamate synthase alpha subunit  34.58 
 
 		 228 aa  55.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.607641  decreased coverage  0.00322278 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1869  putative glutamate synthase  29.51 
 
 		 225 aa  55.8  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.310557  normal  0.791624 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6576  glutamate synthase alpha subunit domain protein  34.58 
 
 		 228 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.026671 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0168  glutamate synthase alpha subunit  31.82 
 
 		 229 aa  56.2  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1993  molydopterin dinucleotide-binding region  38.18 
 
 		 134 aa  55.8  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0699041  normal  0.338946 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0204  molydopterin dinucleotide-binding region  36.13 
 
 		 137 aa  55.5  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0715847 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1100  glutamate synthase alpha subunit  29.88 
 
 		 553 aa  54.7  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.154608 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1812  glutamate synthase alpha subunit  30.97 
 
 		 568 aa  54.3  0.000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000275446 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1083  glutamate synthase alpha subunit  34.41 
 
 		 320 aa  54.3  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.386486  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0830  glutamate synthase alpha subunit  38.46 
 
 		 568 aa  53.9  0.000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.990819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1939  glutamate synthase alpha subunit domain protein  36.19 
 
 		 229 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.490233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1574  glutamate synthase alpha subunit domain protein  36.19 
 
 		 229 aa  53.9  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1943  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  34.26 
 
 		 227 aa  53.5  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.513232 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1657  glutamate synthase alpha subunit  36.19 
 
 		 229 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4809  glutamate synthase alpha subunit  34.92 
 
 		 229 aa  53.9  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.453145  hitchhiker  0.00411559 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2236  molydopterin dinucleotide-binding region  36.45 
 
 		 134 aa  53.1  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.750152  normal  0.0387564 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4696  glutamate synthase family protein  30.56 
 
 		 235 aa  52.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.917164 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1069  glutamate synthase alpha subunit  33 
 
 		 312 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5920  glutamate synthase alpha subunit  28.03 
 
 		 232 aa  51.6  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.755435  normal  0.413716 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1987  molydopterin dinucleotide-binding region  34.75 
 
 		 137 aa  51.2  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.295284  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1298  glutamate synthase alpha subunit  36 
 
 		 227 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.186101  normal  0.822119 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0458  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  27.59 
 
 		 230 aa  51.2  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.951315  normal  0.387952 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0211  glutamate synthase alpha subunit  28.22 
 
 		 264 aa  50.8  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1198  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C (tungsten)  39.83 
 
 		 152 aa  51.2  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1389  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  26.4 
 
 		 574 aa  50.8  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2357  glutamate synthase alpha subunit domain protein  36.07 
 
 		 250 aa  50.4  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800072  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1607  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  34.95 
 
 		 572 aa  50.4  0.00006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3466  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  33.83 
 
 		 224 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.201288  normal  0.713984 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2584  hypothetical protein  31.88 
 
 		 227 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0278158  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2275  glutamate synthase, alpha subunit, C-terminal  31.88 
 
 		 227 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.225316  hitchhiker  0.00959584 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5511  glutamate synthase alpha subunit  25.51 
 
 		 228 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21487 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5262  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  36 
 
 		 238 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.221211 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0030  glutamate synthase alpha subunit  31.76 
 
 		 670 aa  49.3  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0878  glutamate synthase alpha subunit  32 
 
 		 312 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.225814  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1137  formyl-methanofuran dehydrogenase subunit C  26.62 
 
 		 229 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.165169 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4894  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  34.67 
 
 		 238 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>