32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0373 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0373  molydopterin dinucleotide-binding region  100 
 
 		 129 aa  265  1e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.827239  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1987  molydopterin dinucleotide-binding region  72.87 
 
 		 137 aa  194  3e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.295284  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1470  molydopterin dinucleotide-binding region  68.22 
 
 		 136 aa  183  7e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0204  molydopterin dinucleotide-binding region  68.22 
 
 		 137 aa  181  2.0000000000000003e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0715847 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1993  molydopterin dinucleotide-binding region  57.94 
 
 		 134 aa  147  4e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0699041  normal  0.338946 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0878  molydopterin dinucleotide-binding region  51.59 
 
 		 136 aa  134  4e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.385852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1984  molydopterin dinucleotide-binding region  47.9 
 
 		 133 aa  120  6e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.191705 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2237  molydopterin dinucleotide-binding region  51.26 
 
 		 134 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.255256  normal  0.0380736 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0621  molydopterin dinucleotide-binding region  51.26 
 
 		 133 aa  116  7.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.270676  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2236  molydopterin dinucleotide-binding region  47.9 
 
 		 134 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.750152  normal  0.0387564 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0243  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  46.34 
 
 		 131 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.208129  normal  0.212279 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1463  molydopterin dinucleotide-binding region  37.19 
 
 		 130 aa  93.2  1e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0101  molydopterin dinucleotide-binding region  36.36 
 
 		 130 aa  92.8  1e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.526644  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0344  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  39.81 
 
 		 128 aa  77  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1426  molydopterin dinucleotide-binding region  40.2 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0422666  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0493  molydopterin dinucleotide-binding region  39.81 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.461417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0561  molydopterin dinucleotide-binding region  38.24 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1186  molydopterin dinucleotide-binding region  34.68 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0619924  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2923  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  33.33 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0830145  hitchhiker  0.000724487 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1450  formylmethanofuran dehydrogenase  40 
 
 		 415 aa  63.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0381  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  40 
 
 		 415 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1663  formylmethanofuran dehydrogenase  35.19 
 
 		 424 aa  60.5  0.000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0084  formylmethanofuran dehydrogenase  33.96 
 
 		 425 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1531  formylmethanofuran dehydrogenase  39.09 
 
 		 415 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000509371 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1095  molydopterin dinucleotide-binding region  34.95 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2107  molydopterin dinucleotide-binding region  28.8 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1291  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  34.91 
 
 		 129 aa  57  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.75311 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0282  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  28.7 
 
 		 129 aa  53.5  0.0000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.24864  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0976  molydopterin dinucleotide-binding region  28.46 
 
 		 125 aa  52.8  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1389  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  27.73 
 
 		 574 aa  46.2  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0868  nitrate reductase catalytic subunit  35.71 
 
 		 926 aa  40.4  0.008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0337  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  23.68 
 
 		 132 aa  40.4  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>