30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0204 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0204  molydopterin dinucleotide-binding region  100 
 
 		 137 aa  278  2e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0715847 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1470  molydopterin dinucleotide-binding region  80.3 
 
 		 136 aa  226  1e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1987  molydopterin dinucleotide-binding region  74.26 
 
 		 137 aa  212  9.999999999999999e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.295284  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0373  molydopterin dinucleotide-binding region  68.22 
 
 		 129 aa  181  2.0000000000000003e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.827239  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1993  molydopterin dinucleotide-binding region  59.52 
 
 		 134 aa  155  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0699041  normal  0.338946 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0878  molydopterin dinucleotide-binding region  55.04 
 
 		 136 aa  145  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.385852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2237  molydopterin dinucleotide-binding region  51.85 
 
 		 134 aa  135  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.255256  normal  0.0380736 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1984  molydopterin dinucleotide-binding region  50.41 
 
 		 133 aa  133  8e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.191705 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0621  molydopterin dinucleotide-binding region  53.66 
 
 		 133 aa  130  3.9999999999999996e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.270676  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2236  molydopterin dinucleotide-binding region  50.81 
 
 		 134 aa  128  3e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.750152  normal  0.0387564 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0243  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  50.39 
 
 		 131 aa  128  3e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.208129  normal  0.212279 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1463  molydopterin dinucleotide-binding region  36.22 
 
 		 130 aa  100  9e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0101  molydopterin dinucleotide-binding region  35.43 
 
 		 130 aa  99  2e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.526644  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0493  molydopterin dinucleotide-binding region  39.13 
 
 		 128 aa  77  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.461417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0344  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  39.45 
 
 		 128 aa  77  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1426  molydopterin dinucleotide-binding region  38.26 
 
 		 128 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0422666  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0561  molydopterin dinucleotide-binding region  37.39 
 
 		 128 aa  74.7  0.0000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2923  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  30.17 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0830145  hitchhiker  0.000724487 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1186  molydopterin dinucleotide-binding region  36.29 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0619924  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1450  formylmethanofuran dehydrogenase  38.66 
 
 		 415 aa  60.1  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1095  molydopterin dinucleotide-binding region  31.82 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1531  formylmethanofuran dehydrogenase  36.97 
 
 		 415 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000509371 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0381  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  36.13 
 
 		 415 aa  55.5  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0976  molydopterin dinucleotide-binding region  27.1 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2107  molydopterin dinucleotide-binding region  31.06 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1291  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  32.17 
 
 		 129 aa  53.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.75311 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1663  formylmethanofuran dehydrogenase  32.77 
 
 		 424 aa  51.2  0.000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0084  formylmethanofuran dehydrogenase  27.97 
 
 		 425 aa  50.8  0.000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0337  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  23.73 
 
 		 132 aa  45.4  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0282  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  28.46 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.24864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>