32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2237 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2237  molydopterin dinucleotide-binding region  100 
 
 		 134 aa  276  9e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.255256  normal  0.0380736 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2236  molydopterin dinucleotide-binding region  89.55 
 
 		 134 aa  254  3e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.750152  normal  0.0387564 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0621  molydopterin dinucleotide-binding region  78.29 
 
 		 133 aa  221  4e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.270676  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0243  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  72.87 
 
 		 131 aa  202  9e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.208129  normal  0.212279 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1984  molydopterin dinucleotide-binding region  68.18 
 
 		 133 aa  192  2e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.191705 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0878  molydopterin dinucleotide-binding region  60.63 
 
 		 136 aa  163  9e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.385852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1470  molydopterin dinucleotide-binding region  51.59 
 
 		 136 aa  137  3e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0204  molydopterin dinucleotide-binding region  51.85 
 
 		 137 aa  135  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0715847 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1987  molydopterin dinucleotide-binding region  50.81 
 
 		 137 aa  123  8.000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.295284  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0373  molydopterin dinucleotide-binding region  51.26 
 
 		 129 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.827239  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1463  molydopterin dinucleotide-binding region  38.58 
 
 		 130 aa  110  9e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0101  molydopterin dinucleotide-binding region  37.8 
 
 		 130 aa  108  3e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.526644  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1426  molydopterin dinucleotide-binding region  48.03 
 
 		 128 aa  100  7e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0422666  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0493  molydopterin dinucleotide-binding region  46.03 
 
 		 128 aa  98.6  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.461417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0344  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  44.53 
 
 		 128 aa  97.8  4e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1993  molydopterin dinucleotide-binding region  44.07 
 
 		 134 aa  98.2  4e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0699041  normal  0.338946 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0561  molydopterin dinucleotide-binding region  44.09 
 
 		 128 aa  93.2  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2923  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  35.04 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0830145  hitchhiker  0.000724487 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1095  molydopterin dinucleotide-binding region  37.5 
 
 		 123 aa  73.6  0.0000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1186  molydopterin dinucleotide-binding region  36.8 
 
 		 129 aa  70.5  0.000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0619924  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1389  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  32.77 
 
 		 574 aa  69.7  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2107  molydopterin dinucleotide-binding region  35.43 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1291  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  36.22 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.75311 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0282  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  36 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.24864  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0976  molydopterin dinucleotide-binding region  32.71 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0084  formylmethanofuran dehydrogenase  31.15 
 
 		 425 aa  62  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1450  formylmethanofuran dehydrogenase  38.39 
 
 		 415 aa  57  0.00000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1531  formylmethanofuran dehydrogenase  38.39 
 
 		 415 aa  56.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000509371 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0381  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  37.5 
 
 		 415 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1663  formylmethanofuran dehydrogenase  32.31 
 
 		 424 aa  53.1  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0337  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  25.44 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1829  molydopterin dinucleotide-binding region  30.83 
 
 		 587 aa  44.3  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>