54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0101 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_0101  molydopterin dinucleotide-binding region  100 
 
 
130 aa  263  5.999999999999999e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.526644  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1463  molydopterin dinucleotide-binding region  98.46 
 
 
130 aa  260  4e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0243  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  40.62 
 
 
131 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.208129  normal  0.212279 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0621  molydopterin dinucleotide-binding region  41.94 
 
 
133 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.270676  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1426  molydopterin dinucleotide-binding region  42.97 
 
 
128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0422666  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1984  molydopterin dinucleotide-binding region  39.68 
 
 
133 aa  111  3e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.191705 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0493  molydopterin dinucleotide-binding region  41.41 
 
 
128 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.461417  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0344  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  41.41 
 
 
128 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2237  molydopterin dinucleotide-binding region  37.8 
 
 
134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.255256  normal  0.0380736 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2236  molydopterin dinucleotide-binding region  37.01 
 
 
134 aa  106  9.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.750152  normal  0.0387564 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0561  molydopterin dinucleotide-binding region  40.62 
 
 
128 aa  105  2e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0878  molydopterin dinucleotide-binding region  40.16 
 
 
136 aa  103  9e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.385852  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1470  molydopterin dinucleotide-binding region  36.51 
 
 
136 aa  101  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0204  molydopterin dinucleotide-binding region  35.43 
 
 
137 aa  99  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0715847 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1987  molydopterin dinucleotide-binding region  36.36 
 
 
137 aa  98.6  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.295284  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1993  molydopterin dinucleotide-binding region  36.97 
 
 
134 aa  95.9  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0699041  normal  0.338946 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0373  molydopterin dinucleotide-binding region  36.36 
 
 
129 aa  92.8  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.827239  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1186  molydopterin dinucleotide-binding region  43.64 
 
 
129 aa  80.9  0.000000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0619924  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1095  molydopterin dinucleotide-binding region  31.9 
 
 
123 aa  71.2  0.000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2923  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  31.48 
 
 
132 aa  67.8  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0830145  hitchhiker  0.000724487 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0976  molydopterin dinucleotide-binding region  28.95 
 
 
125 aa  65.9  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2107  molydopterin dinucleotide-binding region  30.7 
 
 
129 aa  65.1  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1389  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  28.7 
 
 
574 aa  63.9  0.0000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1450  formylmethanofuran dehydrogenase  33.33 
 
 
415 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0381  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  33.9 
 
 
415 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0084  formylmethanofuran dehydrogenase  29.92 
 
 
425 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1291  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  31.62 
 
 
129 aa  62  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.75311 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1531  formylmethanofuran dehydrogenase  33.9 
 
 
415 aa  61.6  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000509371 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0282  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  28.21 
 
 
129 aa  58.9  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.24864  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1829  molydopterin dinucleotide-binding region  32.43 
 
 
587 aa  58.2  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0337  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  30.69 
 
 
132 aa  57.8  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1663  formylmethanofuran dehydrogenase  29.57 
 
 
424 aa  54.3  0.0000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.62 
 
 
898 aa  54.3  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1457  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.91 
 
 
657 aa  47.8  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1999  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.02 
 
 
657 aa  45.4  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07590  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  38.1 
 
 
851 aa  45.1  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.676481 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0555  formate dehydrogenase subunit alpha  27.59 
 
 
957 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.358497 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0389  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.82 
 
 
944 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1391  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.71 
 
 
947 aa  43.9  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0031  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.77 
 
 
1000 aa  43.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3660  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.25 
 
 
888 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0735  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.5 
 
 
952 aa  42.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2721  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.96 
 
 
716 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0016187  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2853  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.35 
 
 
960 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.771386 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0619  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.68 
 
 
956 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.961077  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.68 
 
 
686 aa  41.6  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0413343  normal  0.361775 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4578  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.35 
 
 
723 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2383  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.59 
 
 
959 aa  41.2  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4097  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.79 
 
 
959 aa  40.8  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0727  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.5 
 
 
979 aa  40.4  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216931  normal  0.398444 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2338  molybdopterin oxidoreductase  31.75 
 
 
884 aa  40.8  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1268  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.96 
 
 
716 aa  40.4  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.424555  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3023  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.05 
 
 
982 aa  40  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0162015  normal  0.0152175 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4699  molybdopterin oxidoreductase  31.82 
 
 
869 aa  40  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>