More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1389 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1389  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  100 
 
 
574 aa  1186    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1829  molydopterin dinucleotide-binding region  50.88 
 
 
587 aa  613  9.999999999999999e-175  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2108  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  52.34 
 
 
434 aa  503  1e-141  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1187  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  51.75 
 
 
429 aa  488  1e-137  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.639664  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1096  molybdopterin oxidoreductase  45.43 
 
 
430 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2235  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  42.4 
 
 
437 aa  402  1e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.291466  normal  0.0456097 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0067  molybdopterin oxidoreductase  43.52 
 
 
434 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.589018  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0620  molybdopterin oxidoreductase  43.82 
 
 
437 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.475538  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0993  molybdopterin oxidoreductase  42.56 
 
 
434 aa  393  1e-108  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0244  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  43.59 
 
 
438 aa  395  1e-108  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.833805  normal  0.256127 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1715  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  41.11 
 
 
437 aa  390  1e-107  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0966  tungsten containing formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  40.88 
 
 
434 aa  389  1e-107  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0980  molybdopterin oxidoreductase  40.42 
 
 
434 aa  387  1e-106  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0412104  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0100  molybdopterin oxidoreductase  43.29 
 
 
434 aa  381  1e-104  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.193455  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1983  molybdopterin oxidoreductase  41.86 
 
 
439 aa  380  1e-104  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0877  molybdopterin oxidoreductase  42.49 
 
 
461 aa  377  1e-103  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.138974  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1462  molybdopterin oxidoreductase  42.59 
 
 
434 aa  372  1e-101  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.701357  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1988  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  39.36 
 
 
443 aa  358  9.999999999999999e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.209103  normal  0.117203 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1994  molybdopterin oxidoreductase  40.73 
 
 
467 aa  356  5e-97  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0821862  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0372  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  40.18 
 
 
456 aa  356  5.999999999999999e-97  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1471  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  39.4 
 
 
461 aa  344  2.9999999999999997e-93  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1664  molybdenum containing formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  37.93 
 
 
442 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.827559  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0281  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  39.77 
 
 
435 aa  334  3e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1532  molybdenum containing formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  38.43 
 
 
443 aa  334  3e-90  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00478576 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0380  molybdenum containing formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  38.52 
 
 
443 aa  333  6e-90  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1449  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  38.39 
 
 
442 aa  332  8e-90  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0203  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  39.53 
 
 
454 aa  332  1e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1763  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  37.33 
 
 
470 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0085  molybdopterin oxidoreductase  36.51 
 
 
447 aa  313  4.999999999999999e-84  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1292  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  36.18 
 
 
433 aa  310  5e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.646537 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1560  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  35.94 
 
 
454 aa  297  4e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0264444  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0336  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  34.75 
 
 
414 aa  257  5e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0977  tungsten formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  35.15 
 
 
406 aa  249  1e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2922  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  29.12 
 
 
415 aa  213  1e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113805  hitchhiker  0.00114048 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1662  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  28.11 
 
 
434 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0130611  normal  0.319857 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0025  formylmethanofuran dehydrogenase  25.41 
 
 
425 aa  128  3e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2107  molydopterin dinucleotide-binding region  44.09 
 
 
129 aa  118  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1186  molydopterin dinucleotide-binding region  39.84 
 
 
129 aa  107  8e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0619924  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2299  Formylmethanofuran dehydrogenase subunit B-like protein  22.76 
 
 
427 aa  96.3  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.122072  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1426  molydopterin dinucleotide-binding region  38.52 
 
 
128 aa  89.4  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0422666  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0344  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  37.7 
 
 
128 aa  87  7e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1095  molydopterin dinucleotide-binding region  38.33 
 
 
123 aa  87  9e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0493  molydopterin dinucleotide-binding region  37.7 
 
 
128 aa  85.9  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.461417  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1457  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.62 
 
 
657 aa  84.3  0.000000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0913  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.44 
 
 
668 aa  83.6  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2860  formylmethanofuran dehydrogenase  22.25 
 
 
423 aa  82.4  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.807809  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2623  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  23.18 
 
 
423 aa  82.8  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1339  formate dehydrogenase, alpha subunit  22.74 
 
 
662 aa  82  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0561  molydopterin dinucleotide-binding region  34.43 
 
 
128 aa  80.9  0.00000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0627  molybdopterin oxidoreductase family protein  23.78 
 
 
978 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4710  molybdopterin oxidoreductase family protein  23.78 
 
 
978 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0104  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.57 
 
 
724 aa  79  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0641  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.06 
 
 
979 aa  78.2  0.0000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0499  formate dehydrogenase, alpha subunit, anaerobic  23.5 
 
 
978 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0501  formate dehydrogenase, alpha subunit, anaerobic  23.5 
 
 
978 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0464  formate dehydrogenase, alpha subunit  22.3 
 
 
987 aa  78.2  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0716  molybdopterin oxidoreductase family protein  23.21 
 
 
978 aa  77.4  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0655  molybdopterin oxidoreductase family protein  23.21 
 
 
978 aa  77  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0557  molybdopterin oxidoreductase family protein  23.21 
 
 
978 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0589  molybdopterin oxidoreductase family protein  23.21 
 
 
978 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0502  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.03 
 
 
980 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0645  molybdopterin oxidoreductase family protein  23.21 
 
 
978 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.293395 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00920  formate dehydrogenase alpha subunit  25.84 
 
 
737 aa  75.9  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1999  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.4 
 
 
657 aa  74.7  0.000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1341  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.46 
 
 
987 aa  74.3  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6504  formyltransferase/hydrolase complex subunit B(FhcB)  29.19 
 
 
469 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0374331 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2513  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.16 
 
 
927 aa  73.6  0.000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0190469  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1405  molybdopterin oxidoreductase  25.05 
 
 
720 aa  73.2  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2823  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.34 
 
 
949 aa  72.8  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.156592  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0621  molydopterin dinucleotide-binding region  33.04 
 
 
133 aa  73.2  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.270676  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0505  formate dehydrogenase, alpha subunit  22.47 
 
 
980 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2021  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.26 
 
 
686 aa  72.4  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463591  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3681  molybdopterin oxidoreductase family protein  23.78 
 
 
979 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.725199  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03951  formate dehydrogenase-H, selenopolypeptide subunit  24.3 
 
 
715 aa  72  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.803476  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3913  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.3 
 
 
715 aa  72  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4113  formate dehydrogenase, alpha subunit  22.41 
 
 
901 aa  72  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163208  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3948  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.3 
 
 
715 aa  72  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4542  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  24.3 
 
 
715 aa  72  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03911  hypothetical protein  24.3 
 
 
715 aa  72  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.988265  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4324  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  24.3 
 
 
715 aa  72  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.12 
 
 
893 aa  71.2  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  22.88 
 
 
676 aa  71.2  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2424  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.42 
 
 
718 aa  70.9  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.680227 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1318  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.84 
 
 
973 aa  70.9  0.00000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2236  molydopterin dinucleotide-binding region  34.86 
 
 
134 aa  70.9  0.00000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.750152  normal  0.0387564 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0843  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.18 
 
 
994 aa  70.5  0.00000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1925  formate dehydrogenase, alpha subunit  22.83 
 
 
986 aa  70.5  0.00000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2333  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.67 
 
 
984 aa  69.7  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1636  molybdopterin oxidoreductase family protein  23.78 
 
 
979 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.632493  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3367  molybdopterin oxidoreductase family protein  23.21 
 
 
979 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3331  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.21 
 
 
979 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.291632  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3631  molybdopterin oxidoreductase family protein  23.21 
 
 
979 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.461158  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2237  molydopterin dinucleotide-binding region  32.77 
 
 
134 aa  69.7  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.255256  normal  0.0380736 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2376  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.67 
 
 
984 aa  69.7  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3581  molybdopterin oxidoreductase family protein  23.21 
 
 
979 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0243  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  35.78 
 
 
131 aa  69.3  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.208129  normal  0.212279 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3588  molybdopterin oxidoreductase family protein  23.21 
 
 
1012 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4651  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.51 
 
 
937 aa  69.3  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2461  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  23.19 
 
 
466 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3190  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.43 
 
 
924 aa  68.9  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.523924  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>