More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0980 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1715  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  97.93 
 
 		 437 aa  896    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0966  tungsten containing formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  99.54 
 
 		 434 aa  905    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0067  molybdopterin oxidoreductase  67.44 
 
 		 434 aa  654    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.589018  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0980  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 		 434 aa  907    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0412104  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0993  molybdopterin oxidoreductase  91.45 
 
 		 434 aa  850    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1462  molybdopterin oxidoreductase  59.91 
 
 		 434 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.701357  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0100  molybdopterin oxidoreductase  54.38 
 
 		 434 aa  501  1e-141  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.193455  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0620  molybdopterin oxidoreductase  53.83 
 
 		 437 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.475538  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0244  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  53.32 
 
 		 438 aa  485  1e-136  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.833805  normal  0.256127 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1983  molybdopterin oxidoreductase  53.23 
 
 		 439 aa  487  1e-136  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2235  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  52.87 
 
 		 437 aa  488  1e-136  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.291466  normal  0.0456097 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1187  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  48.27 
 
 		 429 aa  432  1e-120  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.639664  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1471  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  48.05 
 
 		 461 aa  426  1e-118  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0877  molybdopterin oxidoreductase  50.12 
 
 		 461 aa  428  1e-118  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.138974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2108  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  46.3 
 
 		 434 aa  422  1e-117  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0372  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  47.24 
 
 		 456 aa  418  1e-116  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1829  molydopterin dinucleotide-binding region  43.69 
 
 		 587 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0203  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  49.08 
 
 		 454 aa  414  1e-114  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1988  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  46 
 
 		 443 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.209103  normal  0.117203 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1994  molybdopterin oxidoreductase  44.14 
 
 		 467 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0821862  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1096  molybdopterin oxidoreductase  44.47 
 
 		 430 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0380  molybdenum containing formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  43.68 
 
 		 443 aa  392  1e-108  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1532  molybdenum containing formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  43.25 
 
 		 443 aa  393  1e-108  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00478576 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0085  molybdopterin oxidoreductase  42.11 
 
 		 447 aa  392  1e-108  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0281  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  42.43 
 
 		 435 aa  392  1e-108  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1664  molybdenum containing formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  41.88 
 
 		 442 aa  391  1e-107  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.827559  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1449  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  43.45 
 
 		 442 aa  388  1e-106  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1389  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  40.42 
 
 		 574 aa  387  1e-106  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1292  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  40.46 
 
 		 433 aa  370  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.646537 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1763  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  39.91 
 
 		 470 aa  366  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1560  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  38.57 
 
 		 454 aa  347  3e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0264444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0977  tungsten formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  32.87 
 
 		 406 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0336  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  33.64 
 
 		 414 aa  237  3e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2922  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  33.5 
 
 		 415 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113805  hitchhiker  0.00114048 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0025  formylmethanofuran dehydrogenase  27.94 
 
 		 425 aa  169  6e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1662  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  26.4 
 
 		 434 aa  132  9e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0130611  normal  0.319857 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2860  formylmethanofuran dehydrogenase  26.17 
 
 		 423 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.807809  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2299  Formylmethanofuran dehydrogenase subunit B-like protein  23.04 
 
 		 427 aa  94.7  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.122072  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1538  formate dehydrogenase, alpha subunit  22.57 
 
 		 676 aa  91.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.4 
 
 		 676 aa  89.4  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.86 
 
 		 676 aa  88.2  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.39 
 
 		 917 aa  87.8  3e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3067  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  26.41 
 
 		 410 aa  87.4  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2400  tungsten-containing formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  26.2 
 
 		 369 aa  85.9  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2859  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.31 
 
 		 808 aa  84.7  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.960143 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2021  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.86 
 
 		 686 aa  83.6  0.000000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.96 
 
 		 879 aa  81.3  0.00000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0543  formate dehydrogenase, alpha subunit  22.56 
 
 		 674 aa  81.3  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.16552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0324  formate dehydrogenase alpha subunit  24.35 
 
 		 713 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0913  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.24 
 
 		 668 aa  81.3  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1391  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.79 
 
 		 947 aa  80.9  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2023  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.56 
 
 		 685 aa  81.3  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0303762  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.75 
 
 		 677 aa  80.5  0.00000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  22.92 
 
 		 900 aa  79.3  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1753  formate dehydrogenase alpha subunit  23.55 
 
 		 716 aa  79  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0179443  hitchhiker  0.000996092 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1457  formate dehydrogenase, alpha subunit  23 
 
 		 657 aa  79  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2424  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.77 
 
 		 718 aa  78.6  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.680227 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2461  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  23.21 
 
 		 466 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1376  formate dehydrogenase, alpha subunit  22.36 
 
 		 674 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0754319  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1796  formylmethanofuran dehydrogenase  23.64 
 
 		 440 aa  78.6  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00519016  normal  0.685943 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0104  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.51 
 
 		 724 aa  78.2  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1999  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.74 
 
 		 657 aa  77.8  0.0000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2623  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  23.06 
 
 		 423 aa  77.8  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00920  formate dehydrogenase alpha subunit  24.16 
 
 		 737 aa  77.4  0.0000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0295  formate dehydrogenase, alpha subunit  22.15 
 
 		 674 aa  77.8  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0587435  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6504  formyltransferase/hydrolase complex subunit B(FhcB)  24.47 
 
 		 469 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0374331 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0608  formate dehydrogenase, alpha subunit  22.89 
 
 		 674 aa  76.3  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.42 
 
 		 898 aa  75.9  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.64 
 
 		 688 aa  75.5  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0729  formate dehydrogenase H  23.55 
 
 		 715 aa  75.1  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.708724 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3829  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.48 
 
 		 715 aa  74.7  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.151921  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3682  anaerobic formate dehydrogenase, alpha subunit, -type  23.48 
 
 		 715 aa  74.7  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0641  formate dehydrogenase, alpha subunit  21.57 
 
 		 979 aa  74.3  0.000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3552  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.46 
 
 		 960 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3660  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.95 
 
 		 888 aa  73.2  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0031  formate dehydrogenase, alpha subunit  21.72 
 
 		 1000 aa  73.2  0.000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3023  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.44 
 
 		 982 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0162015  normal  0.0152175 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0895  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.79 
 
 		 983 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.99873  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2750  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.81 
 
 		 969 aa  72.4  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0453604 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2185  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.4 
 
 		 960 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.602321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0964  NAD-dependent formate dehydrogenase, alpha subunit  24.72 
 
 		 982 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.133867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1268  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.48 
 
 		 716 aa  73.2  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.424555  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0727  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.1 
 
 		 979 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216931  normal  0.398444 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0555  formate dehydrogenase subunit alpha  23.21 
 
 		 957 aa  72  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.358497 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0990  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.51 
 
 		 983 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.656443 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0552  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.51 
 
 		 983 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.918724  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1031  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.51 
 
 		 983 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52357  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1925  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.22 
 
 		 986 aa  71.6  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1809  formate dehydrogenase, alpha subunit  22.91 
 
 		 960 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.550904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1708  formate dehydrogenase, alpha subunit  22.91 
 
 		 959 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4024  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.36 
 
 		 966 aa  71.2  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2366  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.72 
 
 		 983 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.739285 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0619  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.44 
 
 		 956 aa  71.2  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.961077  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2721  formate dehydrogenase, alpha subunit  22.32 
 
 		 716 aa  70.9  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0016187  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1781  formate dehydrogenase, alpha subunit  22.03 
 
 		 716 aa  70.9  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4113  formate dehydrogenase, alpha subunit  20.53 
 
 		 901 aa  71.2  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163208  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1339  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.27 
 
 		 662 aa  71.2  0.00000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3916  formate dehydrogenase alpha subunit  25.21 
 
 		 950 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.733885 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.34 
 
 		 685 aa  70.9  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0907  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.94 
 
 		 983 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.979482  decreased coverage  0.00925571 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>