More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1983 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2235  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  73.97 
 
 		 437 aa  712    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.291466  normal  0.0456097 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0620  molybdopterin oxidoreductase  75.8 
 
 		 437 aa  709    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.475538  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1983  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 		 439 aa  917    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0244  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  73.46 
 
 		 438 aa  681    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.833805  normal  0.256127 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0877  molybdopterin oxidoreductase  64.24 
 
 		 461 aa  593  1e-168  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.138974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0372  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  55.81 
 
 		 456 aa  533  1e-150  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1988  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  53.86 
 
 		 443 aa  514  1e-144  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.209103  normal  0.117203 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1994  molybdopterin oxidoreductase  51.52 
 
 		 467 aa  491  9.999999999999999e-139  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0821862  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0966  tungsten containing formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  53 
 
 		 434 aa  486  1e-136  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0203  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  53.67 
 
 		 454 aa  488  1e-136  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0980  molybdopterin oxidoreductase  53.23 
 
 		 434 aa  487  1e-136  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0412104  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1715  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  52.76 
 
 		 437 aa  483  1e-135  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0993  molybdopterin oxidoreductase  52.63 
 
 		 434 aa  481  1e-135  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0067  molybdopterin oxidoreductase  53.36 
 
 		 434 aa  480  1e-134  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.589018  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1471  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  51.49 
 
 		 461 aa  477  1e-133  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0100  molybdopterin oxidoreductase  49.3 
 
 		 434 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.193455  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1462  molybdopterin oxidoreductase  48.03 
 
 		 434 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.701357  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2108  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  45.5 
 
 		 434 aa  424  1e-117  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1187  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  46.99 
 
 		 429 aa  411  1e-113  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.639664  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1829  molydopterin dinucleotide-binding region  44.68 
 
 		 587 aa  410  1e-113  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1096  molybdopterin oxidoreductase  45.29 
 
 		 430 aa  398  9.999999999999999e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1389  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  41.86 
 
 		 574 aa  380  1e-104  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0085  molybdopterin oxidoreductase  42.5 
 
 		 447 aa  375  1e-103  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1664  molybdenum containing formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  41.46 
 
 		 442 aa  373  1e-102  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.827559  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0380  molybdenum containing formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  39.18 
 
 		 443 aa  364  1e-99  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1449  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  39.32 
 
 		 442 aa  364  2e-99  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1532  molybdenum containing formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  38.81 
 
 		 443 aa  362  1e-98  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00478576 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0281  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  39.54 
 
 		 435 aa  342  5.999999999999999e-93  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1292  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  37.79 
 
 		 433 aa  333  3e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.646537 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1763  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  37.73 
 
 		 470 aa  330  3e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1560  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  36.84 
 
 		 454 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0264444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0977  tungsten formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  35.73 
 
 		 406 aa  247  2e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0336  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  32.55 
 
 		 414 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2922  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  31.7 
 
 		 415 aa  211  3e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113805  hitchhiker  0.00114048 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0025  formylmethanofuran dehydrogenase  26.03 
 
 		 425 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1662  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  25.6 
 
 		 434 aa  113  8.000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0130611  normal  0.319857 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2860  formylmethanofuran dehydrogenase  24.33 
 
 		 423 aa  108  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.807809  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2299  Formylmethanofuran dehydrogenase subunit B-like protein  23.86 
 
 		 427 aa  107  4e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.122072  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1999  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.96 
 
 		 657 aa  103  6e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02278  hypothetical protein  28.96 
 
 		 951 aa  98.2  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.19 
 
 		 879 aa  97.1  5e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0059  molybdopterin oxidoreductase  29.17 
 
 		 949 aa  96.3  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.65892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5935  formylmethanofuran dehydrogenase  23.52 
 
 		 446 aa  95.5  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.911434  normal  0.0527378 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2461  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  23.67 
 
 		 466 aa  94.7  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003494  formate dehydrogenase-O major subunit  28.66 
 
 		 951 aa  94.4  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0641  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.45 
 
 		 979 aa  93.6  6e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4113  formate dehydrogenase, alpha subunit  22.67 
 
 		 901 aa  93.6  6e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163208  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3609  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.56 
 
 		 950 aa  92.4  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1453  formate dehydrogenase  28.85 
 
 		 951 aa  92.4  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.14 
 
 		 685 aa  90.5  6e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3920  formate dehydrogenase alpha subunit  27.56 
 
 		 950 aa  90.1  6e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.922429 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1457  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.36 
 
 		 657 aa  90.1  7e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3724  formate dehydrogenase alpha subunit  27.24 
 
 		 950 aa  89.7  8e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3795  formate dehydrogenase alpha subunit  27.24 
 
 		 950 aa  89.7  8e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0229  molybdopterin oxidoreductase  27.18 
 
 		 950 aa  89.7  9e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.363214 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4110  molybdopterin oxidoreductase  27.24 
 
 		 950 aa  89.7  9e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0333  molybdopterin oxidoreductase  28.3 
 
 		 950 aa  89.7  9e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1796  formylmethanofuran dehydrogenase  27.23 
 
 		 440 aa  89.7  9e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00519016  normal  0.685943 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4140  molybdopterin oxidoreductase  27.24 
 
 		 950 aa  89.7  9e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3926  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.28 
 
 		 924 aa  89.4  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4513  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.66 
 
 		 950 aa  89  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4228  molybdopterin oxidoreductase  27.24 
 
 		 950 aa  89.7  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413313 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3190  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.12 
 
 		 924 aa  88.6  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.523924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3720  formate dehydrogenase alpha subunit  27.83 
 
 		 950 aa  88.6  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.933728 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4137  molybdopterin oxidoreductase  29.17 
 
 		 949 aa  87.8  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3791  formate dehydrogenase alpha subunit  27.51 
 
 		 950 aa  87.8  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0337  molybdopterin oxidoreductase  27.24 
 
 		 949 aa  87.8  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4421  molybdopterin oxidoreductase  27.83 
 
 		 949 aa  87.4  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0104  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.73 
 
 		 724 aa  87.4  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0063  molybdopterin oxidoreductase  26.92 
 
 		 951 aa  87  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0295  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.2 
 
 		 674 aa  86.7  9e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0587435  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  21.91 
 
 		 917 aa  85.9  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4813  molybdopterin oxidoreductase  26.6 
 
 		 949 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.517826 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4133  molybdopterin oxidoreductase  26.92 
 
 		 951 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.987786  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4136  molybdopterin oxidoreductase  26.6 
 
 		 950 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.448434  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2859  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.05 
 
 		 808 aa  85.5  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.960143 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4417  molybdopterin oxidoreductase  26.28 
 
 		 951 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0233  molybdopterin oxidoreductase  26.6 
 
 		 950 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00484847 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1120  putative formate dehydrogenase, alpha subunit  28.21 
 
 		 951 aa  85.5  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1318  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.38 
 
 		 973 aa  85.5  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3916  formate dehydrogenase alpha subunit  27.88 
 
 		 950 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.733885 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1238  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.36 
 
 		 721 aa  84.7  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.768724  normal  0.0266527 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0057  twin-arginine translocation pathway signal  27.18 
 
 		 949 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00920  formate dehydrogenase alpha subunit  25.5 
 
 		 737 aa  84.3  0.000000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1376  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.09 
 
 		 674 aa  84  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0754319  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0913  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.84 
 
 		 668 aa  84  0.000000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4106  molybdopterin oxidoreductase  26.28 
 
 		 950 aa  83.6  0.000000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4809  molybdopterin oxidoreductase  27.07 
 
 		 951 aa  83.6  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.215861 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1813  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.03 
 
 		 688 aa  83.2  0.000000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4224  molybdopterin oxidoreductase  26.28 
 
 		 950 aa  83.6  0.000000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105156 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1538  formate dehydrogenase, alpha subunit  25 
 
 		 676 aa  83.2  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0685  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.1 
 
 		 718 aa  82.8  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.85 
 
 		 676 aa  82.4  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1624  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.17 
 
 		 687 aa  83.2  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.81 
 
 		 676 aa  82.8  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0543  formate dehydrogenase, alpha subunit  22.47 
 
 		 674 aa  82.4  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.16552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3613  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.92 
 
 		 949 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.982249  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3331  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.69 
 
 		 979 aa  82  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.291632  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.51 
 
 		 900 aa  81.6  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2623  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  23.82 
 
 		 423 aa  82.4  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>