46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2922 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2922  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  100 
 
 		 415 aa  855    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113805  hitchhiker  0.00114048 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0336  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  59.52 
 
 		 414 aa  514  1e-144  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0977  tungsten formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  47.32 
 
 		 406 aa  384  1e-105  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1829  molydopterin dinucleotide-binding region  33.41 
 
 		 587 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1187  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  34.22 
 
 		 429 aa  230  3e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.639664  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1096  molybdopterin oxidoreductase  33.09 
 
 		 430 aa  228  2e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0067  molybdopterin oxidoreductase  34.19 
 
 		 434 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.589018  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2108  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  32.24 
 
 		 434 aa  220  5e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2235  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  32.35 
 
 		 437 aa  218  1e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.291466  normal  0.0456097 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0966  tungsten containing formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  33.74 
 
 		 434 aa  216  7e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0980  molybdopterin oxidoreductase  33.5 
 
 		 434 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0412104  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1715  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  33.25 
 
 		 437 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1389  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  29.12 
 
 		 574 aa  213  7e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1983  molybdopterin oxidoreductase  31.7 
 
 		 439 aa  211  2e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0244  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  32.02 
 
 		 438 aa  210  3e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.833805  normal  0.256127 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0993  molybdopterin oxidoreductase  33 
 
 		 434 aa  210  5e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0620  molybdopterin oxidoreductase  31.62 
 
 		 437 aa  206  5e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.475538  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0100  molybdopterin oxidoreductase  32.47 
 
 		 434 aa  206  8e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.193455  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1462  molybdopterin oxidoreductase  32.46 
 
 		 434 aa  199  6e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.701357  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1292  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  31.38 
 
 		 433 aa  197  3e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.646537 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1763  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  31.31 
 
 		 470 aa  197  3e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0281  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  31.52 
 
 		 435 aa  192  1e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1560  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  31.54 
 
 		 454 aa  186  5e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0264444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1664  molybdenum containing formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  30.51 
 
 		 442 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.827559  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0877  molybdopterin oxidoreductase  29.83 
 
 		 461 aa  183  5.0000000000000004e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.138974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0372  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  31.89 
 
 		 456 aa  182  7e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1449  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  30.99 
 
 		 442 aa  178  1e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1994  molybdopterin oxidoreductase  28.31 
 
 		 467 aa  178  1e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0821862  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1988  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  30.31 
 
 		 443 aa  178  1e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.209103  normal  0.117203 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0380  molybdenum containing formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  30.71 
 
 		 443 aa  178  2e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1532  molybdenum containing formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  30.96 
 
 		 443 aa  177  3e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00478576 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1471  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  28.34 
 
 		 461 aa  167  2.9999999999999998e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0203  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  30.79 
 
 		 454 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0085  molybdopterin oxidoreductase  27.94 
 
 		 447 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2299  Formylmethanofuran dehydrogenase subunit B-like protein  24.24 
 
 		 427 aa  106  8e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.122072  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0025  formylmethanofuran dehydrogenase  23.08 
 
 		 425 aa  85.5  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6504  formyltransferase/hydrolase complex subunit B(FhcB)  25 
 
 		 469 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0374331 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2461  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  25.79 
 
 		 466 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2400  tungsten-containing formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  25.53 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3067  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  21.81 
 
 		 410 aa  62.8  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1796  formylmethanofuran dehydrogenase  29.33 
 
 		 440 aa  60.1  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00519016  normal  0.685943 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1662  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  23.65 
 
 		 434 aa  58.5  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0130611  normal  0.319857 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2860  formylmethanofuran dehydrogenase  21.28 
 
 		 423 aa  58.9  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.807809  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2623  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  21.31 
 
 		 423 aa  53.1  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5935  formylmethanofuran dehydrogenase  19.63 
 
 		 446 aa  46.2  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.911434  normal  0.0527378 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0610  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  28.68 
 
 		 768 aa  43.1  0.01  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.46141  hitchhiker  0.00785272 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>