More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0203 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1471  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  74.38 
 
 		 461 aa  699    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1988  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  74.14 
 
 		 443 aa  695    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.209103  normal  0.117203 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0372  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  76.48 
 
 		 456 aa  726    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0203  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  100 
 
 		 454 aa  947    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1994  molybdopterin oxidoreductase  63.62 
 
 		 467 aa  605  9.999999999999999e-173  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0821862  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2235  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  56.88 
 
 		 437 aa  553  1e-156  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.291466  normal  0.0456097 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0877  molybdopterin oxidoreductase  58.85 
 
 		 461 aa  548  1e-155  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.138974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0620  molybdopterin oxidoreductase  56.19 
 
 		 437 aa  539  9.999999999999999e-153  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.475538  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0244  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  54.13 
 
 		 438 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.833805  normal  0.256127 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1983  molybdopterin oxidoreductase  53.67 
 
 		 439 aa  505  9.999999999999999e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0966  tungsten containing formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  48.85 
 
 		 434 aa  425  1e-118  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0980  molybdopterin oxidoreductase  49.08 
 
 		 434 aa  426  1e-118  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0412104  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0067  molybdopterin oxidoreductase  48.16 
 
 		 434 aa  422  1e-117  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.589018  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1715  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  48.16 
 
 		 437 aa  424  1e-117  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0993  molybdopterin oxidoreductase  48.16 
 
 		 434 aa  419  1e-116  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0100  molybdopterin oxidoreductase  42.86 
 
 		 434 aa  375  1e-102  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.193455  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1829  molydopterin dinucleotide-binding region  42.76 
 
 		 587 aa  374  1e-102  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1462  molybdopterin oxidoreductase  43.09 
 
 		 434 aa  371  1e-101  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.701357  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1096  molybdopterin oxidoreductase  42.79 
 
 		 430 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2108  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  40.6 
 
 		 434 aa  349  5e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1187  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  40.97 
 
 		 429 aa  347  3e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.639664  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1389  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  39.53 
 
 		 574 aa  345  1e-93  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1664  molybdenum containing formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  37.99 
 
 		 442 aa  333  4e-90  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.827559  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0380  molybdenum containing formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  37.61 
 
 		 443 aa  325  1e-87  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1449  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  37.84 
 
 		 442 aa  324  2e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1532  molybdenum containing formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  37.39 
 
 		 443 aa  323  3e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00478576 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0281  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  36.16 
 
 		 435 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1292  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  35.19 
 
 		 433 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.646537 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0085  molybdopterin oxidoreductase  35.24 
 
 		 447 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1763  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  34.25 
 
 		 470 aa  288  2e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1560  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  33.7 
 
 		 454 aa  278  2e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0264444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0336  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  32.78 
 
 		 414 aa  224  2e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0977  tungsten formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  33.5 
 
 		 406 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2922  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  30.79 
 
 		 415 aa  181  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113805  hitchhiker  0.00114048 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0025  formylmethanofuran dehydrogenase  25.55 
 
 		 425 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1662  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  23.19 
 
 		 434 aa  100  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0130611  normal  0.319857 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2860  formylmethanofuran dehydrogenase  25.49 
 
 		 423 aa  100  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.807809  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.25 
 
 		 676 aa  90.9  4e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1538  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.25 
 
 		 676 aa  90.5  6e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0324  formate dehydrogenase alpha subunit  26.97 
 
 		 713 aa  90.5  6e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2721  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.32 
 
 		 716 aa  89.4  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0016187  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.05 
 
 		 676 aa  89  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4578  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.03 
 
 		 723 aa  88.2  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.51 
 
 		 688 aa  87.8  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2021  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.41 
 
 		 686 aa  87.8  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3190  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.5 
 
 		 924 aa  87  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.523924  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1999  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.84 
 
 		 657 aa  85.1  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1268  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.7 
 
 		 716 aa  85.5  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.424555  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0196  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.96 
 
 		 689 aa  85.1  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.202612  hitchhiker  0.00634005 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1457  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.29 
 
 		 657 aa  83.6  0.000000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.94 
 
 		 917 aa  82.4  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1781  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.71 
 
 		 716 aa  82.8  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1383  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.25 
 
 		 716 aa  82.8  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.627092  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0543  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.36 
 
 		 674 aa  82  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.16552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2424  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.48 
 
 		 718 aa  81.6  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.680227 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.65 
 
 		 879 aa  82  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1112  molybdopterin oxidoreductase  30.83 
 
 		 919 aa  81.3  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3913  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.11 
 
 		 715 aa  80.5  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2023  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.25 
 
 		 685 aa  80.9  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0303762  normal  0.701303 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03951  formate dehydrogenase-H, selenopolypeptide subunit  26.11 
 
 		 715 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.803476  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4542  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  26.11 
 
 		 715 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4324  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  26.11 
 
 		 715 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3948  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.11 
 
 		 715 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03911  hypothetical protein  26.11 
 
 		 715 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.988265  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0295  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.36 
 
 		 674 aa  80.1  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0587435  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0729  formate dehydrogenase H  31.28 
 
 		 715 aa  79.3  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.708724 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00920  formate dehydrogenase alpha subunit  27.21 
 
 		 737 aa  79.7  0.0000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1376  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.07 
 
 		 674 aa  79.3  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0754319  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3682  anaerobic formate dehydrogenase, alpha subunit, -type  31.28 
 
 		 715 aa  79  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1796  formylmethanofuran dehydrogenase  27.13 
 
 		 440 aa  78.6  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00519016  normal  0.685943 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3829  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.28 
 
 		 715 aa  79  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.151921  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0104  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.2 
 
 		 724 aa  79  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.36 
 
 		 686 aa  78.2  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0413343  normal  0.361775 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0608  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.56 
 
 		 674 aa  77.8  0.0000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0031  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.44 
 
 		 1000 aa  77.4  0.0000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1282  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.5 
 
 		 933 aa  77  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.402771 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1339  formate dehydrogenase, alpha subunit  22.67 
 
 		 662 aa  76.6  0.0000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2576  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.88 
 
 		 925 aa  75.9  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3552  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.55 
 
 		 960 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4821  assimilatory nitrate reductase (NADH) large subunit  29.49 
 
 		 915 aa  75.9  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0576788  normal  0.823575 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2185  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.27 
 
 		 960 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.602321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0463  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  23.28 
 
 		 689 aa  75.5  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1753  formate dehydrogenase alpha subunit  24.94 
 
 		 716 aa  75.1  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0179443  hitchhiker  0.000996092 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1708  formate dehydrogenase, alpha subunit  25 
 
 		 959 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1391  formate dehydrogenase, alpha subunit  25 
 
 		 947 aa  74.3  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3089  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.61 
 
 		 959 aa  74.3  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.440267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3926  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.48 
 
 		 924 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0997  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.72 
 
 		 953 aa  73.6  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1809  formate dehydrogenase, alpha subunit  25 
 
 		 960 aa  73.9  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.550904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3520  formate dehydrogenase, alpha subunit  21.6 
 
 		 904 aa  73.9  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.05 
 
 		 685 aa  73.9  0.000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2299  Formylmethanofuran dehydrogenase subunit B-like protein  20.59 
 
 		 427 aa  73.6  0.000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.122072  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4863  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  28.51 
 
 		 906 aa  73.6  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0641  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.12 
 
 		 979 aa  73.2  0.000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1318  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.93 
 
 		 973 aa  72.8  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0464  formate dehydrogenase, alpha subunit  22.75 
 
 		 987 aa  72.8  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.28 
 
 		 677 aa  72.4  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1341  formate dehydrogenase, alpha subunit  22.68 
 
 		 987 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3724  formate dehydrogenase alpha subunit  25.72 
 
 		 950 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3795  formate dehydrogenase alpha subunit  25.72 
 
 		 950 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>