51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0977 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0977  tungsten formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  100 
 
 
406 aa  827    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0336  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  48.18 
 
 
414 aa  397  1e-109  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2922  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  47.32 
 
 
415 aa  384  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113805  hitchhiker  0.00114048 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1096  molybdopterin oxidoreductase  37.41 
 
 
430 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1187  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  37.41 
 
 
429 aa  267  2e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.639664  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1829  molydopterin dinucleotide-binding region  37.7 
 
 
587 aa  267  2e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2235  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  35.13 
 
 
437 aa  256  7e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.291466  normal  0.0456097 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1389  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  35.15 
 
 
574 aa  249  8e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0620  molybdopterin oxidoreductase  36.08 
 
 
437 aa  249  8e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.475538  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0067  molybdopterin oxidoreductase  34.41 
 
 
434 aa  248  1e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.589018  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1983  molybdopterin oxidoreductase  35.73 
 
 
439 aa  247  2e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0244  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  35.29 
 
 
438 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.833805  normal  0.256127 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1715  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  32.63 
 
 
437 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1462  molybdopterin oxidoreductase  34.66 
 
 
434 aa  243  3e-63  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.701357  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0980  molybdopterin oxidoreductase  32.87 
 
 
434 aa  243  3e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0412104  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0966  tungsten containing formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  32.63 
 
 
434 aa  242  7e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2108  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  33.41 
 
 
434 aa  243  7e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0100  molybdopterin oxidoreductase  34.04 
 
 
434 aa  239  4e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.193455  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0993  molybdopterin oxidoreductase  32.17 
 
 
434 aa  238  2e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0877  molybdopterin oxidoreductase  34.51 
 
 
461 aa  229  9e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.138974  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0372  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  32.7 
 
 
456 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1763  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  32.86 
 
 
470 aa  208  1e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1292  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  32.86 
 
 
433 aa  207  2e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.646537 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1994  molybdopterin oxidoreductase  31.31 
 
 
467 aa  207  3e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0821862  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1471  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  32.32 
 
 
461 aa  204  3e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0281  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  33.18 
 
 
435 aa  203  4e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1988  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  30.47 
 
 
443 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.209103  normal  0.117203 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0203  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  33.5 
 
 
454 aa  201  3e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1560  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  32.55 
 
 
454 aa  192  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0264444  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0085  molybdopterin oxidoreductase  30.44 
 
 
447 aa  188  2e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1532  molybdenum containing formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  29.37 
 
 
443 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00478576 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0380  molybdenum containing formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  29.6 
 
 
443 aa  182  1e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1664  molybdenum containing formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  28.74 
 
 
442 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.827559  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1449  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  28.9 
 
 
442 aa  179  9e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0025  formylmethanofuran dehydrogenase  25.35 
 
 
425 aa  101  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2299  Formylmethanofuran dehydrogenase subunit B-like protein  26.65 
 
 
427 aa  100  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.122072  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6504  formyltransferase/hydrolase complex subunit B(FhcB)  25.85 
 
 
469 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0374331 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2623  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  24.51 
 
 
423 aa  80.5  0.00000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1662  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  24.42 
 
 
434 aa  72.8  0.000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0130611  normal  0.319857 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2461  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  25.85 
 
 
466 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2860  formylmethanofuran dehydrogenase  24.26 
 
 
423 aa  67  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.807809  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3136  formylmethanofuran dehydrogenase  24.58 
 
 
433 aa  63.9  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5935  formylmethanofuran dehydrogenase  23.22 
 
 
446 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.911434  normal  0.0527378 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1796  formylmethanofuran dehydrogenase  31.33 
 
 
440 aa  56.6  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00519016  normal  0.685943 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3067  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  23.88 
 
 
410 aa  55.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1405  molybdopterin oxidoreductase  22.77 
 
 
720 aa  47.8  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0178  molybdopterin oxidoreductase  29.36 
 
 
891 aa  47.8  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1406  molybdopterin oxidoreductase  23.37 
 
 
704 aa  45.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0169  molybdopterin oxidoreductase  21.77 
 
 
720 aa  45.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1442  molybdopterin oxidoreductase  22.79 
 
 
882 aa  45.1  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.056801  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2680  molybdopterin oxidoreductase  29.2 
 
 
933 aa  44.3  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>