More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2235 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2235  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  100 
 
 		 437 aa  913    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.291466  normal  0.0456097 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0620  molybdopterin oxidoreductase  78.9 
 
 		 437 aa  753    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.475538  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1983  molybdopterin oxidoreductase  73.97 
 
 		 439 aa  712    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0244  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  74.83 
 
 		 438 aa  705    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.833805  normal  0.256127 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0877  molybdopterin oxidoreductase  66.44 
 
 		 461 aa  625  1e-178  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.138974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0372  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  58.94 
 
 		 456 aa  568  1e-161  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1988  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  57.31 
 
 		 443 aa  549  1e-155  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.209103  normal  0.117203 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0203  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  56.88 
 
 		 454 aa  533  1e-150  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1471  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  54.94 
 
 		 461 aa  512  1e-144  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1994  molybdopterin oxidoreductase  50.34 
 
 		 467 aa  501  1e-140  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0821862  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0980  molybdopterin oxidoreductase  52.87 
 
 		 434 aa  488  1e-136  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0412104  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1715  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  52.64 
 
 		 437 aa  485  1e-136  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0966  tungsten containing formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  52.64 
 
 		 434 aa  486  1e-136  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0993  molybdopterin oxidoreductase  53.26 
 
 		 434 aa  481  1e-134  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0067  molybdopterin oxidoreductase  50.46 
 
 		 434 aa  474  1e-132  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.589018  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0100  molybdopterin oxidoreductase  48.39 
 
 		 434 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.193455  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1462  molybdopterin oxidoreductase  48.39 
 
 		 434 aa  434  1e-120  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.701357  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2108  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  46.45 
 
 		 434 aa  434  1e-120  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1187  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  47.89 
 
 		 429 aa  419  1e-116  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.639664  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1829  molydopterin dinucleotide-binding region  44.94 
 
 		 587 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1096  molybdopterin oxidoreductase  46.67 
 
 		 430 aa  412  1e-114  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1389  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  42.4 
 
 		 574 aa  402  1e-111  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0085  molybdopterin oxidoreductase  43.41 
 
 		 447 aa  372  1e-102  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1664  molybdenum containing formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  41.78 
 
 		 442 aa  373  1e-102  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.827559  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1532  molybdenum containing formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  41.8 
 
 		 443 aa  372  1e-102  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00478576 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1449  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  41.69 
 
 		 442 aa  374  1e-102  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0380  molybdenum containing formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  41.32 
 
 		 443 aa  374  1e-102  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0281  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  40.05 
 
 		 435 aa  341  2e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1292  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  38.94 
 
 		 433 aa  333  3e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.646537 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1763  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  37.19 
 
 		 470 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1560  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  39.04 
 
 		 454 aa  316  4e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0264444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0977  tungsten formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  35.13 
 
 		 406 aa  256  8e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0336  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  34.92 
 
 		 414 aa  250  4e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2922  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  32.35 
 
 		 415 aa  218  1e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113805  hitchhiker  0.00114048 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0025  formylmethanofuran dehydrogenase  25.49 
 
 		 425 aa  138  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1662  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  25.18 
 
 		 434 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0130611  normal  0.319857 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1999  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.61 
 
 		 657 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2860  formylmethanofuran dehydrogenase  23.13 
 
 		 423 aa  102  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.807809  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1457  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.13 
 
 		 657 aa  99.4  1e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2299  Formylmethanofuran dehydrogenase subunit B-like protein  23.28 
 
 		 427 aa  99  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.122072  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4113  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.33 
 
 		 901 aa  98.6  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163208  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5935  formylmethanofuran dehydrogenase  24.88 
 
 		 446 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.911434  normal  0.0527378 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3926  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.78 
 
 		 924 aa  95.5  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6504  formyltransferase/hydrolase complex subunit B(FhcB)  24.89 
 
 		 469 aa  93.2  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0374331 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.84 
 
 		 917 aa  93.2  8e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03951  formate dehydrogenase-H, selenopolypeptide subunit  25.44 
 
 		 715 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.803476  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03911  hypothetical protein  25.44 
 
 		 715 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.988265  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.3 
 
 		 879 aa  92.4  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3913  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.44 
 
 		 715 aa  92  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2461  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  24.11 
 
 		 466 aa  92  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4324  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  25.44 
 
 		 715 aa  92  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0104  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.32 
 
 		 724 aa  91.7  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3948  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.44 
 
 		 715 aa  92  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4542  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  25.44 
 
 		 715 aa  92  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.52 
 
 		 676 aa  91.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00920  formate dehydrogenase alpha subunit  26.63 
 
 		 737 aa  90.1  6e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3190  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.83 
 
 		 924 aa  89.7  8e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.523924  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3367  molybdopterin oxidoreductase family protein  26.22 
 
 		 979 aa  89.4  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3331  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.22 
 
 		 979 aa  89.4  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.291632  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3631  molybdopterin oxidoreductase family protein  26.22 
 
 		 979 aa  89.4  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.461158  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4110  molybdopterin oxidoreductase  26.32 
 
 		 950 aa  89  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3681  molybdopterin oxidoreductase family protein  25.07 
 
 		 979 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.725199  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3581  molybdopterin oxidoreductase family protein  26.22 
 
 		 979 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2623  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  23.76 
 
 		 423 aa  89.4  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4228  molybdopterin oxidoreductase  26.32 
 
 		 950 aa  89  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413313 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0295  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.66 
 
 		 674 aa  88.6  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0587435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3281  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.22 
 
 		 979 aa  89  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4140  molybdopterin oxidoreductase  26.32 
 
 		 950 aa  89  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0229  molybdopterin oxidoreductase  26.32 
 
 		 950 aa  89  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.363214 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2859  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.14 
 
 		 808 aa  87.8  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.960143 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0543  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.34 
 
 		 674 aa  88.2  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.16552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.31 
 
 		 676 aa  88.2  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3588  molybdopterin oxidoreductase family protein  25.14 
 
 		 1012 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1636  molybdopterin oxidoreductase family protein  24.93 
 
 		 979 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.632493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3598  molybdopterin oxidoreductase family protein  25.14 
 
 		 979 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2424  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.1 
 
 		 718 aa  87.4  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.680227 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1538  formate dehydrogenase, alpha subunit  22.9 
 
 		 676 aa  87.4  5e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1376  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.46 
 
 		 674 aa  87  5e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0754319  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4417  molybdopterin oxidoreductase  27.15 
 
 		 951 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0333  molybdopterin oxidoreductase  25.73 
 
 		 950 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3724  formate dehydrogenase alpha subunit  26.61 
 
 		 950 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3795  formate dehydrogenase alpha subunit  26.61 
 
 		 950 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0641  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.26 
 
 		 979 aa  84  0.000000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0324  formate dehydrogenase alpha subunit  24 
 
 		 713 aa  84  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4809  molybdopterin oxidoreductase  25.83 
 
 		 951 aa  84  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.215861 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  22.95 
 
 		 900 aa  83.6  0.000000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3920  formate dehydrogenase alpha subunit  24.56 
 
 		 950 aa  83.6  0.000000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.922429 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1268  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.8 
 
 		 716 aa  83.2  0.000000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.424555  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3609  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.61 
 
 		 950 aa  83.2  0.000000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1796  formylmethanofuran dehydrogenase  24.14 
 
 		 440 aa  83.2  0.000000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00519016  normal  0.685943 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4133  molybdopterin oxidoreductase  26.16 
 
 		 951 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.987786  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1925  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.28 
 
 		 986 aa  82.4  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0196  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.48 
 
 		 689 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.202612  hitchhiker  0.00634005 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1282  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.41 
 
 		 933 aa  82  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.402771 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4578  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.17 
 
 		 723 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.41 
 
 		 685 aa  81.6  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4642  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.93 
 
 		 886 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0800652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1318  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.57 
 
 		 973 aa  81.3  0.00000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3566  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.93 
 
 		 886 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0757584 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0608  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.47 
 
 		 674 aa  80.9  0.00000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>