More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1994 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1988  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  70.71 
 
 
443 aa  692    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.209103  normal  0.117203 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1994  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 
467 aa  971    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0821862  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0372  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  67.05 
 
 
456 aa  642    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0203  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  63.62 
 
 
454 aa  588  1e-167  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1471  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  60.73 
 
 
461 aa  589  1e-167  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0620  molybdopterin oxidoreductase  53.38 
 
 
437 aa  508  1e-143  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.475538  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2235  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  50.34 
 
 
437 aa  501  1e-140  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.291466  normal  0.0456097 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0877  molybdopterin oxidoreductase  50.88 
 
 
461 aa  496  1e-139  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.138974  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1983  molybdopterin oxidoreductase  51.52 
 
 
439 aa  491  9.999999999999999e-139  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0244  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  51.52 
 
 
438 aa  484  1e-135  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.833805  normal  0.256127 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0067  molybdopterin oxidoreductase  46.8 
 
 
434 aa  414  1e-114  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.589018  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0980  molybdopterin oxidoreductase  44.14 
 
 
434 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0412104  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1715  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  44.16 
 
 
437 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0993  molybdopterin oxidoreductase  44.47 
 
 
434 aa  404  1e-111  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0966  tungsten containing formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  43.91 
 
 
434 aa  405  1e-111  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1462  molybdopterin oxidoreductase  43.28 
 
 
434 aa  385  1e-105  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.701357  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0100  molybdopterin oxidoreductase  42.6 
 
 
434 aa  381  1e-104  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.193455  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1829  molydopterin dinucleotide-binding region  42.19 
 
 
587 aa  375  1e-103  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2108  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  43.16 
 
 
434 aa  375  1e-103  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1187  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  42.5 
 
 
429 aa  374  1e-102  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.639664  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1096  molybdopterin oxidoreductase  43.32 
 
 
430 aa  366  1e-100  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1389  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  40.73 
 
 
574 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1664  molybdenum containing formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  37.73 
 
 
442 aa  343  5e-93  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.827559  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0380  molybdenum containing formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  38.9 
 
 
443 aa  343  5e-93  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1532  molybdenum containing formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  38.44 
 
 
443 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00478576 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1449  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  38.39 
 
 
442 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0281  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  35.76 
 
 
435 aa  310  4e-83  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1292  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  35.09 
 
 
433 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.646537 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0085  molybdopterin oxidoreductase  34.74 
 
 
447 aa  301  1e-80  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1763  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  33.41 
 
 
470 aa  294  2e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1560  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  34.17 
 
 
454 aa  280  3e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0264444  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0336  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  32.15 
 
 
414 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0977  tungsten formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  31.31 
 
 
406 aa  207  4e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2922  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  28.31 
 
 
415 aa  178  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113805  hitchhiker  0.00114048 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0025  formylmethanofuran dehydrogenase  24.94 
 
 
425 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.05 
 
 
917 aa  108  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3926  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.86 
 
 
924 aa  100  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1282  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.6 
 
 
933 aa  99  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.402771 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3190  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.86 
 
 
924 aa  99.4  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.523924  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.32 
 
 
898 aa  99  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.49 
 
 
688 aa  97.8  4e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2860  formylmethanofuran dehydrogenase  26.52 
 
 
423 aa  95.9  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.807809  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0104  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.56 
 
 
724 aa  95.1  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3089  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.2 
 
 
959 aa  93.6  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.440267  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4113  formate dehydrogenase, alpha subunit  22.61 
 
 
901 aa  93.2  9e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163208  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1999  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.01 
 
 
657 aa  92.4  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2576  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.68 
 
 
925 aa  91.7  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1457  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.54 
 
 
657 aa  92.4  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3023  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.85 
 
 
982 aa  92  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0162015  normal  0.0152175 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.28 
 
 
900 aa  91.7  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2058  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.56 
 
 
967 aa  90.9  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.896651  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0964  NAD-dependent formate dehydrogenase, alpha subunit  23.65 
 
 
982 aa  91.3  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.133867  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2021  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.84 
 
 
686 aa  90.9  5e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463591  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2023  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.04 
 
 
685 aa  90.9  5e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0303762  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.14 
 
 
676 aa  90.5  6e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2424  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.04 
 
 
718 aa  90.1  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.680227 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1391  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.83 
 
 
947 aa  90.1  8e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2366  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.41 
 
 
983 aa  89.7  9e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.739285 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0196  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.69 
 
 
689 aa  89.7  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.202612  hitchhiker  0.00634005 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4914  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.8 
 
 
950 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.263268 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1662  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  23.86 
 
 
434 aa  89.4  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0130611  normal  0.319857 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.26 
 
 
879 aa  89  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4144  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.96 
 
 
983 aa  89  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110494  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0552  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.96 
 
 
983 aa  89  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.918724  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1538  formate dehydrogenase, alpha subunit  21.9 
 
 
676 aa  88.6  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1031  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.96 
 
 
983 aa  89  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52357  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.63 
 
 
685 aa  89  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0990  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.41 
 
 
983 aa  87.8  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.656443 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0907  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.68 
 
 
983 aa  87.8  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.979482  decreased coverage  0.00925571 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0895  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.68 
 
 
983 aa  87.8  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.99873  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1925  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.15 
 
 
986 aa  87.8  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0324  formate dehydrogenase alpha subunit  25.48 
 
 
713 aa  87.4  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4869  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.52 
 
 
950 aa  87  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0187329 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2805  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.55 
 
 
945 aa  87  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001399  formate dehydrogenase-O major subunit  27.7 
 
 
1387 aa  87  7e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0727  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.41 
 
 
979 aa  86.7  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216931  normal  0.398444 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5043  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.71 
 
 
989 aa  86.7  9e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.331865  normal  0.361747 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2185  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.66 
 
 
960 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.602321  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2750  formate dehydrogenase, alpha subunit  27 
 
 
969 aa  86.3  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0453604 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3266  formate dehydrogenase, alpha subunit  25 
 
 
988 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271284  normal  0.20027 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  22.11 
 
 
676 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1708  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.93 
 
 
959 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3552  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.66 
 
 
960 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4582  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.71 
 
 
989 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.656955 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2964  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.96 
 
 
984 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0619  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.97 
 
 
956 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.961077  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3012  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  25.96 
 
 
984 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.467116  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1318  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.51 
 
 
973 aa  85.5  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1809  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.38 
 
 
960 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.550904  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6171  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.85 
 
 
989 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.796652 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0450  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.96 
 
 
984 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.858013  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2595  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.96 
 
 
984 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.619743  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0967  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.96 
 
 
984 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0180  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.96 
 
 
984 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2902  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.96 
 
 
984 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679741  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0295  formate dehydrogenase, alpha subunit  21.96 
 
 
674 aa  84.7  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0587435  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4651  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.78 
 
 
937 aa  84.3  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0167  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.35 
 
 
886 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0530728  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8358  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.43 
 
 
988 aa  84.3  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5226  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.43 
 
 
988 aa  84.3  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24763  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>