More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1449 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_1664  molybdenum containing formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  84.62 
 
 		 442 aa  815    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.827559  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0380  molybdenum containing formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  97.51 
 
 		 443 aa  905    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1449  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  100 
 
 		 442 aa  918    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1532  molybdenum containing formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  97.06 
 
 		 443 aa  900    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00478576 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1763  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  59 
 
 		 470 aa  589  1e-167  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0281  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  59.91 
 
 		 435 aa  585  1e-166  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1292  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  58.37 
 
 		 433 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.646537 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0085  molybdopterin oxidoreductase  58.28 
 
 		 447 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1560  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  54.99 
 
 		 454 aa  532  1e-150  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0264444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0966  tungsten containing formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  43.68 
 
 		 434 aa  389  1e-107  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1715  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  43.68 
 
 		 437 aa  391  1e-107  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0980  molybdopterin oxidoreductase  43.45 
 
 		 434 aa  388  1e-106  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0412104  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0993  molybdopterin oxidoreductase  44.2 
 
 		 434 aa  384  1e-105  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2235  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  41.69 
 
 		 437 aa  374  1e-102  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.291466  normal  0.0456097 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0067  molybdopterin oxidoreductase  42.17 
 
 		 434 aa  370  1e-101  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.589018  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0620  molybdopterin oxidoreductase  41 
 
 		 437 aa  368  1e-100  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.475538  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1983  molybdopterin oxidoreductase  39.32 
 
 		 439 aa  364  2e-99  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0244  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  41.18 
 
 		 438 aa  362  1e-98  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.833805  normal  0.256127 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1096  molybdopterin oxidoreductase  41.74 
 
 		 430 aa  361  2e-98  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1187  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  41.71 
 
 		 429 aa  358  9.999999999999999e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.639664  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1829  molydopterin dinucleotide-binding region  41.65 
 
 		 587 aa  354  2e-96  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1462  molybdopterin oxidoreductase  40.74 
 
 		 434 aa  352  7e-96  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.701357  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2108  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  40.23 
 
 		 434 aa  348  8e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0372  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  38.9 
 
 		 456 aa  339  5e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1994  molybdopterin oxidoreductase  38.39 
 
 		 467 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0821862  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1471  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  38.9 
 
 		 461 aa  337  2.9999999999999997e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1988  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  37.92 
 
 		 443 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.209103  normal  0.117203 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1389  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  38.39 
 
 		 574 aa  332  5e-90  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0100  molybdopterin oxidoreductase  38.85 
 
 		 434 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.193455  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0203  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  37.84 
 
 		 454 aa  317  2e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0877  molybdopterin oxidoreductase  38.83 
 
 		 461 aa  313  3.9999999999999997e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.138974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2922  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  30.99 
 
 		 415 aa  178  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113805  hitchhiker  0.00114048 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0977  tungsten formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  28.9 
 
 		 406 aa  179  1e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0336  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  31.62 
 
 		 414 aa  176  7e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0025  formylmethanofuran dehydrogenase  23.76 
 
 		 425 aa  114  5e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1662  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  25.31 
 
 		 434 aa  103  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0130611  normal  0.319857 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2023  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.12 
 
 		 685 aa  100  7e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0303762  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1538  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.28 
 
 		 676 aa  97.1  5e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03951  formate dehydrogenase-H, selenopolypeptide subunit  25.47 
 
 		 715 aa  96.7  8e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.803476  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3913  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.47 
 
 		 715 aa  96.7  8e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.28 
 
 		 676 aa  96.7  8e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4542  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  25.47 
 
 		 715 aa  96.7  8e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4324  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  25.47 
 
 		 715 aa  96.7  8e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03911  hypothetical protein  25.47 
 
 		 715 aa  96.7  8e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.988265  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3948  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.47 
 
 		 715 aa  96.7  8e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0608  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.67 
 
 		 674 aa  96.3  9e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.5 
 
 		 676 aa  96.3  9e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0196  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.71 
 
 		 689 aa  94.7  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.202612  hitchhiker  0.00634005 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2021  formate dehydrogenase, alpha subunit  22.62 
 
 		 686 aa  92.8  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463591  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2299  Formylmethanofuran dehydrogenase subunit B-like protein  21.14 
 
 		 427 aa  92.4  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.122072  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.95 
 
 		 688 aa  91.3  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0295  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.28 
 
 		 674 aa  90.9  4e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0587435  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1376  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.78 
 
 		 674 aa  90.1  7e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0754319  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2860  formylmethanofuran dehydrogenase  23.61 
 
 		 423 aa  90.1  8e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.807809  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0543  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.11 
 
 		 674 aa  89.7  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.16552  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4111  molybdopterin oxidoreductase  24.81 
 
 		 647 aa  86.7  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.191585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.87 
 
 		 677 aa  86.3  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1457  formate dehydrogenase, alpha subunit  22.72 
 
 		 657 aa  85.5  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0913  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.49 
 
 		 668 aa  83.2  0.000000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1999  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.07 
 
 		 657 aa  82.4  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3367  molybdopterin oxidoreductase family protein  24.52 
 
 		 979 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3631  molybdopterin oxidoreductase family protein  24.52 
 
 		 979 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.461158  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3660  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.49 
 
 		 888 aa  81.3  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3331  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.19 
 
 		 979 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.291632  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3266  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.21 
 
 		 988 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271284  normal  0.20027 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0997  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.71 
 
 		 953 aa  80.5  0.00000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3681  molybdopterin oxidoreductase family protein  23.76 
 
 		 979 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.725199  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1925  formate dehydrogenase, alpha subunit  22.71 
 
 		 986 aa  79.3  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3581  molybdopterin oxidoreductase family protein  24.3 
 
 		 979 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3281  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.31 
 
 		 979 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.84 
 
 		 879 aa  77.8  0.0000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.35 
 
 		 917 aa  77.8  0.0000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1636  molybdopterin oxidoreductase family protein  23.54 
 
 		 979 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.632493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.45 
 
 		 900 aa  77  0.0000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3588  molybdopterin oxidoreductase family protein  24.09 
 
 		 1012 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5226  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.65 
 
 		 988 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24763  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8358  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.65 
 
 		 988 aa  76.6  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6504  formyltransferase/hydrolase complex subunit B(FhcB)  23.32 
 
 		 469 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0374331 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  22.57 
 
 		 900 aa  76.3  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3598  molybdopterin oxidoreductase family protein  23.66 
 
 		 979 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2424  formate dehydrogenase, alpha subunit  22.54 
 
 		 718 aa  75.9  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.680227 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0895  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.13 
 
 		 983 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.99873  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0716  molybdopterin oxidoreductase family protein  23.38 
 
 		 978 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1391  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.51 
 
 		 947 aa  75.5  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0557  molybdopterin oxidoreductase family protein  23.38 
 
 		 978 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0589  molybdopterin oxidoreductase family protein  23.38 
 
 		 978 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0502  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.38 
 
 		 980 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1813  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.98 
 
 		 688 aa  75.5  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0031  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.86 
 
 		 1000 aa  75.9  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0645  molybdopterin oxidoreductase family protein  23.38 
 
 		 978 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.293395 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4651  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.73 
 
 		 937 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  21.8 
 
 		 893 aa  74.7  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0655  molybdopterin oxidoreductase family protein  23.38 
 
 		 978 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0499  formate dehydrogenase, alpha subunit, anaerobic  23.17 
 
 		 978 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0501  formate dehydrogenase, alpha subunit, anaerobic  23.17 
 
 		 978 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3023  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.62 
 
 		 982 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0162015  normal  0.0152175 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4113  formate dehydrogenase, alpha subunit  22.51 
 
 		 901 aa  73.9  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163208  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0464  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.3 
 
 		 987 aa  73.6  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2746  formate dehydrogenase, alpha subunit  22.86 
 
 		 1004 aa  73.6  0.000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.94455  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4710  molybdopterin oxidoreductase family protein  23.17 
 
 		 978 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>