More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1471 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1471  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  100 
 
 		 461 aa  966    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1988  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  69.34 
 
 		 443 aa  647    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.209103  normal  0.117203 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0203  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  74.38 
 
 		 454 aa  682    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0372  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  70.34 
 
 		 456 aa  655    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1994  molybdopterin oxidoreductase  60.73 
 
 		 467 aa  589  1e-167  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0821862  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0620  molybdopterin oxidoreductase  54.25 
 
 		 437 aa  513  1e-144  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.475538  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2235  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  54.94 
 
 		 437 aa  512  1e-144  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.291466  normal  0.0456097 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0877  molybdopterin oxidoreductase  55.4 
 
 		 461 aa  514  1e-144  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.138974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0244  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  55.01 
 
 		 438 aa  499  1e-140  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.833805  normal  0.256127 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1983  molybdopterin oxidoreductase  51.49 
 
 		 439 aa  477  1e-133  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1715  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  47.59 
 
 		 437 aa  426  1e-118  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0980  molybdopterin oxidoreductase  48.05 
 
 		 434 aa  426  1e-118  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0412104  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0067  molybdopterin oxidoreductase  47.13 
 
 		 434 aa  425  1e-118  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.589018  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0966  tungsten containing formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  47.82 
 
 		 434 aa  425  1e-118  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0993  molybdopterin oxidoreductase  48.24 
 
 		 434 aa  421  1e-116  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1462  molybdopterin oxidoreductase  44.66 
 
 		 434 aa  374  1e-102  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.701357  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0100  molybdopterin oxidoreductase  42.29 
 
 		 434 aa  367  1e-100  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.193455  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1829  molydopterin dinucleotide-binding region  41.72 
 
 		 587 aa  359  5e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2108  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  41.47 
 
 		 434 aa  347  2e-94  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1389  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  39.4 
 
 		 574 aa  344  2e-93  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1664  molybdenum containing formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  39.04 
 
 		 442 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.827559  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1096  molybdopterin oxidoreductase  41.61 
 
 		 430 aa  343  4e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1532  molybdenum containing formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  38.67 
 
 		 443 aa  339  8e-92  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00478576 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0380  molybdenum containing formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  38.67 
 
 		 443 aa  338  9e-92  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1187  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  40.65 
 
 		 429 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.639664  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1449  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  38.9 
 
 		 442 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0085  molybdopterin oxidoreductase  36.67 
 
 		 447 aa  311  1e-83  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0281  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  36.76 
 
 		 435 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1292  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  35.57 
 
 		 433 aa  301  1e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.646537 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1763  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  34.18 
 
 		 470 aa  289  7e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1560  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  33.26 
 
 		 454 aa  287  2e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0264444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0977  tungsten formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  32.32 
 
 		 406 aa  204  4e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0336  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  30.47 
 
 		 414 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2922  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  28.34 
 
 		 415 aa  167  4e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113805  hitchhiker  0.00114048 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0025  formylmethanofuran dehydrogenase  23.91 
 
 		 425 aa  107  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2860  formylmethanofuran dehydrogenase  24.02 
 
 		 423 aa  99.8  8e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.807809  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1662  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  23.89 
 
 		 434 aa  94.7  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0130611  normal  0.319857 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1796  formylmethanofuran dehydrogenase  26.06 
 
 		 440 aa  90.9  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00519016  normal  0.685943 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2021  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.63 
 
 		 686 aa  89  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1538  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.82 
 
 		 676 aa  89  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2023  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.04 
 
 		 685 aa  88.2  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0303762  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.52 
 
 		 676 aa  87.4  4e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2299  Formylmethanofuran dehydrogenase subunit B-like protein  22.38 
 
 		 427 aa  87  6e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.122072  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.52 
 
 		 676 aa  86.3  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0324  formate dehydrogenase alpha subunit  25.36 
 
 		 713 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03951  formate dehydrogenase-H, selenopolypeptide subunit  24.13 
 
 		 715 aa  84.3  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.803476  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3913  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.13 
 
 		 715 aa  84.3  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4324  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  24.13 
 
 		 715 aa  84.3  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3948  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.13 
 
 		 715 aa  84.3  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3190  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.5 
 
 		 924 aa  84.3  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.523924  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03911  hypothetical protein  24.13 
 
 		 715 aa  84.3  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.988265  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4542  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  24.13 
 
 		 715 aa  84.3  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4578  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.56 
 
 		 723 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.16 
 
 		 688 aa  82.8  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2721  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.23 
 
 		 716 aa  82.4  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0016187  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3926  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.86 
 
 		 924 aa  82  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.45 
 
 		 917 aa  81.6  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2424  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.5 
 
 		 718 aa  80.1  0.00000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.680227 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0196  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.9 
 
 		 689 aa  80.1  0.00000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.202612  hitchhiker  0.00634005 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1781  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.93 
 
 		 716 aa  79.3  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1268  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.57 
 
 		 716 aa  79.3  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.424555  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3682  anaerobic formate dehydrogenase, alpha subunit, -type  25.36 
 
 		 715 aa  78.6  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1383  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.57 
 
 		 716 aa  78.6  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.627092  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3829  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.36 
 
 		 715 aa  78.6  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.151921  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0729  formate dehydrogenase H  25.36 
 
 		 715 aa  78.6  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.708724 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00920  formate dehydrogenase alpha subunit  23.55 
 
 		 737 aa  77.8  0.0000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.71 
 
 		 898 aa  76.6  0.0000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1753  formate dehydrogenase alpha subunit  22.29 
 
 		 716 aa  76.3  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0179443  hitchhiker  0.000996092 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0997  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.08 
 
 		 953 aa  76.3  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2859  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.88 
 
 		 808 aa  75.1  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.960143 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1457  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.15 
 
 		 657 aa  75.5  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3681  molybdopterin oxidoreductase family protein  23.45 
 
 		 979 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.725199  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.17 
 
 		 879 aa  74.3  0.000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5935  formylmethanofuran dehydrogenase  23.21 
 
 		 446 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.911434  normal  0.0527378 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6504  formyltransferase/hydrolase complex subunit B(FhcB)  22.07 
 
 		 469 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0374331 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2461  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  21.56 
 
 		 466 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3566  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.6 
 
 		 886 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0757584 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0716  molybdopterin oxidoreductase family protein  23.68 
 
 		 978 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1636  molybdopterin oxidoreductase family protein  22.92 
 
 		 979 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.632493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4642  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.6 
 
 		 886 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0800652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2823  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.01 
 
 		 949 aa  72.4  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.156592  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0655  molybdopterin oxidoreductase family protein  23.73 
 
 		 978 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0464  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.79 
 
 		 987 aa  71.6  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3367  molybdopterin oxidoreductase family protein  22.92 
 
 		 979 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3331  formate dehydrogenase, alpha subunit  22.92 
 
 		 979 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.291632  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3631  molybdopterin oxidoreductase family protein  22.92 
 
 		 979 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.461158  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3581  molybdopterin oxidoreductase family protein  22.92 
 
 		 979 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3588  molybdopterin oxidoreductase family protein  22.92 
 
 		 1012 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1999  formate dehydrogenase, alpha subunit  21.02 
 
 		 657 aa  70.1  0.00000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0505  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.93 
 
 		 980 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0502  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.45 
 
 		 980 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4582  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.01 
 
 		 989 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.656955 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0913  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.01 
 
 		 668 aa  69.3  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0499  formate dehydrogenase, alpha subunit, anaerobic  23.16 
 
 		 978 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3281  formate dehydrogenase, alpha subunit  22.06 
 
 		 979 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0543  formate dehydrogenase, alpha subunit  21.84 
 
 		 674 aa  68.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.16552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0589  molybdopterin oxidoreductase family protein  23.16 
 
 		 978 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3598  molybdopterin oxidoreductase family protein  22.64 
 
 		 979 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0295  formate dehydrogenase, alpha subunit  22.39 
 
 		 674 aa  68.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0587435  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0645  molybdopterin oxidoreductase family protein  23.16 
 
 		 978 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.293395 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>