More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1829 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1829  molydopterin dinucleotide-binding region  100 
 
 		 587 aa  1202    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1389  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  50.88 
 
 		 574 aa  613  9.999999999999999e-175  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1187  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  60.51 
 
 		 429 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.639664  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2108  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  56.47 
 
 		 434 aa  536  1e-151  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1096  molybdopterin oxidoreductase  50.47 
 
 		 430 aa  460  9.999999999999999e-129  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0980  molybdopterin oxidoreductase  43.69 
 
 		 434 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0412104  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0620  molybdopterin oxidoreductase  45.01 
 
 		 437 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.475538  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2235  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  44.94 
 
 		 437 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.291466  normal  0.0456097 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0966  tungsten containing formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  43.93 
 
 		 434 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1715  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  43.49 
 
 		 437 aa  418  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0993  molybdopterin oxidoreductase  44.76 
 
 		 434 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1983  molybdopterin oxidoreductase  44.68 
 
 		 439 aa  410  1e-113  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0100  molybdopterin oxidoreductase  45.41 
 
 		 434 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.193455  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0244  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  43.43 
 
 		 438 aa  402  1e-111  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.833805  normal  0.256127 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0067  molybdopterin oxidoreductase  44.29 
 
 		 434 aa  405  1e-111  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.589018  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0877  molybdopterin oxidoreductase  44.29 
 
 		 461 aa  397  1e-109  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.138974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1462  molybdopterin oxidoreductase  44.52 
 
 		 434 aa  392  1e-108  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.701357  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0372  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  43.36 
 
 		 456 aa  386  1e-106  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1988  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  40.91 
 
 		 443 aa  382  1e-104  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.209103  normal  0.117203 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1994  molybdopterin oxidoreductase  42.19 
 
 		 467 aa  375  1e-102  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0821862  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1664  molybdenum containing formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  43.84 
 
 		 442 aa  372  1e-101  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.827559  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0085  molybdopterin oxidoreductase  41.86 
 
 		 447 aa  363  6e-99  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0203  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  42.76 
 
 		 454 aa  360  3e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1471  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  41.72 
 
 		 461 aa  359  6e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1532  molybdenum containing formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  41.65 
 
 		 443 aa  356  7.999999999999999e-97  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00478576 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1449  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  41.65 
 
 		 442 aa  354  2.9999999999999997e-96  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0380  molybdenum containing formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  40.73 
 
 		 443 aa  352  8e-96  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1763  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  39.69 
 
 		 470 aa  350  4e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1292  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  40.51 
 
 		 433 aa  348  1e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.646537 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0281  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  42.66 
 
 		 435 aa  348  2e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1560  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  37.98 
 
 		 454 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0264444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0977  tungsten formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  37.7 
 
 		 406 aa  267  4e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0336  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  35.82 
 
 		 414 aa  266  1e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2922  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  33.41 
 
 		 415 aa  240  5e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113805  hitchhiker  0.00114048 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1662  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  27.38 
 
 		 434 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0130611  normal  0.319857 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0025  formylmethanofuran dehydrogenase  25.64 
 
 		 425 aa  130  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2860  formylmethanofuran dehydrogenase  25.63 
 
 		 423 aa  110  8.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.807809  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2299  Formylmethanofuran dehydrogenase subunit B-like protein  24.82 
 
 		 427 aa  93.6  9e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.122072  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.61 
 
 		 685 aa  92.4  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0641  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.61 
 
 		 979 aa  89.7  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2023  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.22 
 
 		 685 aa  89.4  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0303762  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.24 
 
 		 917 aa  88.2  4e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1925  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.24 
 
 		 986 aa  87  9e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1318  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.42 
 
 		 973 aa  86.3  0.000000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0104  formate dehydrogenase, alpha subunit  24 
 
 		 724 aa  85.9  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3948  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.39 
 
 		 715 aa  84  0.000000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4542  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  24.39 
 
 		 715 aa  84  0.000000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4324  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  24.39 
 
 		 715 aa  84  0.000000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03951  formate dehydrogenase-H, selenopolypeptide subunit  24.39 
 
 		 715 aa  83.6  0.000000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.803476  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3913  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.39 
 
 		 715 aa  83.6  0.000000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03911  hypothetical protein  24.39 
 
 		 715 aa  83.6  0.000000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.988265  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0913  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.49 
 
 		 668 aa  83.6  0.000000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  21.98 
 
 		 900 aa  83.6  0.000000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1457  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.26 
 
 		 657 aa  83.2  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1186  molydopterin dinucleotide-binding region  37.3 
 
 		 129 aa  83.6  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0619924  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.29 
 
 		 688 aa  81.6  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2021  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.04 
 
 		 686 aa  81.3  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3660  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.85 
 
 		 888 aa  80.9  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1341  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.55 
 
 		 987 aa  80.5  0.00000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1999  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.52 
 
 		 657 aa  80.5  0.00000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.26 
 
 		 676 aa  80.5  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.43 
 
 		 676 aa  80.5  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1538  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.49 
 
 		 676 aa  80.1  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3681  molybdopterin oxidoreductase family protein  22.81 
 
 		 979 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.725199  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3367  molybdopterin oxidoreductase family protein  23.57 
 
 		 979 aa  77.8  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3631  molybdopterin oxidoreductase family protein  23.57 
 
 		 979 aa  77.8  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.461158  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0627  molybdopterin oxidoreductase family protein  23.47 
 
 		 978 aa  77.8  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4710  molybdopterin oxidoreductase family protein  23.47 
 
 		 978 aa  77.8  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.45 
 
 		 898 aa  77.8  0.0000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2623  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  24.14 
 
 		 423 aa  77.4  0.0000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3331  formate dehydrogenase, alpha subunit  22.98 
 
 		 979 aa  77  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.291632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3281  formate dehydrogenase, alpha subunit  22.98 
 
 		 979 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3598  molybdopterin oxidoreductase family protein  24.86 
 
 		 979 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3588  molybdopterin oxidoreductase family protein  24.59 
 
 		 1012 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2107  molydopterin dinucleotide-binding region  37.37 
 
 		 129 aa  75.9  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3581  molybdopterin oxidoreductase family protein  23.35 
 
 		 979 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2746  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.71 
 
 		 1004 aa  75.9  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.94455  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1636  molybdopterin oxidoreductase family protein  23.26 
 
 		 979 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.632493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0792  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.52 
 
 		 1406 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1282  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.73 
 
 		 933 aa  75.5  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.402771 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2576  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.97 
 
 		 925 aa  75.1  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0464  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.63 
 
 		 987 aa  75.1  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0557  molybdopterin oxidoreductase family protein  23.79 
 
 		 978 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0589  molybdopterin oxidoreductase family protein  23.79 
 
 		 978 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0196  formate dehydrogenase, alpha subunit  21.93 
 
 		 689 aa  75.5  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.202612  hitchhiker  0.00634005 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0843  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.52 
 
 		 994 aa  75.5  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0997  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.33 
 
 		 953 aa  75.5  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0645  molybdopterin oxidoreductase family protein  23.79 
 
 		 978 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.293395 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0499  formate dehydrogenase, alpha subunit, anaerobic  23.93 
 
 		 978 aa  75.1  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3190  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.91 
 
 		 924 aa  75.1  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.523924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3520  formate dehydrogenase, alpha subunit  22.5 
 
 		 904 aa  74.7  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0501  formate dehydrogenase, alpha subunit, anaerobic  23.55 
 
 		 978 aa  74.7  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4651  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.3 
 
 		 937 aa  74.7  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0718  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  28.48 
 
 		 774 aa  74.3  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0704929  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2424  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.19 
 
 		 718 aa  74.3  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.680227 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0716  molybdopterin oxidoreductase family protein  23.55 
 
 		 978 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0712  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  28.48 
 
 		 774 aa  74.7  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.165741 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0732  oxidoreductase alpha (molybdopterin) subunit  28.48 
 
 		 774 aa  74.3  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0455972 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0655  molybdopterin oxidoreductase family protein  23.39 
 
 		 978 aa  73.9  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1238  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.98 
 
 		 721 aa  73.9  0.000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.768724  normal  0.0266527 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>