More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1292 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1292  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  100 
 
 		 433 aa  904    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.646537 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1560  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  78.14 
 
 		 454 aa  723    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0264444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1763  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  89.61 
 
 		 470 aa  841    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0281  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  77.08 
 
 		 435 aa  721    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1664  molybdenum containing formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  59.3 
 
 		 442 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.827559  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1449  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  58.37 
 
 		 442 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0380  molybdenum containing formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  58.14 
 
 		 443 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1532  molybdenum containing formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  58.6 
 
 		 443 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00478576 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0085  molybdopterin oxidoreductase  58.06 
 
 		 447 aa  551  1e-156  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0966  tungsten containing formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  40.46 
 
 		 434 aa  371  1e-101  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1715  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  40.46 
 
 		 437 aa  371  1e-101  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0980  molybdopterin oxidoreductase  40.46 
 
 		 434 aa  370  1e-101  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0412104  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0067  molybdopterin oxidoreductase  40.28 
 
 		 434 aa  362  6e-99  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.589018  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1096  molybdopterin oxidoreductase  41.16 
 
 		 430 aa  362  8e-99  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0993  molybdopterin oxidoreductase  38.84 
 
 		 434 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1829  molydopterin dinucleotide-binding region  40.51 
 
 		 587 aa  348  1e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1462  molybdopterin oxidoreductase  40.6 
 
 		 434 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.701357  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1187  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  40.98 
 
 		 429 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.639664  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2108  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  38.48 
 
 		 434 aa  334  2e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1983  molybdopterin oxidoreductase  37.79 
 
 		 439 aa  333  3e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2235  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  38.94 
 
 		 437 aa  333  3e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.291466  normal  0.0456097 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0100  molybdopterin oxidoreductase  40.28 
 
 		 434 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.193455  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0620  molybdopterin oxidoreductase  36.74 
 
 		 437 aa  323  5e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.475538  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0244  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  38.39 
 
 		 438 aa  320  3e-86  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.833805  normal  0.256127 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1389  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  36.18 
 
 		 574 aa  310  4e-83  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1994  molybdopterin oxidoreductase  35.09 
 
 		 467 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0821862  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0372  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  37.1 
 
 		 456 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1988  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  34.78 
 
 		 443 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.209103  normal  0.117203 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1471  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  35.57 
 
 		 461 aa  301  1e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0203  formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  35.19 
 
 		 454 aa  296  3e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0877  molybdopterin oxidoreductase  35.92 
 
 		 461 aa  290  3e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.138974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0977  tungsten formylmethanofuran dehydrogenase subunit B  32.86 
 
 		 406 aa  207  2e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0336  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  33.9 
 
 		 414 aa  204  2e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2922  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  31.38 
 
 		 415 aa  197  3e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113805  hitchhiker  0.00114048 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0025  formylmethanofuran dehydrogenase  23.17 
 
 		 425 aa  103  6e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.58 
 
 		 676 aa  102  9e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1538  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.99 
 
 		 676 aa  99.8  9e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2021  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.3 
 
 		 686 aa  99  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.54 
 
 		 676 aa  97.8  3e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1339  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.59 
 
 		 662 aa  97.4  4e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  25 
 
 		 893 aa  97.1  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0641  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.11 
 
 		 979 aa  95.1  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0463  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  25.32 
 
 		 689 aa  95.5  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03951  formate dehydrogenase-H, selenopolypeptide subunit  23.39 
 
 		 715 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.803476  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3913  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.39 
 
 		 715 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4324  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  23.39 
 
 		 715 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3948  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.39 
 
 		 715 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0543  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.26 
 
 		 674 aa  94.7  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.16552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4542  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  23.39 
 
 		 715 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03911  hypothetical protein  23.39 
 
 		 715 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.988265  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0295  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.05 
 
 		 674 aa  92  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0587435  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2860  formylmethanofuran dehydrogenase  23.3 
 
 		 423 aa  91.3  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.807809  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2023  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.01 
 
 		 685 aa  91.7  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0303762  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1376  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.05 
 
 		 674 aa  91.3  3e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0754319  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.78 
 
 		 688 aa  90.9  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0608  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.62 
 
 		 674 aa  90.5  5e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1662  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  24.3 
 
 		 434 aa  89.7  9e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0130611  normal  0.319857 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3772  molybdopterin oxidoreductase  25.96 
 
 		 708 aa  88.2  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.914443 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.45 
 
 		 879 aa  85.5  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0196  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.62 
 
 		 689 aa  85.5  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.202612  hitchhiker  0.00634005 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.5 
 
 		 900 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.16 
 
 		 893 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1925  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.43 
 
 		 986 aa  84.3  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0685  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.89 
 
 		 718 aa  84.7  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2746  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.93 
 
 		 1004 aa  84  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.94455  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.12 
 
 		 677 aa  84  0.000000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2352  molybdopterin oxidoreductase  24.59 
 
 		 1111 aa  83.2  0.000000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1318  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.12 
 
 		 973 aa  83.2  0.000000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3331  formate dehydrogenase, alpha subunit  22.74 
 
 		 979 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.291632  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1238  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.37 
 
 		 721 aa  82.8  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.768724  normal  0.0266527 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3367  molybdopterin oxidoreductase family protein  22.69 
 
 		 979 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3631  molybdopterin oxidoreductase family protein  22.69 
 
 		 979 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.461158  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0464  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.19 
 
 		 987 aa  82  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.65 
 
 		 917 aa  81.3  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3581  molybdopterin oxidoreductase family protein  22.69 
 
 		 979 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0913  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.51 
 
 		 668 aa  81.3  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4710  molybdopterin oxidoreductase family protein  24.15 
 
 		 978 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3281  formate dehydrogenase, alpha subunit  22.69 
 
 		 979 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3681  molybdopterin oxidoreductase family protein  22.69 
 
 		 979 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.725199  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0627  molybdopterin oxidoreductase family protein  23.79 
 
 		 978 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0937  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.16 
 
 		 1426 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.137872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2152  molybdopterin oxidoreductase  23.54 
 
 		 880 aa  80.5  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0716  molybdopterin oxidoreductase family protein  23.79 
 
 		 978 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0167  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.84 
 
 		 886 aa  79.7  0.00000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0530728  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2424  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.36 
 
 		 718 aa  79.7  0.00000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.680227 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0655  molybdopterin oxidoreductase family protein  23.79 
 
 		 978 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3588  molybdopterin oxidoreductase family protein  22.47 
 
 		 1012 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0499  formate dehydrogenase, alpha subunit, anaerobic  23.57 
 
 		 978 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0501  formate dehydrogenase, alpha subunit, anaerobic  23.57 
 
 		 978 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1457  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.27 
 
 		 657 aa  79.7  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0502  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.18 
 
 		 980 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1636  molybdopterin oxidoreductase family protein  23.81 
 
 		 979 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.632493  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4111  molybdopterin oxidoreductase  24.82 
 
 		 647 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.191585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3190  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.7 
 
 		 924 aa  79  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.523924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0505  formate dehydrogenase, alpha subunit  22.96 
 
 		 980 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0645  molybdopterin oxidoreductase family protein  23.35 
 
 		 978 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.293395 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0557  molybdopterin oxidoreductase family protein  23.35 
 
 		 978 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0589  molybdopterin oxidoreductase family protein  23.35 
 
 		 978 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6504  formyltransferase/hydrolase complex subunit B(FhcB)  23.61 
 
 		 469 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0374331 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3660  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.99 
 
 		 888 aa  78.2  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>