More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2352 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2352  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 		 1111 aa  2286    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1120  putative formate dehydrogenase, alpha subunit  36.14 
 
 		 951 aa  648    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1286  formate dehydrogenase alpha subunit  36.48 
 
 		 962 aa  619  1e-175  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5278  molybdopterin oxidoreductase  36.67 
 
 		 979 aa  608  9.999999999999999e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.940063  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1453  formate dehydrogenase  34.89 
 
 		 951 aa  597  1e-169  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2449  twin-arginine translocation pathway signal  35.41 
 
 		 973 aa  584  1.0000000000000001e-165  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3203  molybdopterin oxidoreductase  34.92 
 
 		 980 aa  575  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.542235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5491  molybdopterin oxidoreductase  35.75 
 
 		 973 aa  568  1e-160  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3261  twin-arginine translocation pathway signal  33.92 
 
 		 986 aa  560  1e-158  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.303919  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3087  molybdopterin oxidoreductase  37.31 
 
 		 987 aa  464  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0589388 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0504  formate dehydrogenase alpha chain  38.28 
 
 		 986 aa  466  1e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0457  molybdopterin oxidoreductase  37.26 
 
 		 980 aa  455  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.134785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0389  molybdopterin oxidoreductase  36.58 
 
 		 980 aa  452  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0421  molybdopterin oxidoreductase  36.44 
 
 		 980 aa  451  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.273483  normal  0.81793 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4137  molybdopterin oxidoreductase  44.71 
 
 		 949 aa  388  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0057  twin-arginine translocation pathway signal  44.1 
 
 		 949 aa  384  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003494  formate dehydrogenase-O major subunit  45.26 
 
 		 951 aa  381  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4106  molybdopterin oxidoreductase  44.66 
 
 		 950 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3720  formate dehydrogenase alpha subunit  43.97 
 
 		 950 aa  381  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.933728 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3791  formate dehydrogenase alpha subunit  43.97 
 
 		 950 aa  381  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3916  formate dehydrogenase alpha subunit  43.74 
 
 		 950 aa  380  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.733885 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3613  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.69 
 
 		 949 aa  380  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.982249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4224  molybdopterin oxidoreductase  44.66 
 
 		 950 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105156 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0337  molybdopterin oxidoreductase  43.51 
 
 		 949 aa  379  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0233  molybdopterin oxidoreductase  44.42 
 
 		 950 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00484847 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4136  molybdopterin oxidoreductase  44.42 
 
 		 950 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.448434  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1915  formate dehydrogenase alpha subunit  45.5 
 
 		 953 aa  378  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1541  formate dehydrogenase  29.63 
 
 		 790 aa  380  1e-103  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4421  molybdopterin oxidoreductase  43.41 
 
 		 949 aa  374  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0059  molybdopterin oxidoreductase  43.65 
 
 		 949 aa  374  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.65892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4813  molybdopterin oxidoreductase  43.17 
 
 		 949 aa  371  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.517826 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4509  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.09 
 
 		 949 aa  371  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02278  hypothetical protein  44.79 
 
 		 951 aa  373  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0401  formate dehydrogenase alpha subunit  45.34 
 
 		 964 aa  367  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.298134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0063  molybdopterin oxidoreductase  42.99 
 
 		 951 aa  367  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4133  molybdopterin oxidoreductase  43.1 
 
 		 951 aa  368  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.987786  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3609  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.3 
 
 		 950 aa  369  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4513  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.03 
 
 		 950 aa  366  1e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4809  molybdopterin oxidoreductase  42.37 
 
 		 951 aa  366  1e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.215861 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3920  formate dehydrogenase alpha subunit  43.81 
 
 		 950 aa  365  2e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.922429 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4417  molybdopterin oxidoreductase  42.93 
 
 		 951 aa  364  6e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4140  molybdopterin oxidoreductase  43.44 
 
 		 950 aa  363  8e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3724  formate dehydrogenase alpha subunit  43.57 
 
 		 950 aa  363  9e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3795  formate dehydrogenase alpha subunit  43.57 
 
 		 950 aa  363  9e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0333  molybdopterin oxidoreductase  42.82 
 
 		 950 aa  363  1e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4110  molybdopterin oxidoreductase  43.3 
 
 		 950 aa  362  2e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4228  molybdopterin oxidoreductase  43.3 
 
 		 950 aa  362  2e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413313 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0229  molybdopterin oxidoreductase  43.3 
 
 		 950 aa  362  3e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.363214 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4129  molybdopterin oxidoreductase  43.24 
 
 		 957 aa  357  5.999999999999999e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0534  molydopterin dinucleotide binding domain-containing protein  28.38 
 
 		 796 aa  351  5e-95  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000658423  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3126  twin-arginine translocation pathway signal  43.41 
 
 		 983 aa  349  2e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.389263  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0682  twin-arginine translocation pathway signal  40.53 
 
 		 1012 aa  343  2e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3709  molybdopterin oxidoreductase  40.61 
 
 		 970 aa  341  4e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2373  formate dehydrogenase large subunit  41.02 
 
 		 999 aa  338  1.9999999999999998e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00446398 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2791  molybdopterin oxidoreductase  40.59 
 
 		 989 aa  339  1.9999999999999998e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0527141  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2182  molybdopterin oxidoreductase  40.73 
 
 		 1001 aa  338  3.9999999999999995e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.461283  normal  0.03262 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2586  molybdopterin oxidoreductase  40.73 
 
 		 1001 aa  338  5e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.537244  normal  0.227265 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2761  twin-arginine translocation pathway signal  40.53 
 
 		 1025 aa  336  1e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.297303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4062  molybdopterin oxidoreductase  40.15 
 
 		 996 aa  335  3e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.818132  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1398  molybdopterin oxidoreductase  38.59 
 
 		 992 aa  335  3e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3464  molybdopterin oxidoreductase  39.66 
 
 		 989 aa  335  4e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0820  formate dehydrogenase alpha subunit  43.72 
 
 		 932 aa  330  1.0000000000000001e-88  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.380979  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3728  molybdopterin oxidoreductase  39.47 
 
 		 994 aa  328  2.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262187 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0834  molybdopterin oxidoreductase  39.36 
 
 		 991 aa  328  3e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1684  formate dehydrogenase, alpha subunit, selenocysteine-containing  40.33 
 
 		 934 aa  328  5e-88  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0937  twin-arginine translocation pathway signal  39.07 
 
 		 991 aa  323  9.000000000000001e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0358  formate dehydrogenase, alpha subunit (selenocysteine-containing)  41.32 
 
 		 940 aa  323  9.000000000000001e-87  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.721212  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1170  formate dehydrogenase large subunit precursor  39.46 
 
 		 988 aa  321  5e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.970148 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0761  hypothetical protein  26.36 
 
 		 797 aa  317  7e-85  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.669213  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0208  fumarate hydratase  31.29 
 
 		 739 aa  265  3e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.22 
 
 		 685 aa  257  8e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1339  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.66 
 
 		 662 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0806  molybdopterin dinucleotide-binding region  30.89 
 
 		 749 aa  253  1e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1503  formate dehydrogenase, alpha subunit, selenocysteine-containing  32.69 
 
 		 746 aa  251  4e-65  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0954  molybdopterin oxidoreductase  28.97 
 
 		 1168 aa  249  2e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.859689  normal  0.0860777 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.53 
 
 		 900 aa  248  4.9999999999999997e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.7 
 
 		 893 aa  247  6.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.32 
 
 		 688 aa  246  9.999999999999999e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1561  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  37.64 
 
 		 695 aa  246  1.9999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0543  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.42 
 
 		 674 aa  246  1.9999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.16552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.82 
 
 		 893 aa  245  3.9999999999999997e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0295  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.89 
 
 		 674 aa  244  6e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0587435  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1376  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.16 
 
 		 674 aa  244  7e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0754319  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1538  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.44 
 
 		 676 aa  243  1e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.61 
 
 		 677 aa  243  2e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0396  formate dehydrogenase alpha subunit  28.73 
 
 		 1175 aa  241  6.999999999999999e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0603241 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.53 
 
 		 676 aa  240  1e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  34.99 
 
 		 899 aa  239  2e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.25 
 
 		 676 aa  238  4e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.69 
 
 		 893 aa  238  4e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0608  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.72 
 
 		 674 aa  237  1.0000000000000001e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0196  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.42 
 
 		 689 aa  236  2.0000000000000002e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.202612  hitchhiker  0.00634005 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3238  molydopterin dinucleotide-binding region  33.89 
 
 		 687 aa  236  2.0000000000000002e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0973988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63605  formate dehydrogenase-O, major subunit  27.96 
 
 		 1026 aa  234  7.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0915  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.88 
 
 		 920 aa  234  7.000000000000001e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1813  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.17 
 
 		 688 aa  234  8.000000000000001e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1056  formate dehydrogenase  28.53 
 
 		 1168 aa  234  9e-60  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.13 
 
 		 879 aa  232  3e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2074  molybdopterin oxidoreductase  29.78 
 
 		 749 aa  231  5e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1624  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.56 
 
 		 687 aa  231  8e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>