More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2074 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0229  molybdopterin oxidoreductase  44.33 
 
 		 950 aa  641    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.363214 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4137  molybdopterin oxidoreductase  45.25 
 
 		 949 aa  664    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4106  molybdopterin oxidoreductase  45.07 
 
 		 950 aa  655    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4140  molybdopterin oxidoreductase  44.06 
 
 		 950 aa  639    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0761  hypothetical protein  68 
 
 		 797 aa  1097    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.669213  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1684  formate dehydrogenase, alpha subunit, selenocysteine-containing  55.38 
 
 		 934 aa  872    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4509  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.85 
 
 		 949 aa  660    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0063  molybdopterin oxidoreductase  43.33 
 
 		 951 aa  637    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4129  molybdopterin oxidoreductase  43.91 
 
 		 957 aa  643    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02278  hypothetical protein  42.8 
 
 		 951 aa  655    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003494  formate dehydrogenase-O major subunit  43.93 
 
 		 951 aa  665    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4224  molybdopterin oxidoreductase  44.94 
 
 		 950 aa  654    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105156 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0820  formate dehydrogenase alpha subunit  48.61 
 
 		 932 aa  773    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.380979  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4110  molybdopterin oxidoreductase  44.06 
 
 		 950 aa  640    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4228  molybdopterin oxidoreductase  44.06 
 
 		 950 aa  639    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413313 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1120  putative formate dehydrogenase, alpha subunit  42.58 
 
 		 951 aa  652    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2074  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 		 749 aa  1564    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1503  formate dehydrogenase, alpha subunit, selenocysteine-containing  55.38 
 
 		 746 aa  868    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1915  formate dehydrogenase alpha subunit  44.72 
 
 		 953 aa  680    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4809  molybdopterin oxidoreductase  43.2 
 
 		 951 aa  640    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.215861 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0337  molybdopterin oxidoreductase  45.66 
 
 		 949 aa  658    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0401  formate dehydrogenase alpha subunit  43.64 
 
 		 964 aa  640    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.298134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4813  molybdopterin oxidoreductase  44.93 
 
 		 949 aa  657    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.517826 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3720  formate dehydrogenase alpha subunit  45.79 
 
 		 950 aa  664    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.933728 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3791  formate dehydrogenase alpha subunit  45.92 
 
 		 950 aa  664    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1286  formate dehydrogenase alpha subunit  43.86 
 
 		 962 aa  643    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0057  twin-arginine translocation pathway signal  43.95 
 
 		 949 aa  649    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0806  molybdopterin dinucleotide-binding region  57.73 
 
 		 749 aa  937    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0358  formate dehydrogenase, alpha subunit (selenocysteine-containing)  67.55 
 
 		 940 aa  1094    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.721212  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0333  molybdopterin oxidoreductase  44.65 
 
 		 950 aa  640    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0208  fumarate hydratase  56.14 
 
 		 739 aa  907    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0233  molybdopterin oxidoreductase  45.07 
 
 		 950 aa  655    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00484847 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0534  molydopterin dinucleotide binding domain-containing protein  67.23 
 
 		 796 aa  1108    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000658423  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3916  formate dehydrogenase alpha subunit  46.05 
 
 		 950 aa  665    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.733885 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1541  formate dehydrogenase  68.69 
 
 		 790 aa  1120    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0059  molybdopterin oxidoreductase  44.97 
 
 		 949 aa  662    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.65892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3609  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.06 
 
 		 950 aa  642    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3613  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.27 
 
 		 949 aa  640    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.982249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4136  molybdopterin oxidoreductase  45.07 
 
 		 950 aa  655    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.448434  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1453  formate dehydrogenase  42.63 
 
 		 951 aa  655    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4421  molybdopterin oxidoreductase  45.19 
 
 		 949 aa  671    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4417  molybdopterin oxidoreductase  43.06 
 
 		 951 aa  635  1e-180  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3724  formate dehydrogenase alpha subunit  43.86 
 
 		 950 aa  632  1e-180  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3795  formate dehydrogenase alpha subunit  43.86 
 
 		 950 aa  632  1e-180  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4133  molybdopterin oxidoreductase  42.48 
 
 		 951 aa  632  1e-180  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.987786  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3709  molybdopterin oxidoreductase  43.02 
 
 		 970 aa  626  1e-178  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3920  formate dehydrogenase alpha subunit  43.46 
 
 		 950 aa  628  1e-178  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.922429 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4513  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.33 
 
 		 950 aa  622  1e-177  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2791  molybdopterin oxidoreductase  42.23 
 
 		 989 aa  621  1e-176  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0527141  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0937  twin-arginine translocation pathway signal  41.85 
 
 		 991 aa  617  1e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1170  formate dehydrogenase large subunit precursor  40.98 
 
 		 988 aa  615  9.999999999999999e-175  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.970148 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0834  molybdopterin oxidoreductase  41.59 
 
 		 991 aa  612  9.999999999999999e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4062  molybdopterin oxidoreductase  41.23 
 
 		 996 aa  610  1e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.818132  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3464  molybdopterin oxidoreductase  41.46 
 
 		 989 aa  608  9.999999999999999e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2586  molybdopterin oxidoreductase  40.98 
 
 		 1001 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.537244  normal  0.227265 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2373  formate dehydrogenase large subunit  40.46 
 
 		 999 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00446398 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2182  molybdopterin oxidoreductase  40.85 
 
 		 1001 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.461283  normal  0.03262 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3261  twin-arginine translocation pathway signal  40.69 
 
 		 986 aa  597  1e-169  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.303919  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0682  twin-arginine translocation pathway signal  40.44 
 
 		 1012 aa  593  1e-168  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1398  molybdopterin oxidoreductase  39.95 
 
 		 992 aa  593  1e-168  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3087  molybdopterin oxidoreductase  41.55 
 
 		 987 aa  593  1e-168  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0589388 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3728  molybdopterin oxidoreductase  40.59 
 
 		 994 aa  592  1e-167  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262187 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5278  molybdopterin oxidoreductase  41.94 
 
 		 979 aa  592  1e-167  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.940063  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3203  molybdopterin oxidoreductase  41.42 
 
 		 980 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.542235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2761  twin-arginine translocation pathway signal  39.51 
 
 		 1025 aa  580  1e-164  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.297303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3126  twin-arginine translocation pathway signal  40.87 
 
 		 983 aa  575  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.389263  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2449  twin-arginine translocation pathway signal  40.59 
 
 		 973 aa  575  1.0000000000000001e-162  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0389  molybdopterin oxidoreductase  41.88 
 
 		 980 aa  569  1e-161  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0457  molybdopterin oxidoreductase  42.01 
 
 		 980 aa  569  1e-161  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.134785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0421  molybdopterin oxidoreductase  41.75 
 
 		 980 aa  568  1e-160  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.273483  normal  0.81793 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5491  molybdopterin oxidoreductase  40.36 
 
 		 973 aa  565  1.0000000000000001e-159  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0504  formate dehydrogenase alpha chain  39.74 
 
 		 986 aa  552  1e-155  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2352  molybdopterin oxidoreductase  29.6 
 
 		 1111 aa  226  8e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.91 
 
 		 879 aa  212  2e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1813  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.83 
 
 		 688 aa  212  2e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3238  molydopterin dinucleotide-binding region  31.4 
 
 		 687 aa  212  2e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0973988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  30.36 
 
 		 745 aa  211  3e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.45 
 
 		 893 aa  206  9e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.12 
 
 		 893 aa  205  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1376  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.63 
 
 		 674 aa  202  3e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0754319  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0913  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.15 
 
 		 668 aa  201  3e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.68 
 
 		 900 aa  201  5e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0543  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.63 
 
 		 674 aa  200  9e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.16552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1561  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  30.45 
 
 		 695 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0295  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.43 
 
 		 674 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0587435  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1381  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.77 
 
 		 688 aa  196  1e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1795  molybdopterin oxidoreductase  28.26 
 
 		 526 aa  195  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1830  putative formate dehydrogenase alpha subunit  31.32 
 
 		 536 aa  194  5e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0786  formate dehydrogenase alpha subunit  29.87 
 
 		 529 aa  194  7e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.63 
 
 		 688 aa  193  9e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1855  molybdopterin oxidoreductase  29.28 
 
 		 527 aa  191  4e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.48 
 
 		 898 aa  191  5e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0608  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.13 
 
 		 674 aa  190  7e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.3 
 
 		 685 aa  189  2e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1379  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.72 
 
 		 688 aa  188  3e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  30.15 
 
 		 899 aa  187  6e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.34 
 
 		 677 aa  187  6e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.28 
 
 		 917 aa  187  7e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1339  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.07 
 
 		 662 aa  187  7e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2021  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.3 
 
 		 686 aa  187  8e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463591  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>