More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1398 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1453  formate dehydrogenase  58.49 
 
 		 951 aa  1159    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3728  molybdopterin oxidoreductase  74.93 
 
 		 994 aa  1566    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262187 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003494  formate dehydrogenase-O major subunit  59.67 
 
 		 951 aa  1193    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4228  molybdopterin oxidoreductase  55.91 
 
 		 950 aa  1086    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413313 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0358  formate dehydrogenase, alpha subunit (selenocysteine-containing)  40.64 
 
 		 940 aa  748    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.721212  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0806  molybdopterin dinucleotide-binding region  46.59 
 
 		 749 aa  660    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4813  molybdopterin oxidoreductase  57.74 
 
 		 949 aa  1140    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.517826 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4110  molybdopterin oxidoreductase  55.91 
 
 		 950 aa  1086    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2373  formate dehydrogenase large subunit  78.58 
 
 		 999 aa  1666    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00446398 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2182  molybdopterin oxidoreductase  79.27 
 
 		 1001 aa  1673    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.461283  normal  0.03262 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4421  molybdopterin oxidoreductase  55.91 
 
 		 949 aa  1141    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1684  formate dehydrogenase, alpha subunit, selenocysteine-containing  43.56 
 
 		 934 aa  781    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0208  fumarate hydratase  46.04 
 
 		 739 aa  664    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2586  molybdopterin oxidoreductase  79.17 
 
 		 1001 aa  1670    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.537244  normal  0.227265 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4509  formate dehydrogenase, alpha subunit  57.1 
 
 		 949 aa  1132    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4513  formate dehydrogenase, alpha subunit  53.66 
 
 		 950 aa  1071    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0233  molybdopterin oxidoreductase  56 
 
 		 950 aa  1130    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00484847 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1120  putative formate dehydrogenase, alpha subunit  59.67 
 
 		 951 aa  1186    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4224  molybdopterin oxidoreductase  55.9 
 
 		 950 aa  1129    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105156 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4062  molybdopterin oxidoreductase  73.5 
 
 		 996 aa  1556    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.818132  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1398  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 		 992 aa  2081    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0682  twin-arginine translocation pathway signal  79.57 
 
 		 1012 aa  1664    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0059  molybdopterin oxidoreductase  56.63 
 
 		 949 aa  1157    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.65892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4809  molybdopterin oxidoreductase  54.65 
 
 		 951 aa  1084    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.215861 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5491  molybdopterin oxidoreductase  53.16 
 
 		 973 aa  1039    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0337  molybdopterin oxidoreductase  56.83 
 
 		 949 aa  1128    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0457  molybdopterin oxidoreductase  53.93 
 
 		 980 aa  1002    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.134785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0820  formate dehydrogenase alpha subunit  45.41 
 
 		 932 aa  812    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.380979  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4417  molybdopterin oxidoreductase  54.21 
 
 		 951 aa  1087    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4106  molybdopterin oxidoreductase  56 
 
 		 950 aa  1131    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4140  molybdopterin oxidoreductase  55.91 
 
 		 950 aa  1085    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5278  molybdopterin oxidoreductase  53.06 
 
 		 979 aa  1029    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.940063  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3261  twin-arginine translocation pathway signal  75.3 
 
 		 986 aa  1580    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.303919  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3709  molybdopterin oxidoreductase  69.08 
 
 		 970 aa  1441    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02278  hypothetical protein  59.26 
 
 		 951 aa  1191    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0937  twin-arginine translocation pathway signal  73.69 
 
 		 991 aa  1563    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0333  molybdopterin oxidoreductase  54.81 
 
 		 950 aa  1088    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1915  formate dehydrogenase alpha subunit  58.6 
 
 		 953 aa  1197    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3126  twin-arginine translocation pathway signal  51.95 
 
 		 983 aa  1006    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.389263  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2761  twin-arginine translocation pathway signal  79.36 
 
 		 1025 aa  1635    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.297303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3203  molybdopterin oxidoreductase  54.03 
 
 		 980 aa  1023    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.542235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4129  molybdopterin oxidoreductase  48.75 
 
 		 957 aa  980    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0389  molybdopterin oxidoreductase  54.14 
 
 		 980 aa  1005    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0401  formate dehydrogenase alpha subunit  56.34 
 
 		 964 aa  1130    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.298134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2449  twin-arginine translocation pathway signal  53.02 
 
 		 973 aa  1041    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3720  formate dehydrogenase alpha subunit  56.65 
 
 		 950 aa  1146    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.933728 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3724  formate dehydrogenase alpha subunit  54.35 
 
 		 950 aa  1082    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0504  formate dehydrogenase alpha chain  53.16 
 
 		 986 aa  1016    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3791  formate dehydrogenase alpha subunit  56.65 
 
 		 950 aa  1145    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3795  formate dehydrogenase alpha subunit  54.35 
 
 		 950 aa  1083    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1286  formate dehydrogenase alpha subunit  57.16 
 
 		 962 aa  1158    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4133  molybdopterin oxidoreductase  54.51 
 
 		 951 aa  1082    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.987786  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0057  twin-arginine translocation pathway signal  55.4 
 
 		 949 aa  1120    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0421  molybdopterin oxidoreductase  54.03 
 
 		 980 aa  1004    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.273483  normal  0.81793 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0063  molybdopterin oxidoreductase  55.07 
 
 		 951 aa  1098    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2791  molybdopterin oxidoreductase  74.72 
 
 		 989 aa  1580    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0527141  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4137  molybdopterin oxidoreductase  56.12 
 
 		 949 aa  1133    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3087  molybdopterin oxidoreductase  52.74 
 
 		 987 aa  1026    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0589388 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3916  formate dehydrogenase alpha subunit  57.06 
 
 		 950 aa  1151    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.733885 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3920  formate dehydrogenase alpha subunit  54.65 
 
 		 950 aa  1086    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.922429 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3609  formate dehydrogenase, alpha subunit  55.5 
 
 		 950 aa  1087    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3613  formate dehydrogenase, alpha subunit  57.08 
 
 		 949 aa  1139    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.982249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0229  molybdopterin oxidoreductase  56.02 
 
 		 950 aa  1087    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.363214 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0834  molybdopterin oxidoreductase  74.02 
 
 		 991 aa  1568    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3464  molybdopterin oxidoreductase  74.6 
 
 		 989 aa  1571    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4136  molybdopterin oxidoreductase  56 
 
 		 950 aa  1130    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.448434  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1170  formate dehydrogenase large subunit precursor  73.16 
 
 		 988 aa  1548    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.970148 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1503  formate dehydrogenase, alpha subunit, selenocysteine-containing  43.13 
 
 		 746 aa  613  9.999999999999999e-175  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2074  molybdopterin oxidoreductase  39.95 
 
 		 749 aa  593  1e-168  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1541  formate dehydrogenase  40.2 
 
 		 790 aa  584  1.0000000000000001e-165  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0534  molydopterin dinucleotide binding domain-containing protein  40.42 
 
 		 796 aa  572  1e-161  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000658423  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0761  hypothetical protein  39.78 
 
 		 797 aa  550  1e-155  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.669213  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2352  molybdopterin oxidoreductase  38.59 
 
 		 1111 aa  335  3e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.04 
 
 		 677 aa  314  5.999999999999999e-84  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1376  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.75 
 
 		 674 aa  313  1e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0754319  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.43 
 
 		 893 aa  310  5.9999999999999995e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0543  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.75 
 
 		 674 aa  310  1.0000000000000001e-82  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.16552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0608  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.62 
 
 		 674 aa  308  3e-82  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.74 
 
 		 900 aa  306  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0295  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.44 
 
 		 674 aa  305  3.0000000000000004e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0587435  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4271  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.58 
 
 		 1016 aa  304  6.000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.12828  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3238  molydopterin dinucleotide-binding region  32.49 
 
 		 687 aa  303  1e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0973988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.53 
 
 		 879 aa  303  1e-80  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.35 
 
 		 676 aa  302  2e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1538  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.19 
 
 		 676 aa  300  1e-79  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1561  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  34.42 
 
 		 695 aa  299  2e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.19 
 
 		 676 aa  298  3e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1813  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.13 
 
 		 688 aa  296  1e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0913  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.83 
 
 		 668 aa  293  9e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  31.85 
 
 		 745 aa  292  2e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1381  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.8 
 
 		 688 aa  292  2e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1868  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.19 
 
 		 1020 aa  291  4e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1789  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.19 
 
 		 1020 aa  291  4e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.11 
 
 		 686 aa  291  5.0000000000000004e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0413343  normal  0.361775 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.22 
 
 		 685 aa  291  5.0000000000000004e-77  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1379  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.34 
 
 		 688 aa  290  6e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0196  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.03 
 
 		 689 aa  287  5.999999999999999e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.202612  hitchhiker  0.00634005 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  33.7 
 
 		 899 aa  286  2.0000000000000002e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0463  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  31.65 
 
 		 689 aa  285  3.0000000000000004e-75  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2021  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.62 
 
 		 686 aa  284  7.000000000000001e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463591  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>