More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1541 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_4106  molybdopterin oxidoreductase  43.68 
 
 
950 aa  649    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1684  formate dehydrogenase, alpha subunit, selenocysteine-containing  53.08 
 
 
934 aa  832    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4509  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.99 
 
 
949 aa  643    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4137  molybdopterin oxidoreductase  44.5 
 
 
949 aa  652    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4813  molybdopterin oxidoreductase  43.99 
 
 
949 aa  651    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.517826 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0233  molybdopterin oxidoreductase  43.68 
 
 
950 aa  649    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00484847 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02278  hypothetical protein  43.3 
 
 
951 aa  660    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1503  formate dehydrogenase, alpha subunit, selenocysteine-containing  53.08 
 
 
746 aa  829    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0820  formate dehydrogenase alpha subunit  49.55 
 
 
932 aa  776    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.380979  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1120  putative formate dehydrogenase, alpha subunit  43.81 
 
 
951 aa  670    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2074  molybdopterin oxidoreductase  68.69 
 
 
749 aa  1120    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0358  formate dehydrogenase, alpha subunit (selenocysteine-containing)  67.44 
 
 
940 aa  1107    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.721212  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0534  molydopterin dinucleotide binding domain-containing protein  75.82 
 
 
796 aa  1285    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000658423  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0059  molybdopterin oxidoreductase  43.99 
 
 
949 aa  659    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.65892  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1915  formate dehydrogenase alpha subunit  43.11 
 
 
953 aa  669    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0401  formate dehydrogenase alpha subunit  43.15 
 
 
964 aa  647    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.298134  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0337  molybdopterin oxidoreductase  44.37 
 
 
949 aa  651    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3720  formate dehydrogenase alpha subunit  44.5 
 
 
950 aa  656    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.933728 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3791  formate dehydrogenase alpha subunit  44.63 
 
 
950 aa  656    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0057  twin-arginine translocation pathway signal  42.84 
 
 
949 aa  639    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0806  molybdopterin dinucleotide-binding region  56.18 
 
 
749 aa  912    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003494  formate dehydrogenase-O major subunit  43.81 
 
 
951 aa  664    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1453  formate dehydrogenase  43.62 
 
 
951 aa  670    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4224  molybdopterin oxidoreductase  43.55 
 
 
950 aa  648    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105156 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4421  molybdopterin oxidoreductase  44.37 
 
 
949 aa  664    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0761  hypothetical protein  73.54 
 
 
797 aa  1242    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.669213  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4136  molybdopterin oxidoreductase  43.68 
 
 
950 aa  649    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.448434  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3916  formate dehydrogenase alpha subunit  44.76 
 
 
950 aa  657    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.733885 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1541  formate dehydrogenase  100 
 
 
790 aa  1652    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0208  fumarate hydratase  54.93 
 
 
739 aa  893    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4140  molybdopterin oxidoreductase  43.55 
 
 
950 aa  632  1e-180  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4110  molybdopterin oxidoreductase  43.55 
 
 
950 aa  634  1e-180  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4228  molybdopterin oxidoreductase  43.55 
 
 
950 aa  633  1e-180  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00413313 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0063  molybdopterin oxidoreductase  43.22 
 
 
951 aa  632  1e-180  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4133  molybdopterin oxidoreductase  42.66 
 
 
951 aa  632  1e-180  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.987786  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0229  molybdopterin oxidoreductase  43.55 
 
 
950 aa  633  1e-180  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.363214 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3724  formate dehydrogenase alpha subunit  42.71 
 
 
950 aa  629  1e-179  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3795  formate dehydrogenase alpha subunit  42.71 
 
 
950 aa  629  1e-179  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0333  molybdopterin oxidoreductase  43.22 
 
 
950 aa  631  1e-179  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4809  molybdopterin oxidoreductase  42.4 
 
 
951 aa  631  1e-179  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.215861 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4417  molybdopterin oxidoreductase  42.02 
 
 
951 aa  625  1e-178  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3920  formate dehydrogenase alpha subunit  42.46 
 
 
950 aa  626  1e-178  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.922429 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4129  molybdopterin oxidoreductase  42.84 
 
 
957 aa  625  1e-177  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3609  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.76 
 
 
950 aa  623  1e-177  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3709  molybdopterin oxidoreductase  42.75 
 
 
970 aa  622  1e-176  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4513  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.46 
 
 
950 aa  620  1e-176  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3613  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.71 
 
 
949 aa  622  1e-176  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.982249  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1286  formate dehydrogenase alpha subunit  42.18 
 
 
962 aa  617  1e-175  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15303  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2791  molybdopterin oxidoreductase  41.84 
 
 
989 aa  607  9.999999999999999e-173  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0527141  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1170  formate dehydrogenase large subunit precursor  41.4 
 
 
988 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.970148 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0834  molybdopterin oxidoreductase  40.99 
 
 
991 aa  597  1e-169  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3464  molybdopterin oxidoreductase  40.97 
 
 
989 aa  596  1e-169  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4062  molybdopterin oxidoreductase  40.42 
 
 
996 aa  597  1e-169  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.818132  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0937  twin-arginine translocation pathway signal  40.97 
 
 
991 aa  596  1e-169  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2182  molybdopterin oxidoreductase  40.85 
 
 
1001 aa  590  1e-167  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.461283  normal  0.03262 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2586  molybdopterin oxidoreductase  40.85 
 
 
1001 aa  588  1e-166  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.537244  normal  0.227265 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2373  formate dehydrogenase large subunit  39.85 
 
 
999 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00446398 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0682  twin-arginine translocation pathway signal  39.38 
 
 
1012 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1398  molybdopterin oxidoreductase  40.2 
 
 
992 aa  584  1.0000000000000001e-165  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3261  twin-arginine translocation pathway signal  40.35 
 
 
986 aa  582  1e-164  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.303919  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3728  molybdopterin oxidoreductase  40.47 
 
 
994 aa  580  1e-164  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262187 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3087  molybdopterin oxidoreductase  41 
 
 
987 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0589388 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5278  molybdopterin oxidoreductase  40.81 
 
 
979 aa  570  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.940063  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2761  twin-arginine translocation pathway signal  39.05 
 
 
1025 aa  572  1e-161  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.297303  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2449  twin-arginine translocation pathway signal  40.25 
 
 
973 aa  568  1e-160  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3203  molybdopterin oxidoreductase  40.98 
 
 
980 aa  568  1e-160  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.542235  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3126  twin-arginine translocation pathway signal  39.65 
 
 
983 aa  564  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.389263  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5491  molybdopterin oxidoreductase  40.03 
 
 
973 aa  560  1e-158  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0389  molybdopterin oxidoreductase  39.5 
 
 
980 aa  533  1e-150  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0421  molybdopterin oxidoreductase  39.62 
 
 
980 aa  535  1e-150  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.273483  normal  0.81793 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0457  molybdopterin oxidoreductase  39.12 
 
 
980 aa  530  1e-149  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.134785  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0504  formate dehydrogenase alpha chain  38.67 
 
 
986 aa  521  1e-146  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2352  molybdopterin oxidoreductase  29.03 
 
 
1111 aa  236  9e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3238  molydopterin dinucleotide-binding region  30.22 
 
 
687 aa  206  1e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0973988  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1381  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.82 
 
 
688 aa  202  3e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  29.18 
 
 
745 aa  196  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0463  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  28.8 
 
 
689 aa  196  2e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1813  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.41 
 
 
688 aa  195  3e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0786  formate dehydrogenase alpha subunit  28.76 
 
 
529 aa  194  8e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1855  molybdopterin oxidoreductase  29.14 
 
 
527 aa  190  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1379  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.63 
 
 
688 aa  189  1e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2706  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.69 
 
 
541 aa  189  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2638  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.62 
 
 
1059 aa  189  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.409853 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.4 
 
 
879 aa  188  4e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.91 
 
 
893 aa  188  4e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1795  molybdopterin oxidoreductase  27.05 
 
 
526 aa  187  5e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4271  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.98 
 
 
1016 aa  186  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.12828  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1624  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.51 
 
 
687 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1561  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  28.57 
 
 
695 aa  185  3e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.37 
 
 
893 aa  185  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1575  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.21 
 
 
842 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1868  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.83 
 
 
1020 aa  183  8.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3043  formate dehydrogenase  28.33 
 
 
812 aa  183  8.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2088  formate dehydrogenase  29.01 
 
 
812 aa  184  8.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.207847  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1789  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.83 
 
 
1020 aa  183  8.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1376  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.36 
 
 
674 aa  183  1e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0754319  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.43 
 
 
685 aa  182  1e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0846  molybdopterin oxidoreductase  27.16 
 
 
527 aa  182  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3374  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.11 
 
 
1061 aa  182  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0608  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.16 
 
 
674 aa  182  2e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>