More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1286 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_4106  molybdopterin oxidoreductase  62.34 
 
 
950 aa  1231    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4129  molybdopterin oxidoreductase  56.64 
 
 
957 aa  1125    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02278  hypothetical protein  65.01 
 
 
951 aa  1325    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4421  molybdopterin oxidoreductase  62.38 
 
 
949 aa  1247    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4133  molybdopterin oxidoreductase  60.79 
 
 
951 aa  1209    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.987786  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2791  molybdopterin oxidoreductase  61.43 
 
 
989 aa  1199    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0527141  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0421  molybdopterin oxidoreductase  57.78 
 
 
980 aa  1085    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.273483  normal  0.81793 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4136  molybdopterin oxidoreductase  62.34 
 
 
950 aa  1230    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.448434  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3709  molybdopterin oxidoreductase  63.5 
 
 
970 aa  1250    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1398  molybdopterin oxidoreductase  57.16 
 
 
992 aa  1162    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2373  formate dehydrogenase large subunit  59.65 
 
 
999 aa  1176    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00446398 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4110  molybdopterin oxidoreductase  61.47 
 
 
950 aa  1223    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1453  formate dehydrogenase  63.07 
 
 
951 aa  1270    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1684  formate dehydrogenase, alpha subunit, selenocysteine-containing  47.25 
 
 
934 aa  846    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0337  molybdopterin oxidoreductase  62.59 
 
 
949 aa  1239    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4509  formate dehydrogenase, alpha subunit  61.81 
 
 
949 aa  1230    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4513  formate dehydrogenase, alpha subunit  59.5 
 
 
950 aa  1207    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4228  molybdopterin oxidoreductase  61.47 
 
 
950 aa  1222    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00413313 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0389  molybdopterin oxidoreductase  57.78 
 
 
980 aa  1084    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3203  molybdopterin oxidoreductase  58.73 
 
 
980 aa  1118    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.542235  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0229  molybdopterin oxidoreductase  61.47 
 
 
950 aa  1222    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.363214 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2074  molybdopterin oxidoreductase  43.86 
 
 
749 aa  643    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1170  formate dehydrogenase large subunit precursor  59.23 
 
 
988 aa  1171    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.970148 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0682  twin-arginine translocation pathway signal  59.36 
 
 
1012 aa  1174    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4417  molybdopterin oxidoreductase  60.69 
 
 
951 aa  1214    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0233  molybdopterin oxidoreductase  62.34 
 
 
950 aa  1230    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00484847 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0820  formate dehydrogenase alpha subunit  46.24 
 
 
932 aa  812    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.380979  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003494  formate dehydrogenase-O major subunit  65.94 
 
 
951 aa  1339    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0063  molybdopterin oxidoreductase  60.68 
 
 
951 aa  1217    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2182  molybdopterin oxidoreductase  58.81 
 
 
1001 aa  1183    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.461283  normal  0.03262 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4813  molybdopterin oxidoreductase  62.17 
 
 
949 aa  1246    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.517826 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3261  twin-arginine translocation pathway signal  60.1 
 
 
986 aa  1182    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.303919  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4062  molybdopterin oxidoreductase  59.75 
 
 
996 aa  1165    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.818132  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3087  molybdopterin oxidoreductase  57.78 
 
 
987 aa  1118    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0589388 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0937  twin-arginine translocation pathway signal  59.63 
 
 
991 aa  1164    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1915  formate dehydrogenase alpha subunit  64.07 
 
 
953 aa  1305    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3126  twin-arginine translocation pathway signal  55.51 
 
 
983 aa  1076    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.389263  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2761  twin-arginine translocation pathway signal  59.75 
 
 
1025 aa  1166    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.297303  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4140  molybdopterin oxidoreductase  61.47 
 
 
950 aa  1222    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1120  putative formate dehydrogenase, alpha subunit  65.11 
 
 
951 aa  1307    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0401  formate dehydrogenase alpha subunit  66.98 
 
 
964 aa  1317    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.298134  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5491  molybdopterin oxidoreductase  57.88 
 
 
973 aa  1124    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2449  twin-arginine translocation pathway signal  57.91 
 
 
973 aa  1137    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3720  formate dehydrogenase alpha subunit  62.55 
 
 
950 aa  1243    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.933728 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3724  formate dehydrogenase alpha subunit  60.85 
 
 
950 aa  1222    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0457  molybdopterin oxidoreductase  57.68 
 
 
980 aa  1082    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.134785  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3791  formate dehydrogenase alpha subunit  62.66 
 
 
950 aa  1243    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3795  formate dehydrogenase alpha subunit  60.85 
 
 
950 aa  1221    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1286  formate dehydrogenase alpha subunit  100 
 
 
962 aa  2003    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15303  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3728  molybdopterin oxidoreductase  58.79 
 
 
994 aa  1161    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262187 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0057  twin-arginine translocation pathway signal  61.96 
 
 
949 aa  1237    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0208  fumarate hydratase  45.35 
 
 
739 aa  669    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0059  molybdopterin oxidoreductase  62.9 
 
 
949 aa  1253    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.65892  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4809  molybdopterin oxidoreductase  60.58 
 
 
951 aa  1209    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.215861 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4224  molybdopterin oxidoreductase  62.45 
 
 
950 aa  1232    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105156 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3916  formate dehydrogenase alpha subunit  62.66 
 
 
950 aa  1240    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.733885 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3920  formate dehydrogenase alpha subunit  61.06 
 
 
950 aa  1224    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.922429 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0358  formate dehydrogenase, alpha subunit (selenocysteine-containing)  43.17 
 
 
940 aa  810    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.721212  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0333  molybdopterin oxidoreductase  60.75 
 
 
950 aa  1219    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3609  formate dehydrogenase, alpha subunit  62.62 
 
 
950 aa  1250    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3613  formate dehydrogenase, alpha subunit  62.98 
 
 
949 aa  1248    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.982249  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2586  molybdopterin oxidoreductase  58.61 
 
 
1001 aa  1180    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.537244  normal  0.227265 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5278  molybdopterin oxidoreductase  58.04 
 
 
979 aa  1124    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.940063  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4137  molybdopterin oxidoreductase  61.44 
 
 
949 aa  1230    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0504  formate dehydrogenase alpha chain  58.77 
 
 
986 aa  1131    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0834  molybdopterin oxidoreductase  59.42 
 
 
991 aa  1168    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3464  molybdopterin oxidoreductase  60.82 
 
 
989 aa  1191    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0806  molybdopterin dinucleotide-binding region  46.41 
 
 
749 aa  675    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1503  formate dehydrogenase, alpha subunit, selenocysteine-containing  46.38 
 
 
746 aa  668    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1541  formate dehydrogenase  42.18 
 
 
790 aa  617  1e-175  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0534  molydopterin dinucleotide binding domain-containing protein  40.66 
 
 
796 aa  597  1e-169  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000658423  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0761  hypothetical protein  40.03 
 
 
797 aa  584  1.0000000000000001e-165  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.669213  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2352  molybdopterin oxidoreductase  42.86 
 
 
1111 aa  351  5e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4271  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.58 
 
 
1016 aa  308  4.0000000000000004e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.12828  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1561  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  32.69 
 
 
695 aa  298  4e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.88 
 
 
685 aa  298  4e-79  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  32.36 
 
 
745 aa  295  3e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3374  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.14 
 
 
1061 aa  292  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.03 
 
 
893 aa  291  3e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.2 
 
 
893 aa  288  2e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.85 
 
 
677 aa  287  8e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1789  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.1 
 
 
1020 aa  285  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1868  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.96 
 
 
1020 aa  283  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1381  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.91 
 
 
688 aa  283  2e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0913  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.95 
 
 
668 aa  282  2e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1379  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.75 
 
 
688 aa  280  1e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1955  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.57 
 
 
1009 aa  279  2e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.11 
 
 
900 aa  279  2e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3388  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.04 
 
 
1010 aa  279  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.68 
 
 
900 aa  278  3e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0608  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.95 
 
 
674 aa  278  4e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0641  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.02 
 
 
979 aa  277  7e-73  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.81 
 
 
879 aa  277  9e-73  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3238  molydopterin dinucleotide-binding region  31.15 
 
 
687 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0973988  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.97 
 
 
893 aa  276  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0543  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.72 
 
 
674 aa  275  3e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.16552  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1376  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.56 
 
 
674 aa  275  3e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0754319  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1813  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.42 
 
 
688 aa  275  4.0000000000000004e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0295  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.79 
 
 
674 aa  273  1e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0587435  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1059  formate dehydrogenase alpha subunit  27.17 
 
 
1010 aa  273  1e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.080154 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>