More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3203 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0229  molybdopterin oxidoreductase  53.09 
 
 		 950 aa  1057    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.363214 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0358  formate dehydrogenase, alpha subunit (selenocysteine-containing)  43.77 
 
 		 940 aa  803    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.721212  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1453  formate dehydrogenase  56.17 
 
 		 951 aa  1105    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3728  molybdopterin oxidoreductase  53.25 
 
 		 994 aa  1021    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262187 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4421  molybdopterin oxidoreductase  55.57 
 
 		 949 aa  1100    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2586  molybdopterin oxidoreductase  54.43 
 
 		 1001 aa  1063    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.537244  normal  0.227265 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4133  molybdopterin oxidoreductase  54.87 
 
 		 951 aa  1071    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.987786  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2373  formate dehydrogenase large subunit  54.52 
 
 		 999 aa  1075    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00446398 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0333  molybdopterin oxidoreductase  53.4 
 
 		 950 aa  1066    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4813  molybdopterin oxidoreductase  56.19 
 
 		 949 aa  1106    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.517826 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1684  formate dehydrogenase, alpha subunit, selenocysteine-containing  44.18 
 
 		 934 aa  751    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0389  molybdopterin oxidoreductase  89.69 
 
 		 980 aa  1796    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3087  molybdopterin oxidoreductase  86.22 
 
 		 987 aa  1763    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0589388 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4509  formate dehydrogenase, alpha subunit  54.85 
 
 		 949 aa  1094    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4513  formate dehydrogenase, alpha subunit  53.67 
 
 		 950 aa  1065    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0233  molybdopterin oxidoreductase  53.51 
 
 		 950 aa  1065    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00484847 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5278  molybdopterin oxidoreductase  87.86 
 
 		 979 aa  1788    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.940063  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1120  putative formate dehydrogenase, alpha subunit  57.74 
 
 		 951 aa  1123    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0682  twin-arginine translocation pathway signal  55.53 
 
 		 1012 aa  1083    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003494  formate dehydrogenase-O major subunit  57.41 
 
 		 951 aa  1135    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1398  molybdopterin oxidoreductase  53.31 
 
 		 992 aa  1040    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02278  hypothetical protein  57.52 
 
 		 951 aa  1138    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0457  molybdopterin oxidoreductase  90.61 
 
 		 980 aa  1807    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.134785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0820  formate dehydrogenase alpha subunit  42.95 
 
 		 932 aa  771    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.380979  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4110  molybdopterin oxidoreductase  53.09 
 
 		 950 aa  1058    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0421  molybdopterin oxidoreductase  89.8 
 
 		 980 aa  1797    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.273483  normal  0.81793 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4140  molybdopterin oxidoreductase  52.76 
 
 		 950 aa  1056    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3261  twin-arginine translocation pathway signal  53.86 
 
 		 986 aa  1056    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.303919  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4809  molybdopterin oxidoreductase  53.82 
 
 		 951 aa  1070    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.215861 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0337  molybdopterin oxidoreductase  54.95 
 
 		 949 aa  1092    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0937  twin-arginine translocation pathway signal  52.67 
 
 		 991 aa  1050    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4224  molybdopterin oxidoreductase  53.4 
 
 		 950 aa  1062    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105156 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1915  formate dehydrogenase alpha subunit  55.8 
 
 		 953 aa  1113    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3126  twin-arginine translocation pathway signal  69.77 
 
 		 983 aa  1473    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.389263  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2761  twin-arginine translocation pathway signal  55.05 
 
 		 1025 aa  1063    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.297303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0504  formate dehydrogenase alpha chain  70.31 
 
 		 986 aa  1444    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0401  formate dehydrogenase alpha subunit  59.55 
 
 		 964 aa  1181    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.298134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0063  molybdopterin oxidoreductase  54.07 
 
 		 951 aa  1075    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2449  twin-arginine translocation pathway signal  71.47 
 
 		 973 aa  1511    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4106  molybdopterin oxidoreductase  53.51 
 
 		 950 aa  1063    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3720  formate dehydrogenase alpha subunit  53.92 
 
 		 950 aa  1075    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.933728 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3724  formate dehydrogenase alpha subunit  54.4 
 
 		 950 aa  1074    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4129  molybdopterin oxidoreductase  52.45 
 
 		 957 aa  1038    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3791  formate dehydrogenase alpha subunit  53.92 
 
 		 950 aa  1075    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3795  formate dehydrogenase alpha subunit  54.4 
 
 		 950 aa  1074    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1286  formate dehydrogenase alpha subunit  57.78 
 
 		 962 aa  1130    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4228  molybdopterin oxidoreductase  53.09 
 
 		 950 aa  1057    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413313 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0057  twin-arginine translocation pathway signal  54.69 
 
 		 949 aa  1089    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0059  molybdopterin oxidoreductase  55.67 
 
 		 949 aa  1109    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.65892  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2182  molybdopterin oxidoreductase  54.53 
 
 		 1001 aa  1065    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.461283  normal  0.03262 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5491  molybdopterin oxidoreductase  71.65 
 
 		 973 aa  1504    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3203  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 		 980 aa  2035    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.542235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3709  molybdopterin oxidoreductase  55.06 
 
 		 970 aa  1091    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3916  formate dehydrogenase alpha subunit  54.23 
 
 		 950 aa  1076    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.733885 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3920  formate dehydrogenase alpha subunit  54.61 
 
 		 950 aa  1076    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.922429 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2791  molybdopterin oxidoreductase  54.45 
 
 		 989 aa  1066    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0527141  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3609  formate dehydrogenase, alpha subunit  54.61 
 
 		 950 aa  1071    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3613  formate dehydrogenase, alpha subunit  54.29 
 
 		 949 aa  1078    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.982249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4417  molybdopterin oxidoreductase  53.62 
 
 		 951 aa  1074    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4137  molybdopterin oxidoreductase  54.74 
 
 		 949 aa  1087    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0834  molybdopterin oxidoreductase  52.86 
 
 		 991 aa  1037    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3464  molybdopterin oxidoreductase  53.7 
 
 		 989 aa  1062    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4062  molybdopterin oxidoreductase  54.37 
 
 		 996 aa  1058    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.818132  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4136  molybdopterin oxidoreductase  53.51 
 
 		 950 aa  1065    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.448434  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1170  formate dehydrogenase large subunit precursor  53.11 
 
 		 988 aa  1036    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.970148 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0806  molybdopterin dinucleotide-binding region  43.08 
 
 		 749 aa  610  1e-173  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0208  fumarate hydratase  43.43 
 
 		 739 aa  600  1e-170  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2074  molybdopterin oxidoreductase  41.42 
 
 		 749 aa  585  1.0000000000000001e-165  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1503  formate dehydrogenase, alpha subunit, selenocysteine-containing  42.84 
 
 		 746 aa  584  1.0000000000000001e-165  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2352  molybdopterin oxidoreductase  35.07 
 
 		 1111 aa  580  1e-164  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0534  molydopterin dinucleotide binding domain-containing protein  41.08 
 
 		 796 aa  582  1e-164  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000658423  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1541  formate dehydrogenase  40.98 
 
 		 790 aa  568  1e-160  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0761  hypothetical protein  40.05 
 
 		 797 aa  550  1e-155  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.669213  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.07 
 
 		 685 aa  300  6e-80  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.66 
 
 		 688 aa  292  2e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.43 
 
 		 879 aa  291  5.0000000000000004e-77  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3238  molydopterin dinucleotide-binding region  30.93 
 
 		 687 aa  288  4e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0973988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1813  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.57 
 
 		 688 aa  280  6e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1381  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.41 
 
 		 688 aa  278  5e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  32 
 
 		 893 aa  276  2.0000000000000002e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  31.83 
 
 		 745 aa  274  7e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0463  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  31.2 
 
 		 689 aa  273  1e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0196  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.68 
 
 		 689 aa  272  2e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.202612  hitchhiker  0.00634005 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2021  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.19 
 
 		 686 aa  272  2e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1379  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.27 
 
 		 688 aa  269  2e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.45 
 
 		 893 aa  267  5.999999999999999e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4113  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.81 
 
 		 901 aa  266  1e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163208  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.9 
 
 		 677 aa  266  1e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0913  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.09 
 
 		 668 aa  266  1e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.87 
 
 		 900 aa  265  3e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.92 
 
 		 893 aa  265  3e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.3 
 
 		 676 aa  265  3e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1925  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.75 
 
 		 986 aa  265  4e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0543  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.6 
 
 		 674 aa  264  4.999999999999999e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.16552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1376  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.11 
 
 		 674 aa  264  6e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0754319  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0295  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.11 
 
 		 674 aa  264  6.999999999999999e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0587435  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1624  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.58 
 
 		 687 aa  263  1e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1538  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.19 
 
 		 676 aa  263  1e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.39 
 
 		 676 aa  262  2e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1561  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  30.82 
 
 		 695 aa  261  3e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>