More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0761 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0761  hypothetical protein  100 
 
 		 797 aa  1666    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.669213  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0208  fumarate hydratase  54.8 
 
 		 739 aa  864    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1503  formate dehydrogenase, alpha subunit, selenocysteine-containing  52.63 
 
 		 746 aa  802    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1684  formate dehydrogenase, alpha subunit, selenocysteine-containing  52.63 
 
 		 934 aa  806    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2074  molybdopterin oxidoreductase  68 
 
 		 749 aa  1097    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0806  molybdopterin dinucleotide-binding region  55.48 
 
 		 749 aa  878    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0820  formate dehydrogenase alpha subunit  47.56 
 
 		 932 aa  752    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.380979  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1915  formate dehydrogenase alpha subunit  42.71 
 
 		 953 aa  639    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0534  molydopterin dinucleotide binding domain-containing protein  80.68 
 
 		 796 aa  1363    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000658423  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0358  formate dehydrogenase, alpha subunit (selenocysteine-containing)  65.85 
 
 		 940 aa  1074    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.721212  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1541  formate dehydrogenase  73.54 
 
 		 790 aa  1242    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1453  formate dehydrogenase  43.61 
 
 		 951 aa  635  1e-180  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1120  putative formate dehydrogenase, alpha subunit  43.09 
 
 		 951 aa  634  1e-180  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003494  formate dehydrogenase-O major subunit  42.75 
 
 		 951 aa  625  1e-178  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0337  molybdopterin oxidoreductase  44.66 
 
 		 949 aa  625  1e-177  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4136  molybdopterin oxidoreductase  44.46 
 
 		 950 aa  624  1e-177  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.448434  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02278  hypothetical protein  42.33 
 
 		 951 aa  623  1e-177  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0233  molybdopterin oxidoreductase  44.46 
 
 		 950 aa  624  1e-177  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00484847 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4224  molybdopterin oxidoreductase  44.33 
 
 		 950 aa  622  1e-177  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105156 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4106  molybdopterin oxidoreductase  44.46 
 
 		 950 aa  624  1e-177  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3916  formate dehydrogenase alpha subunit  43.92 
 
 		 950 aa  622  1e-177  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.733885 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0059  molybdopterin oxidoreductase  43.41 
 
 		 949 aa  620  1e-176  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.65892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3720  formate dehydrogenase alpha subunit  43.66 
 
 		 950 aa  621  1e-176  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.933728 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3791  formate dehydrogenase alpha subunit  43.79 
 
 		 950 aa  621  1e-176  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4421  molybdopterin oxidoreductase  43.28 
 
 		 949 aa  618  1e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0401  formate dehydrogenase alpha subunit  43.26 
 
 		 964 aa  617  1e-175  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.298134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0063  molybdopterin oxidoreductase  43.02 
 
 		 951 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4129  molybdopterin oxidoreductase  43.65 
 
 		 957 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4813  molybdopterin oxidoreductase  43.82 
 
 		 949 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.517826 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4137  molybdopterin oxidoreductase  43.15 
 
 		 949 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3609  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.77 
 
 		 950 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0229  molybdopterin oxidoreductase  43.02 
 
 		 950 aa  608  1e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.363214 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4228  molybdopterin oxidoreductase  43.02 
 
 		 950 aa  608  1e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413313 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4509  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.41 
 
 		 949 aa  610  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4110  molybdopterin oxidoreductase  43.02 
 
 		 950 aa  609  1e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4417  molybdopterin oxidoreductase  41.94 
 
 		 951 aa  609  1e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0057  twin-arginine translocation pathway signal  43.18 
 
 		 949 aa  610  1e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0333  molybdopterin oxidoreductase  42.89 
 
 		 950 aa  608  9.999999999999999e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4809  molybdopterin oxidoreductase  41.94 
 
 		 951 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.215861 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3724  formate dehydrogenase alpha subunit  42.51 
 
 		 950 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3795  formate dehydrogenase alpha subunit  42.51 
 
 		 950 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4140  molybdopterin oxidoreductase  43.02 
 
 		 950 aa  608  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3920  formate dehydrogenase alpha subunit  42.51 
 
 		 950 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.922429 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4133  molybdopterin oxidoreductase  41.74 
 
 		 951 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.987786  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3613  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.69 
 
 		 949 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.982249  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4513  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.33 
 
 		 950 aa  600  1e-170  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3709  molybdopterin oxidoreductase  42.42 
 
 		 970 aa  600  1e-170  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1286  formate dehydrogenase alpha subunit  40.03 
 
 		 962 aa  584  1.0000000000000001e-165  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2791  molybdopterin oxidoreductase  39.98 
 
 		 989 aa  566  1e-160  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0527141  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3087  molybdopterin oxidoreductase  40.43 
 
 		 987 aa  565  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0589388 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2373  formate dehydrogenase large subunit  39.58 
 
 		 999 aa  560  1e-158  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00446398 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4062  molybdopterin oxidoreductase  39.43 
 
 		 996 aa  559  1e-158  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.818132  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2182  molybdopterin oxidoreductase  40.02 
 
 		 1001 aa  555  1e-156  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.461283  normal  0.03262 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3464  molybdopterin oxidoreductase  39.48 
 
 		 989 aa  554  1e-156  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2586  molybdopterin oxidoreductase  40.02 
 
 		 1001 aa  553  1e-156  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.537244  normal  0.227265 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0834  molybdopterin oxidoreductase  39.25 
 
 		 991 aa  555  1e-156  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5278  molybdopterin oxidoreductase  39.42 
 
 		 979 aa  550  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.940063  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1398  molybdopterin oxidoreductase  39.78 
 
 		 992 aa  550  1e-155  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3203  molybdopterin oxidoreductase  40.05 
 
 		 980 aa  550  1e-155  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.542235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0937  twin-arginine translocation pathway signal  39.3 
 
 		 991 aa  552  1e-155  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2449  twin-arginine translocation pathway signal  39.62 
 
 		 973 aa  551  1e-155  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1170  formate dehydrogenase large subunit precursor  38.45 
 
 		 988 aa  546  1e-154  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.970148 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0682  twin-arginine translocation pathway signal  39.05 
 
 		 1012 aa  546  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3126  twin-arginine translocation pathway signal  39.58 
 
 		 983 aa  544  1e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.389263  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2761  twin-arginine translocation pathway signal  39.03 
 
 		 1025 aa  543  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.297303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5491  molybdopterin oxidoreductase  39.9 
 
 		 973 aa  545  1e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3728  molybdopterin oxidoreductase  38.59 
 
 		 994 aa  536  1e-151  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262187 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3261  twin-arginine translocation pathway signal  38.36 
 
 		 986 aa  538  1e-151  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.303919  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0421  molybdopterin oxidoreductase  39.92 
 
 		 980 aa  527  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.273483  normal  0.81793 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0457  molybdopterin oxidoreductase  39.55 
 
 		 980 aa  525  1e-147  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.134785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0389  molybdopterin oxidoreductase  39.8 
 
 		 980 aa  525  1e-147  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0504  formate dehydrogenase alpha chain  39.75 
 
 		 986 aa  520  1e-146  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2352  molybdopterin oxidoreductase  26.41 
 
 		 1111 aa  309  1.0000000000000001e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3238  molydopterin dinucleotide-binding region  32.79 
 
 		 687 aa  220  7e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0973988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1813  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.24 
 
 		 688 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1624  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.47 
 
 		 687 aa  196  1e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0463  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  29.68 
 
 		 689 aa  194  6e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1561  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  30.28 
 
 		 695 aa  194  7e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  28.6 
 
 		 745 aa  194  7e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1381  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.86 
 
 		 688 aa  191  5.999999999999999e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  28.75 
 
 		 899 aa  189  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.65 
 
 		 686 aa  185  3e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0413343  normal  0.361775 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.66 
 
 		 879 aa  184  6e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0786  formate dehydrogenase alpha subunit  28.13 
 
 		 529 aa  184  7e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.13 
 
 		 893 aa  180  8e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1795  molybdopterin oxidoreductase  26.34 
 
 		 526 aa  180  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1379  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.45 
 
 		 688 aa  179  2e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4271  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.49 
 
 		 1016 aa  178  4e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.12828  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2638  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.99 
 
 		 1059 aa  177  6e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.409853 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0915  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.08 
 
 		 920 aa  177  8e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.72 
 
 		 917 aa  175  2.9999999999999996e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.85 
 
 		 893 aa  174  5.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2706  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.97 
 
 		 541 aa  174  5.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1575  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.99 
 
 		 842 aa  174  7.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1855  molybdopterin oxidoreductase  27.31 
 
 		 527 aa  173  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5531  formate dehydrogenase subunit alpha  25.42 
 
 		 825 aa  173  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3374  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.77 
 
 		 1061 aa  172  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63605  formate dehydrogenase-O, major subunit  25.57 
 
 		 1026 aa  172  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4119  aerobic formate dehydrogenase subunit alpha  30.13 
 
 		 1015 aa  171  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0038  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.13 
 
 		 803 aa  171  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>