More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3126 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_4133  molybdopterin oxidoreductase  53.58 
 
 		 951 aa  1077    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.987786  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0504  formate dehydrogenase alpha chain  64.87 
 
 		 986 aa  1340    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4224  molybdopterin oxidoreductase  55.45 
 
 		 950 aa  1083    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105156 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4137  molybdopterin oxidoreductase  54.58 
 
 		 949 aa  1075    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2182  molybdopterin oxidoreductase  53.69 
 
 		 1001 aa  1044    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.461283  normal  0.03262 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0421  molybdopterin oxidoreductase  68.74 
 
 		 980 aa  1419    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.273483  normal  0.81793 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4813  molybdopterin oxidoreductase  54.15 
 
 		 949 aa  1091    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.517826 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0337  molybdopterin oxidoreductase  55.83 
 
 		 949 aa  1090    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3728  molybdopterin oxidoreductase  52.6 
 
 		 994 aa  1000    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262187 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2373  formate dehydrogenase large subunit  52.95 
 
 		 999 aa  1045    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00446398 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0389  molybdopterin oxidoreductase  68.64 
 
 		 980 aa  1416    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1684  formate dehydrogenase, alpha subunit, selenocysteine-containing  44.49 
 
 		 934 aa  748    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0229  molybdopterin oxidoreductase  53.43 
 
 		 950 aa  1081    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.363214 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4509  formate dehydrogenase, alpha subunit  55.04 
 
 		 949 aa  1088    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4513  formate dehydrogenase, alpha subunit  52.3 
 
 		 950 aa  1070    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2791  molybdopterin oxidoreductase  54.88 
 
 		 989 aa  1056    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0527141  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4110  molybdopterin oxidoreductase  53.43 
 
 		 950 aa  1082    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0682  twin-arginine translocation pathway signal  53.67 
 
 		 1012 aa  1035    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4421  molybdopterin oxidoreductase  54.77 
 
 		 949 aa  1091    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003494  formate dehydrogenase-O major subunit  56.24 
 
 		 951 aa  1126    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1120  putative formate dehydrogenase, alpha subunit  55.51 
 
 		 951 aa  1094    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02278  hypothetical protein  55.93 
 
 		 951 aa  1130    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4136  molybdopterin oxidoreductase  55.56 
 
 		 950 aa  1085    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.448434  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0063  molybdopterin oxidoreductase  54.4 
 
 		 951 aa  1082    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0820  formate dehydrogenase alpha subunit  41.65 
 
 		 932 aa  742    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.380979  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4129  molybdopterin oxidoreductase  52.85 
 
 		 957 aa  1052    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3709  molybdopterin oxidoreductase  53.95 
 
 		 970 aa  1053    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1453  formate dehydrogenase  55.51 
 
 		 951 aa  1108    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3087  molybdopterin oxidoreductase  70.91 
 
 		 987 aa  1446    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0589388 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4809  molybdopterin oxidoreductase  53.48 
 
 		 951 aa  1079    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.215861 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3261  twin-arginine translocation pathway signal  52.29 
 
 		 986 aa  1030    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.303919  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4062  molybdopterin oxidoreductase  52.91 
 
 		 996 aa  1014    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.818132  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5491  molybdopterin oxidoreductase  73.23 
 
 		 973 aa  1525    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0937  twin-arginine translocation pathway signal  52.99 
 
 		 991 aa  1026    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4140  molybdopterin oxidoreductase  53.43 
 
 		 950 aa  1080    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1915  formate dehydrogenase alpha subunit  54.91 
 
 		 953 aa  1102    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3126  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 983 aa  2034    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.389263  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2761  twin-arginine translocation pathway signal  53.07 
 
 		 1025 aa  1028    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.297303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4228  molybdopterin oxidoreductase  53.43 
 
 		 950 aa  1080    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413313 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0401  formate dehydrogenase alpha subunit  57.68 
 
 		 964 aa  1139    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.298134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2449  twin-arginine translocation pathway signal  73.67 
 
 		 973 aa  1535    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3720  formate dehydrogenase alpha subunit  55.35 
 
 		 950 aa  1094    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.933728 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3724  formate dehydrogenase alpha subunit  53.22 
 
 		 950 aa  1076    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0233  molybdopterin oxidoreductase  55.56 
 
 		 950 aa  1085    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00484847 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3791  formate dehydrogenase alpha subunit  55.35 
 
 		 950 aa  1093    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3795  formate dehydrogenase alpha subunit  53.22 
 
 		 950 aa  1077    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1286  formate dehydrogenase alpha subunit  55.61 
 
 		 962 aa  1085    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0057  twin-arginine translocation pathway signal  54.99 
 
 		 949 aa  1082    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0358  formate dehydrogenase, alpha subunit (selenocysteine-containing)  43.45 
 
 		 940 aa  805    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.721212  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0457  molybdopterin oxidoreductase  68.94 
 
 		 980 aa  1425    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.134785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4417  molybdopterin oxidoreductase  54.09 
 
 		 951 aa  1087    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1398  molybdopterin oxidoreductase  51.75 
 
 		 992 aa  1014    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3203  molybdopterin oxidoreductase  69.6 
 
 		 980 aa  1469    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.542235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3916  formate dehydrogenase alpha subunit  55.45 
 
 		 950 aa  1092    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.733885 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3920  formate dehydrogenase alpha subunit  53.22 
 
 		 950 aa  1075    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.922429 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0333  molybdopterin oxidoreductase  53.84 
 
 		 950 aa  1079    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3609  formate dehydrogenase, alpha subunit  54.27 
 
 		 950 aa  1077    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3613  formate dehydrogenase, alpha subunit  55.19 
 
 		 949 aa  1083    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.982249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0059  molybdopterin oxidoreductase  55.81 
 
 		 949 aa  1105    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.65892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2586  molybdopterin oxidoreductase  53.59 
 
 		 1001 aa  1042    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.537244  normal  0.227265 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4106  molybdopterin oxidoreductase  55.56 
 
 		 950 aa  1084    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0834  molybdopterin oxidoreductase  52.56 
 
 		 991 aa  1011    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3464  molybdopterin oxidoreductase  53.59 
 
 		 989 aa  1038    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5278  molybdopterin oxidoreductase  71.07 
 
 		 979 aa  1455    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.940063  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1170  formate dehydrogenase large subunit precursor  52.81 
 
 		 988 aa  1008    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.970148 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0806  molybdopterin dinucleotide-binding region  42.89 
 
 		 749 aa  604  1.0000000000000001e-171  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0208  fumarate hydratase  42.26 
 
 		 739 aa  582  1.0000000000000001e-165  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0534  molydopterin dinucleotide binding domain-containing protein  41.26 
 
 		 796 aa  580  1e-164  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000658423  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1503  formate dehydrogenase, alpha subunit, selenocysteine-containing  43.61 
 
 		 746 aa  578  1.0000000000000001e-163  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2074  molybdopterin oxidoreductase  40.87 
 
 		 749 aa  575  1.0000000000000001e-162  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1541  formate dehydrogenase  39.65 
 
 		 790 aa  564  1.0000000000000001e-159  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0761  hypothetical protein  39.58 
 
 		 797 aa  545  1e-153  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.669213  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2352  molybdopterin oxidoreductase  43.41 
 
 		 1111 aa  358  2.9999999999999997e-97  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3238  molydopterin dinucleotide-binding region  32.03 
 
 		 687 aa  311  4e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0973988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.12 
 
 		 879 aa  311  5.9999999999999995e-83  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.82 
 
 		 900 aa  310  8e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.49 
 
 		 688 aa  301  4e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1813  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.22 
 
 		 688 aa  298  3e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.4 
 
 		 893 aa  298  3e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1789  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.64 
 
 		 1020 aa  298  4e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.5 
 
 		 685 aa  298  4e-79  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0463  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  32.36 
 
 		 689 aa  298  5e-79  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1379  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.83 
 
 		 688 aa  296  9e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1868  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.55 
 
 		 1020 aa  296  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0295  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.08 
 
 		 674 aa  295  3e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0587435  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1376  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.59 
 
 		 674 aa  293  9e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0754319  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0543  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.75 
 
 		 674 aa  293  1e-77  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.16552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1381  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.32 
 
 		 688 aa  293  1e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1339  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.91 
 
 		 662 aa  288  2.9999999999999996e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.92 
 
 		 900 aa  288  2.9999999999999996e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.85 
 
 		 893 aa  288  4e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2021  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.42 
 
 		 686 aa  288  5e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.03 
 
 		 677 aa  287  8e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.42 
 
 		 893 aa  285  3.0000000000000004e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.5 
 
 		 676 aa  284  5.000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0196  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.88 
 
 		 689 aa  284  6.000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.202612  hitchhiker  0.00634005 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.72 
 
 		 917 aa  282  2e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4113  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.96 
 
 		 901 aa  283  2e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163208  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0608  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.93 
 
 		 674 aa  281  5e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.18 
 
 		 676 aa  281  5e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>