More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0208 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1120  putative formate dehydrogenase, alpha subunit  47.8 
 
 		 951 aa  699    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4813  molybdopterin oxidoreductase  49.4 
 
 		 949 aa  718    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.517826 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3728  molybdopterin oxidoreductase  46.43 
 
 		 994 aa  672    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262187 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4129  molybdopterin oxidoreductase  48.28 
 
 		 957 aa  696    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0063  molybdopterin oxidoreductase  47.47 
 
 		 951 aa  695    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0534  molydopterin dinucleotide binding domain-containing protein  55.31 
 
 		 796 aa  874    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000658423  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0233  molybdopterin oxidoreductase  48.06 
 
 		 950 aa  713    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00484847 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2373  formate dehydrogenase large subunit  45.27 
 
 		 999 aa  664    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00446398 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3464  molybdopterin oxidoreductase  45.18 
 
 		 989 aa  658    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1684  formate dehydrogenase, alpha subunit, selenocysteine-containing  68.02 
 
 		 934 aa  1078    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4509  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.33 
 
 		 949 aa  711    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4513  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.4 
 
 		 950 aa  674    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1503  formate dehydrogenase, alpha subunit, selenocysteine-containing  68.02 
 
 		 746 aa  1072    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0682  twin-arginine translocation pathway signal  45.73 
 
 		 1012 aa  666    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4136  molybdopterin oxidoreductase  48.06 
 
 		 950 aa  713    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.448434  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1398  molybdopterin oxidoreductase  46.04 
 
 		 992 aa  664    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4133  molybdopterin oxidoreductase  46.93 
 
 		 951 aa  688    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.987786  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0059  molybdopterin oxidoreductase  49.13 
 
 		 949 aa  719    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.65892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4417  molybdopterin oxidoreductase  46.93 
 
 		 951 aa  691    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4421  molybdopterin oxidoreductase  48.87 
 
 		 949 aa  723    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2586  molybdopterin oxidoreductase  46.04 
 
 		 1001 aa  665    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.537244  normal  0.227265 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1170  formate dehydrogenase large subunit precursor  46.54 
 
 		 988 aa  682    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.970148 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0820  formate dehydrogenase alpha subunit  55.47 
 
 		 932 aa  847    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.380979  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1453  formate dehydrogenase  47.4 
 
 		 951 aa  700    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2791  molybdopterin oxidoreductase  45.96 
 
 		 989 aa  671    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0527141  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3709  molybdopterin oxidoreductase  47.35 
 
 		 970 aa  704    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2182  molybdopterin oxidoreductase  46.3 
 
 		 1001 aa  669    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.461283  normal  0.03262 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3261  twin-arginine translocation pathway signal  45.7 
 
 		 986 aa  665    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.303919  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02278  hypothetical protein  47.01 
 
 		 951 aa  684    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0937  twin-arginine translocation pathway signal  46.35 
 
 		 991 aa  681    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4809  molybdopterin oxidoreductase  46.93 
 
 		 951 aa  689    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.215861 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0834  molybdopterin oxidoreductase  45.7 
 
 		 991 aa  670    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1915  formate dehydrogenase alpha subunit  49.27 
 
 		 953 aa  737    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2761  twin-arginine translocation pathway signal  46.18 
 
 		 1025 aa  671    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.297303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4137  molybdopterin oxidoreductase  48.6 
 
 		 949 aa  713    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0401  formate dehydrogenase alpha subunit  45.78 
 
 		 964 aa  667    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.298134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4224  molybdopterin oxidoreductase  47.93 
 
 		 950 aa  711    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105156 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0761  hypothetical protein  54.8 
 
 		 797 aa  864    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.669213  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3720  formate dehydrogenase alpha subunit  48.6 
 
 		 950 aa  719    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.933728 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3724  formate dehydrogenase alpha subunit  47.47 
 
 		 950 aa  694    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3791  formate dehydrogenase alpha subunit  48.73 
 
 		 950 aa  719    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3795  formate dehydrogenase alpha subunit  47.47 
 
 		 950 aa  695    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1286  formate dehydrogenase alpha subunit  45.35 
 
 		 962 aa  669    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003494  formate dehydrogenase-O major subunit  47.28 
 
 		 951 aa  693    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0057  twin-arginine translocation pathway signal  47.66 
 
 		 949 aa  709    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0337  molybdopterin oxidoreductase  48.06 
 
 		 949 aa  709    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4106  molybdopterin oxidoreductase  48.06 
 
 		 950 aa  712    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0806  molybdopterin dinucleotide-binding region  66.89 
 
 		 749 aa  1064    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4228  molybdopterin oxidoreductase  47.87 
 
 		 950 aa  692    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413313 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0333  molybdopterin oxidoreductase  46.8 
 
 		 950 aa  682    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4110  molybdopterin oxidoreductase  47.87 
 
 		 950 aa  693    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2074  molybdopterin oxidoreductase  56.14 
 
 		 749 aa  907    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0229  molybdopterin oxidoreductase  47.87 
 
 		 950 aa  692    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.363214 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0208  fumarate hydratase  100 
 
 		 739 aa  1535    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3916  formate dehydrogenase alpha subunit  49 
 
 		 950 aa  723    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.733885 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3920  formate dehydrogenase alpha subunit  47.47 
 
 		 950 aa  694    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.922429 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1541  formate dehydrogenase  54.93 
 
 		 790 aa  893    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4062  molybdopterin oxidoreductase  45.51 
 
 		 996 aa  669    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.818132  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3609  formate dehydrogenase, alpha subunit  48 
 
 		 950 aa  699    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3613  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.66 
 
 		 949 aa  697    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.982249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4140  molybdopterin oxidoreductase  47.87 
 
 		 950 aa  691    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0358  formate dehydrogenase, alpha subunit (selenocysteine-containing)  55.17 
 
 		 940 aa  864    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.721212  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3087  molybdopterin oxidoreductase  43.51 
 
 		 987 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0589388 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5278  molybdopterin oxidoreductase  42.91 
 
 		 979 aa  609  1e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.940063  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2449  twin-arginine translocation pathway signal  43.32 
 
 		 973 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3203  molybdopterin oxidoreductase  43.3 
 
 		 980 aa  600  1e-170  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.542235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0421  molybdopterin oxidoreductase  43.23 
 
 		 980 aa  589  1e-167  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.273483  normal  0.81793 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0389  molybdopterin oxidoreductase  43.35 
 
 		 980 aa  590  1e-167  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0457  molybdopterin oxidoreductase  42.84 
 
 		 980 aa  585  1e-166  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.134785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5491  molybdopterin oxidoreductase  42.58 
 
 		 973 aa  588  1e-166  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3126  twin-arginine translocation pathway signal  42.26 
 
 		 983 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.389263  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0504  formate dehydrogenase alpha chain  42.16 
 
 		 986 aa  578  1.0000000000000001e-163  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2352  molybdopterin oxidoreductase  31.29 
 
 		 1111 aa  258  2e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3238  molydopterin dinucleotide-binding region  33.48 
 
 		 687 aa  219  1e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0973988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0786  formate dehydrogenase alpha subunit  33.9 
 
 		 529 aa  218  2.9999999999999998e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1379  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.76 
 
 		 688 aa  217  5.9999999999999996e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.04 
 
 		 879 aa  216  1.9999999999999998e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2638  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.5 
 
 		 1059 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.409853 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.24 
 
 		 677 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1855  molybdopterin oxidoreductase  30.02 
 
 		 527 aa  214  7e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4271  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.92 
 
 		 1016 aa  214  7e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.12828  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1813  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.6 
 
 		 688 aa  212  2e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0608  formate dehydrogenase, alpha subunit  30 
 
 		 674 aa  212  3e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  31.68 
 
 		 745 aa  210  6e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1381  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.74 
 
 		 688 aa  210  9e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1624  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.6 
 
 		 687 aa  209  2e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0295  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.17 
 
 		 674 aa  209  2e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0587435  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1795  molybdopterin oxidoreductase  31.63 
 
 		 526 aa  209  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0543  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.96 
 
 		 674 aa  207  6e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.16552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0846  molybdopterin oxidoreductase  30.82 
 
 		 527 aa  207  6e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.16 
 
 		 685 aa  207  6e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1376  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.83 
 
 		 674 aa  207  7e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0754319  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0913  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.72 
 
 		 668 aa  207  8e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1575  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.87 
 
 		 842 aa  206  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2008  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.16 
 
 		 824 aa  205  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.715291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.38 
 
 		 686 aa  206  2e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0413343  normal  0.361775 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0915  formate dehydrogenase, alpha subunit  31 
 
 		 920 aa  204  4e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1561  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  31.56 
 
 		 695 aa  204  5e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0463  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  31.22 
 
 		 689 aa  204  6e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3374  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.54 
 
 		 1061 aa  203  9e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>