More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0534 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_4224  molybdopterin oxidoreductase  45.01 
 
 		 950 aa  658    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105156 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4228  molybdopterin oxidoreductase  44.3 
 
 		 950 aa  637    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413313 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0806  molybdopterin dinucleotide-binding region  54.86 
 
 		 749 aa  876    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0229  molybdopterin oxidoreductase  44.3 
 
 		 950 aa  637    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.363214 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0059  molybdopterin oxidoreductase  44.77 
 
 		 949 aa  663    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.65892  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1684  formate dehydrogenase, alpha subunit, selenocysteine-containing  53.79 
 
 		 934 aa  832    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4140  molybdopterin oxidoreductase  44.3 
 
 		 950 aa  636    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4509  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.92 
 
 		 949 aa  639    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4136  molybdopterin oxidoreductase  45.14 
 
 		 950 aa  660    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.448434  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1503  formate dehydrogenase, alpha subunit, selenocysteine-containing  53.79 
 
 		 746 aa  828    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4417  molybdopterin oxidoreductase  43.86 
 
 		 951 aa  646    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4133  molybdopterin oxidoreductase  43.28 
 
 		 951 aa  639    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.987786  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003494  formate dehydrogenase-O major subunit  44.27 
 
 		 951 aa  667    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0820  formate dehydrogenase alpha subunit  48.46 
 
 		 932 aa  759    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.380979  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0534  molydopterin dinucleotide binding domain-containing protein  100 
 
 		 796 aa  1660    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000658423  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0063  molybdopterin oxidoreductase  44.17 
 
 		 951 aa  648    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2074  molybdopterin oxidoreductase  67.23 
 
 		 749 aa  1108    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0337  molybdopterin oxidoreductase  45.4 
 
 		 949 aa  658    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0333  molybdopterin oxidoreductase  43.79 
 
 		 950 aa  637    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4110  molybdopterin oxidoreductase  44.3 
 
 		 950 aa  638    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1915  formate dehydrogenase alpha subunit  45.01 
 
 		 953 aa  686    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0401  formate dehydrogenase alpha subunit  43.96 
 
 		 964 aa  648    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.298134  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0358  formate dehydrogenase, alpha subunit (selenocysteine-containing)  68.04 
 
 		 940 aa  1113    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.721212  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02278  hypothetical protein  44.37 
 
 		 951 aa  666    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3720  formate dehydrogenase alpha subunit  45.2 
 
 		 950 aa  660    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.933728 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3724  formate dehydrogenase alpha subunit  43.53 
 
 		 950 aa  643    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3791  formate dehydrogenase alpha subunit  45.33 
 
 		 950 aa  660    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3795  formate dehydrogenase alpha subunit  43.53 
 
 		 950 aa  642    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0057  twin-arginine translocation pathway signal  43.92 
 
 		 949 aa  647    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4137  molybdopterin oxidoreductase  44.81 
 
 		 949 aa  661    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1453  formate dehydrogenase  44.37 
 
 		 951 aa  670    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4421  molybdopterin oxidoreductase  44.52 
 
 		 949 aa  664    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4106  molybdopterin oxidoreductase  45.14 
 
 		 950 aa  660    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4809  molybdopterin oxidoreductase  43.48 
 
 		 951 aa  641    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.215861 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0761  hypothetical protein  80.68 
 
 		 797 aa  1363    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.669213  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0233  molybdopterin oxidoreductase  45.14 
 
 		 950 aa  660    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00484847 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4129  molybdopterin oxidoreductase  44.29 
 
 		 957 aa  641    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1120  putative formate dehydrogenase, alpha subunit  45.01 
 
 		 951 aa  678    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4813  molybdopterin oxidoreductase  44.39 
 
 		 949 aa  655    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.517826 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3916  formate dehydrogenase alpha subunit  45.58 
 
 		 950 aa  662    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.733885 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3920  formate dehydrogenase alpha subunit  43.28 
 
 		 950 aa  638    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.922429 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1541  formate dehydrogenase  75.82 
 
 		 790 aa  1285    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0208  fumarate hydratase  55.31 
 
 		 739 aa  874    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3609  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.53 
 
 		 950 aa  641    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3613  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.69 
 
 		 949 aa  639    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.982249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3709  molybdopterin oxidoreductase  43.02 
 
 		 970 aa  627  1e-178  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4513  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.64 
 
 		 950 aa  619  1e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2791  molybdopterin oxidoreductase  41.34 
 
 		 989 aa  605  9.999999999999999e-173  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0527141  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3087  molybdopterin oxidoreductase  42.09 
 
 		 987 aa  600  1e-170  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0589388 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0937  twin-arginine translocation pathway signal  40.97 
 
 		 991 aa  601  1e-170  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1170  formate dehydrogenase large subunit precursor  41.2 
 
 		 988 aa  600  1e-170  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.970148 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1286  formate dehydrogenase alpha subunit  40.66 
 
 		 962 aa  597  1e-169  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0834  molybdopterin oxidoreductase  40.47 
 
 		 991 aa  594  1e-168  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4062  molybdopterin oxidoreductase  40.05 
 
 		 996 aa  592  1e-167  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.818132  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3464  molybdopterin oxidoreductase  40.35 
 
 		 989 aa  591  1e-167  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0682  twin-arginine translocation pathway signal  40.37 
 
 		 1012 aa  589  1e-167  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2373  formate dehydrogenase large subunit  40.17 
 
 		 999 aa  588  1e-166  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00446398 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3261  twin-arginine translocation pathway signal  40.35 
 
 		 986 aa  585  1e-166  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.303919  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5278  molybdopterin oxidoreductase  41.06 
 
 		 979 aa  586  1e-166  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.940063  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2182  molybdopterin oxidoreductase  40.92 
 
 		 1001 aa  587  1e-166  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.461283  normal  0.03262 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2586  molybdopterin oxidoreductase  40.92 
 
 		 1001 aa  585  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.537244  normal  0.227265 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3203  molybdopterin oxidoreductase  41.08 
 
 		 980 aa  582  1e-164  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.542235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3126  twin-arginine translocation pathway signal  41.26 
 
 		 983 aa  580  1e-164  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.389263  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2449  twin-arginine translocation pathway signal  40.5 
 
 		 973 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3728  molybdopterin oxidoreductase  40.4 
 
 		 994 aa  574  1.0000000000000001e-162  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262187 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0421  molybdopterin oxidoreductase  41.58 
 
 		 980 aa  571  1e-161  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.273483  normal  0.81793 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2761  twin-arginine translocation pathway signal  39.5 
 
 		 1025 aa  569  1e-161  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.297303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1398  molybdopterin oxidoreductase  40.42 
 
 		 992 aa  572  1e-161  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0389  molybdopterin oxidoreductase  41.46 
 
 		 980 aa  569  1e-161  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5491  molybdopterin oxidoreductase  40.53 
 
 		 973 aa  567  1e-160  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0457  molybdopterin oxidoreductase  40.7 
 
 		 980 aa  560  1e-158  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.134785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0504  formate dehydrogenase alpha chain  40.67 
 
 		 986 aa  538  1e-151  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2352  molybdopterin oxidoreductase  28.04 
 
 		 1111 aa  337  5.999999999999999e-91  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3238  molydopterin dinucleotide-binding region  32.11 
 
 		 687 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0973988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1813  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.22 
 
 		 688 aa  212  2e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0038  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.19 
 
 		 803 aa  202  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4119  aerobic formate dehydrogenase subunit alpha  26.19 
 
 		 1015 aa  202  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3770  formate dehydrogenase, alpha subunit, selenocysteine-containing  26.19 
 
 		 1015 aa  202  1.9999999999999998e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0084  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.06 
 
 		 803 aa  196  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0786  formate dehydrogenase alpha subunit  29.36 
 
 		 529 aa  196  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.46 
 
 		 893 aa  194  4e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1381  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.45 
 
 		 688 aa  193  9e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.21 
 
 		 685 aa  193  1e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2638  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.94 
 
 		 1059 aa  192  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.409853 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  28.92 
 
 		 745 aa  192  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.85 
 
 		 900 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1624  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.45 
 
 		 687 aa  189  1e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1561  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  30.27 
 
 		 695 aa  188  3e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0463  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  28.26 
 
 		 689 aa  188  4e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3374  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.11 
 
 		 1061 aa  186  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.94 
 
 		 879 aa  186  2.0000000000000003e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1855  molybdopterin oxidoreductase  27.93 
 
 		 527 aa  186  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0913  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.82 
 
 		 668 aa  185  3e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1575  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.21 
 
 		 842 aa  183  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.47 
 
 		 893 aa  183  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1379  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.04 
 
 		 688 aa  182  2e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.68 
 
 		 688 aa  181  4e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3894  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.7 
 
 		 1028 aa  180  9e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3810  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.85 
 
 		 1028 aa  179  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1114  formate dehydrogenase  33.33 
 
 		 811 aa  178  4e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>